代谢组数据分析（二十八）基于广义估计方程（GEE）的方法探究代谢物与临床表型相关性

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介绍

在医学研究中，代谢组学作为一种新兴的组学技术，能够全面检测生物样本中的代谢物，为疾病的诊断、治疗和预后提供了丰富的信息。代谢物的水平变化与多种临床表型（如疾病状态、性别、年龄、生活方式等）密切相关。然而，由于代谢组学数据具有高维性、样本间相关性以及潜在的混杂因素，传统的统计方法往往难以准确地揭示代谢物与临床表型之间的复杂关系。因此，本研究采用广义估计方程（Generalized Estimating Equations, GEE）方法，对代谢组数据进行分析，以探究代谢物与临床表型的相关性。

代谢组学研究的核心目标之一是识别与特定临床表型相关的代谢物标志物。例如，在类风湿性关节炎（RA）和健康对照（HC）的研究中，通过比较两组人群的代谢物水平差异，可以发现潜在的疾病标志物。然而，代谢组学数据通常存在以下特点：样本量相对较小，但代谢物数量众多（高维性）；样本之间可能存在相关性（如来自同一家庭或同一地区）；同时，还受到多种混杂因素（如性别、年龄、BMI等）的影响。这些特点使得传统的统计分析方法（如线性回归）在处理代谢组学数据时存在局限性，因为它们通常假设样本之间相互独立，且难以同时考虑多个混杂因素。

GEE方法的引入

广义估计方程（GEE）是一种用于分析相关数据的统