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Psychobiologie

Pour débuter ce cours, nous introduirons ce fait; le corps Humain est constitué de
plusieurs niveaux d’organisations, autrement dit, on peut l’observer à travers
différentes échelles.

Entre ces différents niveaux, nous pouvons observer l’apparition de nouvelles

propriétés. Il y a émergence d’un niveau à l’autre.
exemples : 2 atomes d’Hydrogène et 1 atome d’Oxygène forment une molécule
d’eau -> Ici il s’agit de l’étude de la matière, nous parlerons alors de chimie.

Lorsque nous passons de la molécule à la cellule ( apparition de la vie ) nous

parlerons alors de Biologie.

Chapitre 1 : La Chimie de la Vie

1. L’Atome

a. Numéro atomique et nombre de masse

L’atome est considéré comme le plus petit niveau de matière.

Il est constitué de 3 types de particules :

- Le proton, chargé positivement (p+) -> Constituent le noyau
- le neutron, électriquement neutre (n0) -> Constituent le noyau
- L'électron, chargé négativement (e-) -> Gravite autour du centre
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Dans un atome, il y a toujours un nombre égal de protons et d’électrons, l’atome

sera toujours électriquement neutre.

L’atome est caractérisé par :

- Son numéro atomique, nombre de protons (= nombre d’électrons )
- Son nombre de masse , nombre de protons + nombre de neutrons

Exemples : le Carbone (C) ; Numéro Atomique 6 ( p+ = e- )

Nombre de masse 12 ( p+ + n0 )

Les atomes sont aussi appelés éléments chimiques, qui sont désignés par leur
symbole chimique.
Carbone-> C Fer-> Fe
Hélium-> He Sodium-> Na
Hydrogène-> H Azote-> N

Nous pouvons compter 24 atomes dans la composition de l’être Humain.

99% de cette composition comporte seulement 4 atomes.
L’Hydrogène H 63%
L’Oxygène O 26%
Le Carbone C 9%
L’azote N 1%

Le dernier pourcentage restant est composé d’éléments minéraux (Ca, Na, K, Cl…)
et d’oligo-éléments ( I, Fe, Cu, F… ).

b. Les Ions

Il arrive qu’un atome gagne ou perde un ou plusieurs électrons, il n’est alors plus
électriquement neutre.
Il se transforme donc en un ION.
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Un atome qui perd un ou plusieurs électrons devient un ion positif ( e-<p+ )

Un atome qui gagne un ou plusieurs électrons devient un ion négatif ( e->p+ )

exemple : Sodium Na
11 protons; 11 électrons; 12 neutrons
Il perd un électron : 11 protons; 10 électrons; 12 neutrons

Il devient donc un Ion Na+

Calcium Ca
20 protons; 20 électrons; 20 neutrons
Il perd deux électrons 20 protons; 18 électrons; 20 neutrons

Il devient donc un Ion Ca2+

Un ion positif s'appellera un Cation

Un ion négatif s’appellera un Anion

2. La Molécule

a. Configuration électronique et liaisons chimiques

Une molécule est par définition formée par l’union de deux ou plusieurs atomes.

La capacité d’un atome à établir une liaison dépend de sa configuration

électronique. Autrement dit de la disposition des électrons sur les différentes
couches électroniques; qui sont ordonnées et se remplissent progressivement.

La première couche K ( la plus proche du noyau ) peut accueillir 2 électrons.

La seconde couche L peut accueillir 8 électrons.
La troisième couche M peut accueillir 8 électrons.
…

Les électrons s’étalent autour de la couche puis se regroupent par doublets.

exemples :
Lithium Li : 3 protons; 3 électrons; 4 neutrons -> 2 e- sur la couche K
1 e- sur la couche L
Sa configuration électronique sera K2L1
Sodium Na : 11 protons; 11 électrons; 12 neutrons -> 2e- sur la couche K
8e- sur la couche L
Sa configuration électronique sera K2L8M1 1e- sur la couche M
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Un électron ne se trouvant pas par pair est dit célibataire.

Les atomes possédant des électrons célibataires sont instables. Ils vont donc
chercher à s’unir avec d’autres atomes afin d'acquérir une configuration électronique
stable.

La plus grande majorité des atomes sont dits instables ( excepté les gazs rares
Hélium, Néon, Argon…).

