Généralités Premier aperçu de Python Un peu plus loin dans Python...

Pour terminer

Présentation générale du langage de

programmation Python

Didier Villers
[email protected]

4 février 2015
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Sommaire
1 Généralités
Qu’est-ce qu’un langage de programmation ?
Compilation, ou interprétation, ou . . .
2 Premier aperçu de Python
Avantages
Les premiers pas avec Python
3 Un peu plus loin dans Python...
Autres types
Structures de base
4 Pour terminer
Exemples d’applications
Objectifs du cours
Comment atteindre ces objectifs
Où trouver l’aide, la documentation, les exemples,...
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Qu’est-ce qu’un langage de programmation ?

Rôle des langages de programmation

Décrire des instructions dans un langage compréhensible

par un être humain, mais transformable en d’autres
instructions compréhensibles par l’ordinateur (langage
machine)
Automatiser le traitement de l’information ;
Effectuer des calculs, des simulations ;
Traiter l’information en temps réel ;
Fournir un interface à l’utilisateur ;
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Qu’est-ce qu’un langage de programmation ?

Évolution des langages

L’assembleur (à partir des années 50’s)
Mnémoniques directement équivalentes aux instructions
machines, donc dépendant du processeur utilisé
Instructions de bas niveaux (appel d’une variable en
mémoire, opération arithmétique entre 2 opérandes,...)
Fortran, Cobol, Pascal, C, Basic,... (années 60s et 70s)
Indépendants de l’ordinateur utilisé
Plus proche d’un langage courant, description procédurale
Les langages à objets (années 80s et 90s)
Définition de briques logicielles indépendantes et
autonomes, réutilisables aisément
Java, C++, Python, perl, Ruby . . .sont les plus connus, +
Smalltalk, OCaml, Julia, Scala, . . .
Des langages très spécialisés, par exemple. . .
Pour pages web (PHP)
Pour bases de données (SQL)
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Compilation, ou interprétation, ou . . .

Compilation et compilateur

Etape de traduction du code source en

langage machine
Liaison éventuelle du code avec des
bibliothèques existantes de code
compilé
Exécution ultérieure du code machine
(sur un ordinateur ne disposant pas du
compilateur par exemple)
Le compilateur peut optimiser le code
(passes multiples)
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Compilation, ou interprétation, ou . . .

Interprétation et interpréteur

Traduction dynamique du code source

et exécution immédiate en répétant
sans cesse :
1 lecture et analyse d’une instruction
2 exécution de l’instruction (si elle est
valide)
Le code est souvent moins optimisé,
donc plus lent
Il est nécessaire de disposer de
l’interpréteur sur l’ordinateur
On peut créer dynamiquement du code
à interpréter pendant l’exécution
On peut éviter la phase lente de
compilation
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Compilation, ou interprétation, ou . . .

Langages intermédiaires à Bytecodes

En fait, c’est souvent un peu plus compliqué. . .

Le programme est tout de même traité en entier

Il est traduit dans un pseudo-code indépendant de
l’ordinateur
On conserve les avantages suivants :
Facilité de développement (cycle écriture-exécution rapide,
utilisation de “briques” logicielles)
Portabilité (un même programme pour des ordinateurs et
systèmes d’exploitation différents)
→ Python ! (en version 2 et/ou 3)
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Avantages

Avantages généraux

langage de haut niveau (orienté objet)

permet d’écrire des petits programmes ou suites
d’instructions (scripts)
sous licence libre, gratuit
utilisable pour la programmation occasionnelle par des
non-informaticiens
nombreuses librairies existantes (modules)
moderne et efficace pour les informaticiens
excellente lisibilité intrinsèque du code
bien documenté (aide et manuels en ligne, livres, forums,
exemples...)
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Avantages

Avantages techniques
mode interactif (console, Idle, IPython,...)
non déclaratif
typage de haut niveau, dynamique et fort
ramasse-miette intégré
interfaçable avec d’autres langages (à partir de et vers)
version de base “piles comprises”
module mathématique
accès aux fichiers et répertoires (+ formats de données
standards)
compression, archivage, gestion de bases de données
fonctions génériques du système d’exploitation
réseau et communication, protocoles internet (+email, html)
multimedia (son, image)
interface graphique (Tkinter)
outils de documentation et gestion d’erreurs (débogage)
modules spécifiques Windows, Mac, Linux,. . .
...
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Avantages

Avantages à l’apprentissage

Initiation possible via un navigateur, sans installation !