Nous parlerons de valence pour indiquer le nombre de liaisons qu’un atome doit
établir pour devenir stable.

exemple : Hydrogène H -> 1 électron donc sa valence est égale à 1 H-

Oxygène O -> 2 électrons donc sa valence est égale à 2 -O-
Carbone C -> 4 électrons donc sa valence est égale à 4 =C=

Lorsque deux atomes se partagent des électrons il s'agit d’une liaison covalente.
C’est la liaison la plus fréquente et la plus solide.
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Il existe 2 sortes de liaisons covalentes :

Non Polarisée : Partage équitable des électrons
50% H-H 50%
Polarisée : Partage inéquitable des électrons ( en fonction de
l’électronégativité )
70% δ- Cl-H δ+ 30%

Penchons-nous maintenant sur les liaisons ioniques.

Il ne s’agira plus de partage d’électrons mais de transfert d’électrons ( qui se fera
aussi en fonction de l’électronégativité des atomes ).

b. Molécules Organiques

Les molécules organiques constituent le corps humain.

Celui-ci est constitué de :
- environ 65% de H2O ( varie en fonction de l’age et du sexe )
-> permet le transport de nombreuses substances et cellule sanguines
-> l’élimination des déchets
-> la thermorégulation ( le corps doit se trouver au alentour de 37°c )
-> les réactions chimiques ( hydrolyse… )
- 30% de molécules organiques
- 5% autres…

Les molécules organiques sont composées d’un squelette carboné sur lequel se
fixent d'autres atomes ( C, N, H, O…)

Les propriétés de la molécule organique sont liées à l’arrangement de sa chaîne

carbonée et de la nature des atomes qui viennent se fixer à la chaîne…

Linéaire Ramifiée Cyclique

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Exemple :
Oestradiol Testostérone

C-HO O=C-CH3

Nous pouvons distinguer 4 classes de molécules organiques; Les glucides, les

lipides, les protéines et les acides nucléiques ( ADN et ARN )

“Nous sommes ce que nous mangeons”

Les aliments sont composés d’eau et de macromolécules, la digestion permet la

division de ces macromolécules permettant à l’organisme de se les approprier.

b.1. Les Glucides : structure et rôle

Ils sont plus communément appelés “sucres” ou “hydrate de carbone”.

Il existe 3 classes de glucides ( selon leur taille )

- les monosaccharides ( Le glucose étant le plus abondant )

Ils sont tous les 3 composés des mêmes atomes ( C6H12O6 ) mais ont une
configuration différente.

- Les disaccharides ( union de deux monosaccharides )

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Glucose + Fructose = saccharose -> sucre en morceau

Glucose + Glucose = maltose -> bière
Glucose + Galactose = lactose -> Lait

- Les polysaccharides ( unions de plusieurs monosaccharides )

Le glycogène constitue la réserve de glucose, présent dans les muscles, le

foie… Il est composé de plusieurs centaines de glucoses.

Les glucides sont la source d’énergie la plus rapidement utilisable par

l’organisme.
Elle permet de fabriquer l’ATP ( Adénosine TriPhosphate )
Glucose->ATP

b.2. Les lipides: structure et rôle

Les lipides constituent la matière grasse du corps humain, ce sont des graisses.

On distingue 4 sortes de Lipides :

- Les acides gras ( le plus petit; CO2H-> Acide )

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Les acides gras se divisent en 2 catégories. Les acides gras saturés ( qu’on
retrouve dans le pain, la viande, le beurre…) et les acides gras insaturés ( qu’
on retrouve dans les huiles, le poisson… ), celui-ci se distingue des saturés
de part sa double liaison présente dans sa chaîne carbonée.

- Les triglycérides ( graisse du corps humain )

Ils se composent d’un assemblage de Glycérol et de 3 acides gras.

- Les phospholipide

Ils sont composés de 2 acides gras et d’un groupement phosphate.

Tous les lipides sont hydrophobes sauf les phospholipides, ils sont
amphiphiles
En milieu aquatique ils s’organisent en bicouches.
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- Les stéroïdes

Le cholestérol étant le plus abondant, il permet la création de plusieurs autres

stéroïdes comme la testostérone (stéroïde anabolisant ), le cortisol, l’estradiol,
le progesterone…

Les lipides sont une autre source importante d'énergie pour l’organisme.