Installation aisée
1 de la version de base
2 d’une “distribution” étendue (avec des modules
complémentaires)
éditeur inclus (Idle) ou autre (SciTe,. . .)
mode interactif pour les premiers essais + version
interactive spécifique : IPython & IPython Notebook
principes de base identiques à de nombreux langages
on n’est pas obligé d’utiliser toute la puissance du langage
cycle d’écriture/essais très rapide
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Avantages

Avantages pour le scientifique, le chimiste

possible de débuter en quelques jours

alternative à des logiciels spécialisés (Matlab, Scilab,. . .)
bon pour les calculs scientifiques, le graphisme, les
simulations
modules spécialisés
représentations graphiques 2D (Matplotlib)
représentations graphiques 3D (Mayavi, Vpython, VTK,)
calculs scientifiques (numpy, scipy,. . .)
traitement d’images (PIL)
chimie (pymol, mmtk, chimera,. . .)
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Les premiers pas avec Python

Débuter et installer

Sans installer, via des sites web

Versions de base de Python en versions 2 et 3 disponibles
sur python.org !
Versions plus complètes
Exerciseurs en ligne pour l’apprentissage des bases

Références :
http://dvillers.umons.ac.be/wiki/floss:python
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Les premiers pas avec Python

Python Shell

Idle permet d’obtenir l’interpréteur de commande de Python

Essayez les commandes copyrigth, credits, license(), quit, help,

help(),...
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Les premiers pas avec Python

Utilisation du mode interactif

Mode interactif :
On peut utiliser l’environnement interactif de Python comme
une calculatrice !
par exemple :

>>> (8.314*300/24E-3)/101325
1.0256600049346163
>>>
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Les premiers pas avec Python

Notion de variable

Variables :
On peut attribuer des noms de variables, et pas seulement
pour des nombres...
Ce sera plus facile, plus clair d’utiliser des noms significatifs !

>>> R=8.314
>>> L=0.001
>>> V=24*L
>>> n=1
>>> zero=273.16
>>> T=20+zero
>>> P=n*R*T/V
>>> atm=101325
>>> print P,P/atm #(en Python 2 et print(P,P/atm) en Python 3)
101555.51000000001 1.0022749568221072
>>>
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Les premiers pas avec Python

Un peu de calcul

On peut effectuer quelques calculs sur des entiers :

>>> 1236*5698
7042728
>>> 12569+6233
18802
>>> 12+69+532+65-9
669
>>> 12356*458955
5670847980L
>>> 123*456
56088
>>> 123**456 ?? A ESSAYER ??

On peut travailler avec des très très très grands nombres...

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Les premiers pas avec Python

Divisons des nombres !

Effectuons des divisions d’entiers :

>>> 72/9
8
>>> 7/3
2
>>>

Diviser 2 entiers fournit un entier. Pensez qu’on ne peut placer

que 2 périodes de 3 jours dans une semaine...
Mais que donne -7/3 ? ?
>>> -7/3
-3
>>>
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Les premiers pas avec Python

Les nombres en virgule flottante !

>>> 7./3
2.3333333333333335
>>> 7/3.
2.3333333333333335
>>> 7./3.
2.3333333333333335
>>>

7. et 7 sont donc de deux “types” différents : “integer” et “float”

>>> type(7)
<type ’int’>
>>> type(7.)
<type ’float’>
>>>
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Les premiers pas avec Python

De nombreuses autres possibilités avec les nombres...

>>> Navogadro=6.02214199E23
>>> kboltzmann=1.3806505E-23
>>> print Navogadro*kboltzmann
8.31447334956
>>> 2**0.5
1.4142135623730951
>>> (5+2j)*(3-7j)
(29-29j)
>>> (1.+1./1E6)**1E6
2.7182804690957272
>>>

Les expressions numériques s’évaluent en respectant les

régles habituelles de priorités : parenthèses,
exponentiation, multiplication, division, addition,
soustraction (“PEMDAS”)
On peut aussi travailler facilement avec des tableaux
contenant des milliers de données !
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Les premiers pas avec Python

Un peu de logique : le type booléen !

>>> 12<16
True
>>> 12<11
False
>>> 12==12,12==13
(True, False)
>>> 12<16 or 12<11
True
>>> 12<16 and 12<11
False
>>> type(12<11)
<type ’bool’>
>>>

Les tests, comparaisons et leurs combinaisons logiques sont

utiles pour réaliser des opérations de manière conditionnelle.
(pour la logique booléenne : cf. wikipedia)
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Les premiers pas avec Python

Les chaînes de caractères

>>> a=’bonjour’ appelées aussi “string”

>>> b="bonjour"
>>> c=’Bonjour’
mots, phrases, ou texte long
>>> print a==b,a==c délimitées par ’ (apostrophe)
True False
>>> d="pâté123#" ou " (guillemet)
>>> print d la casse est significative
pâté123#
>>> é=d caractères accentués,
SyntaxError: invalid syntax
>>> long="""un
spéciaux et chiffres permis
deux CONSEIL : éviter les accents
...
dix""" dans les noms des variables
>>> print long
un
peuvent comprendre des
deux retours à la ligne (Enter) si
... délimitées par ”””
dix
>>>
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Les premiers pas avec Python

Opérations sur les chaînes

>>> s=’Mons, le 15 septembre 2009’ spécifier une

>>> s[8:] sous-chaîne
’ 15 septembre 2009’
>>> s.find(’le’) rechercher une
6 sous-chaîne
>>> s.split()
[’Mons,’, ’le’, ’15’, ’septembre’, ’2009’] découper une
>>> s.upper()
’MONS, LE 15 SEPTEMBRE 2009’
chaîne
>>> s.replace(’ ’,’_’) changer la casse
’Mons,_le_15_septembre_2009’
>>> remplacer
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Les premiers pas avec Python

Créer et sauvegarder son premier programme

Fenêtre d’édition de programme Python de Idle :

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Les premiers pas avec Python

Exécuter son premier programme

Menu Run - Run module, ou raccourci clavier F5

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Autres types

Types de haut niveau

Au delà des types de base (integer, float, string,...) on peut

avoir des types sophistiqués (containers)
listes
dictionnaires
tuples
sets
...
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Autres types

Listes

collections/séquences ordonnées d’objets (types de base

ou autres), introduits entre crochets et séparés par des
virgules
peuvent être homogènes ou hétérogènes (types identiques
ou mélangés)
on peut les compléter ou enlever des éléments
dynamiquement
indicées (numérotées) à partir de 0
utilisables comme tableaux multidimensionnels
nombreuses manipulations possibles (opérations,
méthodes) : accéder, concaténer, trier, compléter,
rechercher, réduire,...
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Autres types

Listes (bis)

>>> l1=[31, 16, ’mot’,’rouge’, 1+3j, [2, ’bleu’,3.14]]

>>> l1
[31, 16, ’mot’, ’rouge’, (1+3j), [2, ’bleu’, 3.14]]
>>> l2=[121, ’vert’, ’tomate’]
>>> l3=l1+l2
>>> l3
[31, 16, ’mot’, ’rouge’, (1+3j), [2, ’bleu’, 3.14], 121, ’vert’, ’toma
>>> len(l3)
9
>>> l3[4]
(1+3j)
>>> l3[5]
[2, ’bleu’, 3.14]
>>> l3[5][1]
’bleu’
>>> l3[2:6]
[’mot’, ’rouge’, (1+3j), [2, ’bleu’, 3.14]]
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Autres types