Ils constituent le tissu adipeux. C’est une réserve d’énergie, une protection pour les
organes vitaux et aussi un isolant thermique.

Ils sont les constituants essentiels des membranes cellulaires.

Et interviennent dans le bon fonctionnement de l’organisme (exemple: les
hormones).

b.3. Les protéines: structure et rôle

Les protéines sont formées d’une chaîne d’acides aminés

1 groupement aminé NH2 + CHR? + un acide CO2H

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Les protéines varient selon:

- Le nombre d’acides aminés qui le constituent

- La séquence des acides aminés

- La structure tridimensionnelle ( fonction des 2 précédents )

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Les protéines ont un rôle structural, elles donnent de leur raideur permettant la
formation de kératine, collagène, actine-myosine.

Elles interviennent dans le fonctionnement de l’organisme ( hormones, enzymes,

anticorps, transporteurs…)

En cas d’urgence, elles peuvent fournir de l’énergie mais ce n’est pas leur rôle
prioritaire.
2b.4. Les acides nucléiques : structure et rôle

ADN : Acide DésoxyriboNucléique

-> constitué de nucléotides ( 3 éléments; Sucre = Désoxyribose, groupement
Phosphate, Base azotée = Adénine (A), Guanine (G), Cytosine (C), Thymine (T) )

La liaison entre 2 nucléotides s’effectue toujours entre le SUCRE du premier et LE

PHOSPHATE du suivant.

L’ADN se compose de 2 chaînes de nucléotides liées l’une à l’autre.

Des liaisons entre les bases azotées se forment afin de pouvoir lier ces 2 chaînes.

Les liaisons se font toujours de : A et T / C et G (aucun autre appariement possible

!). Les deux chaînes de nucléotides sont complémentaires.

ARN : Acide RiboNucléique

-> Constitué de nucléotides ( 3 éléments, SUCRE = Ribose, Groupement
Phosphate, Base Azotée = Adénine(A), Guanine (G), Cytosine (C), Uracile (U).

Elle ne se constitue que d’une seule chaîne de nucléotides.

LEUR RÔLE :
L’ADN est le support de l’information génétique. C’est le plan de construction de ce
que nous sommes. Elle est la “recette” pour fabriquer les protéines.

L’ARN permet de fabriquer les protéines. Ce sont les "ustensiles" permettant la

fabrication des protéines.
 Chapitre 2 : LA CELLULE

L’être Humain est un organisme pluricellulaire ( +milliards de cellules ).

Plus de 200 types cellulaires différents ( musculaires, nerveuses, sanguines,
adipeuses, cardiaques… ), chacune ayant des rôles, des tailles, des fonctions
différentes mais possèdent toutes la même structure de base.

1. Structure de la cellule animale

L’intérieur de la cellule = Milieu Intracellulaire

La Membrane Plasmique délimite le contour de la cellule et ainsi le milieu
intracellulaire et extracellulaire.
L’extérieur de la cellule = Milieu Extracellulaire
Dans le milieu Intracellulaire, on retrouve :
-Le cytoplasme ( Liquide=cytosol + Organites Cellulaires ( petits organes de la
cellule ) ). Le cytoplasme n'inclut pas le noyau.

Les Principaux Organites Cellulaires

- Les ribosomes ( petits points sur le schéma + ribosomes fixés

au réticulum )
Ils sont constitués d’une petite et une grande sous unité
formant le ribosome fonctionnel

Ils assemblent les acides aminés lors de la fabrication des protéines.

- Le réticulum endoplasmique

2 types de réticulum
endoplasmique
Granuleux ou lisse
(REG) (REL)

Le REG est qualifié de granuleux en raison des ribosomes fixés à sa surface.

Il réceptionne les protéines fabriquées par les ribosomes fixés et finalise leur
synthèse. ( coopération )

Le REL est qualifié de lisse car il n’a pas de ribosomes fixés sur celui-ci.
Il participe à la fabrication des lipides et de certains glucides. C’est aussi une
réserve de Calcium.
- L’appareil de Golgi

Il prend en charge les protéines en provenance

du REG ( étiquetage, tri, emballage )
puis les expédie vers leur destination finale

- Les mitochondries

C’est le principal site de production

d’ATP=Production d'énergie.

Respiration cellulaire :
Glucose+O²=CO²+eau+énergie ( ATP + Chaleur )