Listes (ter)

>>> l3[-1]
’tomate’
>>> l3.pop()
’tomate’
>>> l3
[31, 16, ’mot’, ’rouge’, (1+3j), [2, ’bleu’, 3.14], 121, ’vert’]
>>> l3.pop()
’vert’
>>> l3.pop()
121
>>> l4=l3.pop()
>>> l4
[2, ’bleu’, 3.14]
>>> l3.append(19.3)
>>> l3
[31, 16, ’mot’, ’rouge’, (1+3j), 19.3]
>>>
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Autres types

Dictionnaires

collections/ensembles non-ordonnées de paires de clés et

valeurs
Chaque clé doit être unique (ne peut pas être présente 2
fois dans un dictionnaire) et identifie la valeur
correspondante (les clés sont souvent des nombres ou
des chaînes)
Les valeurs peuvent être un objet de n’importe quel type
(de base ou autres)
Clés et valeurs sont séparées par le caractère “ :”
Les paires clés :valeurs sont séparées par des virgules et
le tout encadré par une paire d’accolades { }forme le
dictionnaire.
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Autres types

Dictionnaires (bis)

>>> densite={’eau’:1.,’fer’:7.8,’cuivre’:8.9,’or’:18.9,’platine’:21.4}
>>> densite.keys()
[’cuivre’, ’fer’, ’eau’, ’or’, ’platine’]
>>> densite
{’cuivre’: 8.9, ’fer’: 7.8, ’eau’: 1.0, ’or’: 18.9, ’platine’: 21.4}
>>> densite[’or’]
18.9
>>> densite.has_key(’glace’)
False
>>> sorted([densite.values(),densite.keys()])
[[8.9, 7.8, 1.0, 18.9, 21.4], [’cuivre’, ’fer’, ’eau’, ’or’, ’platine’
>>> import operator
>>> sorted(densite.iteritems(), reverse=True,
key=operator.itemgetter(1))
[(’platine’, 21.4), (’or’, 18.9), (’cuivre’, 8.9),
(’fer’, 7.8), (’eau’, 1.0)]
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Autres types

Tuples

Les tuples sont comme les listes, MAIS :

entourés de parenthèses au lieu de crochets
les éléments sont non-modifiables après la création
pas de méthodes sur les tuples (rechercher, enlever un
élément,...
les tuples sont plus rapides d’accès que les listes
ils peuvent être utilisés comme clés de dictionnaires
il est possible de convertir un tuple en liste et vice-versa
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Structures de base

Structure conditionnelle

Instruction d’exécution conditionnelle if...elif...else

(si...sinon-si...autrement)
Commence par if expression :
Si l’expression est vraie, le bloc d’instructions qui suit est
exécuté
Si c’est faux, elif expression : permet d’enchaîner une
seconde condition
Si aucune condition n’est vérifiée, else : permet de
déterminer les instructions à effectuer
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Structures de base

Exemple if

a=input(’Donnez une note ? ’)

if a >= 12:
print("Dispense pour 5 ans")
elif a < 10:
print("Epreuve à représenter")
else:
print("Report de session")
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Structures de base

Structures de répétition while et for

While for
Commence par while Commence par for
expression : element in sequence :
Si l’expression est vraie, Le bloc d’instructions qui
le bloc d’instructions qui suit est exécuté autant
suit est exécuté de fois qu’il y a
L’expression est à d’éléments dans la
nouveau évaluée séquence
Lorsque l’expression est Else : permet d’exécuter
(devient) fausse, le bloc un autre bloc après avoir
n’est plus exécuté considéré tous les
éléments
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Structures de base

Exemples while et for

print(’Structure while !’)

c=0
while c< 4:
print(c)
c=c+1
print(’valeur finale = ’,c)

print(’Structure for’)
a=range(11)
print(a)
for n in a:
print(n*7)
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Structures de base

Indentations des structures

L’indentation est intégrée à Python

Les retraits permettent de reconnaître et exécuter des
structures dans des structures
Efficace, léger et très favorable à une écriture compacte et
lisible des programmes
Tabulations (en fait remplacées par 4 espaces !)
Importance de la configuration correcte de l’éditeur
Si l’indentation n’est pas respectée précisément : erreur
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Structures de base

Exemples d’indentation

print(’Table de multiplication’)
a=range(11)
for i in a:
for j in a:
print(i*j,)
print(’ sont multiples de ’,i)
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Structures de base

Fonctions en Python

Permettent d’étendre le langage

Résolvent un problème délimité
Font appel elles-mêmes à d’autres fonctions
Dépendent de variables (arguments, paramètres)
Appelables autant de fois que souhaité, avec des
arguments quelconques
Renvoient (ou non) un résultat utilisable dans une
expression
Utilisent des noms de variables à portée locale
Définies par le programmeur, ou existantes dans des
“librairies modules” supplémentaires
Spécifiées ou définies avant l’utilisation
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Structures de base

Exemple de fonction

def fractions(nummol):
sum=0.
for num in nummol:
sum+=num
fract=[]
for num in nummol:
fract.append(num/sum)
return fract

n=input(’Donnez les nombres de moles des constituants (entre crochets

print(fractions(n))
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Structures de base

Utilisation de librairies de fonctions standard

>>> import math

>>> math.pi
3.1415926535897931
>>> math.cos(0)
1.0
>>> math.__dict__
{’pow’: <built-in function pow>, ’fsum’: <built-in function fsum>, ’co

A essayer : math.__doc__ et math.__name__

On peut modifier les noms des fonctions et la façon de les

stipuler (espaces de noms) par la directive import
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Structures de base

Modules, objets, classes, librairies

Python est un langage très moderne, il comprends donc des

structures très avancées
Classes (programmation objet), regroupant variables,
données et fonctions
Module : ensemble de code repris dans un seul fichier
Paquet ou Librairie : ensemble de modules avec une
arborescence en répertoires
La programmation avancée en Python comprend notamment
aussi
la gestion des erreurs
des procédures de tests
la génération de documentation sous différentes formes
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Structures de base

Notion d’algorithme

Algorithme : description des opérations à effectuer pour

résoudre un problème
Indépendant des ordinateurs
Logique et systématique
Langage courant structuré
Transposable pour différents langages de programmation
Détermine le temps d’exécution et la mémoire nécessaire
en terme de proportionnalité à la taille du problème
Exemple : la multiplication matricielle nécessite de l’ordre de
N 3 opérations (si N est la taille des matrices)
Référence : http ://fr.wikipedia.org/wiki/Algorithmique
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Exemples d’applications

Simple, avec le module standard Turtle

i=0
while i < 10:
j=0
while j <10:
up()
goto(x+i*20,y+j*20)
down()
fill(1)
n=0
while n <4 :
forward(16)
left(90)
n=n+1
color([i*0.1,j*0.1,0])
fill(0)
color(0,0,0)
j=j+1
i=i+1
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Exemples d’applications

Module XTurtle (Python 2)

cf. http ://code.google.com/p/xturtle/downloads/list/

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Exemples d’applications

Simple, avec l’interface graphique Tkinter

from tkinter import *

fen01 = Tk()
fen01.title("Lecture de deux masses")
chaine1 = Label (fen01, text = "introduisez
chaine2 = Label (fen01, text = "introduise
chaine1.grid(row =0)
chaine2.grid(row =1)
entr1= Entry(fen01)
entr2= Entry(fen01)
entr1.grid(row =0, column =1)
entr2.grid(row =1, column =1)
bou1=Button(fen01,text=’Continuer’,command=
bou1.grid(row=2,column=1)
fen01.mainloop()
m1 = float(entr1.get())
m2 = float(entr2.get())
fen01.destroy()
print(’Masses lues : ’, m1,’ et ’,m2)
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Exemples d’applications

Tkinter : animation
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Exemples d’applications

Tkinter : tkDemo, demonstration of Tk widgets

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Exemples d’applications

Graphiques simples avec matplotlib

Réf. : http ://matplotlib.sourceforge.net/

from pylab import *

def my_func(t):
s1 = cos(2*pi*t)
e1 = exp(-t)
return s1*e1

tvals = arange(0., 5., 0.05)

plot(tvals, my_func(tvals), ’bo’, tvals, my_func(tvals),
show()
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Exemples d’applications

Calculs numériques (FFT) et graphiques plus élaborés

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Exemples d’applications

pH d’un acide en fonction d’un ajout de base et d’une

dilution
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Exemples d’applications

Calculs sur des molécules

methanol - Formula = CH4O

mol wt = 32.04186 - Numb atoms = 6 - Numb bonds = 5
12.0107 6 C x= 0.956 y= -0.086 z= -0.056
15.9994 8 O x= 0.488 y= -1.374 z= 0.299
1.00794 1 H x= 0.587 y= 0.64 z= 0.672
1.00794 1 H x= 0.584 y= 0.177 z= -1.05
1.00794 1 H x= 2.049 y= -0.08 z= -0.052
1.00794 1 H x= 0.831 y= -1.996 z= -0.365
partial charges = (0.28, -0.68, 0.0, 0.0, 0.0, 0.4)
total charge = 0

Ces données ont été générées à partir de la chaîne smile ’CO’

du méthanol en utilisant des librairies Python existantes et les
programmes de chimie OpenBabel
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Objectifs du cours

Développer des capacités à programmer

L’apprentissage des rudiments de la programmation vous

permettra :
d’utiliser des petits programmes existants en les modifiant
légèrement (niveau élémentaire)
d’écrire un programme pour solutionner un problème
scientifique, en utilisant du code et des librairies existants
(niveau normal)
d’élaborer un programme original pour solutionner un
problème scientifique (niveau supérieur)
Utiliser des techniques de programmation avancées pour
solutionner un problème original (niveau excellent)
Quelque soit le niveau de la programmation, les programmes
devront respecter les règles d’écriture communément admises.
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Comment atteindre ces objectifs

Apprendre par la pratique

La pratique est la clé de l’apprentissage de tout langage ! Pour
atteindre les objectifs, vous procéderez par étape :
Reproduire quelques programmes très simples pour se
familiariser avec le cycle édition-exécution
Apprendre les bases en suivant le canevas proposé, un
manuel/tutoriel, et en effectuant des exercices
Manipuler les outils d’aide, documenter et commenter
Apprendre à rechercher et corriger les erreurs
Rechercher des exemples simples d’applications
(scientifiques, mathématiques,...)
Programmer des problèmes inédits, simples
Utiliser des sources de codes et documentations diverses :
livres, forums, sites web
Se donner un projet à réaliser, d’envergure adaptée à ses
capacités, et le réaliser
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Où trouver l’aide, la documentation, les exemples,...

Aide en ligne, sites, manuels, fichiers, forums,...

Aide sur en ligne à partir de Idle, sous windows (touche F1)

sur python.org
sur les sites officiels de librairies utilisées
...
Généralités Premier aperçu de Python Un peu plus loin dans Python... Pour terminer

Où trouver l’aide, la documentation, les exemples,...

Références

Des documents du cours, des exemples et des

applications, des réalisations d’étudiants d’années
antérieures, des suggestions de travaux sont sur la page :
http ://dvillers.umons.ac.be/wiki/teaching :progapp-
chim :start
Des références générales sur Python sont regroupées à la
page : http ://dvillers.umons.ac.be/wiki/floss :python
Se référer également à la page Moodle du cours