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原创 HTTP 状态码

参考:

2025-07-18 11:20:34 862

原创 gdu:磁盘使用情况分析

这是一个用 go 编写的开源磁盘使用情况分析器。Gdu 的灵感来自 godu、dua、ncdu 和 df。gdu 工具是为可以使用并行处理的 SSD 驱动器创建的。与 SSD 驱动器相比,该工具还可以与性能较低的 HDD 一起使用。您还可以查看基准测试结果。还有许多其他类似的工具,您必须先使用 gdu 才能满足您的需求。

2025-07-18 11:07:26 277

原创 查看USB设备信息,重命名label

【代码】查看USB设备信息,重命名label。

2025-07-16 14:35:46 214

原创 Rust 基础大纲

版本开始支持稀疏索引:不再需要完整克隆 crates.io-index 仓库,可以加快获取包的速度。2.1 cargo 版本>= 1.68 支持稀疏索引。中国区,可能连接 crates.io 会有问题。rust 官方文档中文网站。

2025-07-16 09:43:24 291

原创 R语言安装包

【代码】R语言安装包。

2025-07-15 14:37:19 241

原创 计算DNA序列的编辑距离(Levenshtein Distance)

本文介绍了使用动态规划方法计算DNA序列编辑距离的Python实现。编辑距离(Levenshtein Distance)衡量两个字符串之间的相似度,通过插入、删除或替换操作的最小次数计算。代码构建(m+1)×(n+1)的DP矩阵,初始化边界值后,通过状态转移方程填充矩阵:当字符相同时直接继承左上角值,否则取左、上、左上最小值加1。还提供了序列反向互补、距离矩阵计算等功能模块,可用于生物信息学分析。该实现时间复杂度O(mn),空间复杂度O(mn),适用于DNA序列比对等场景。

2025-07-14 15:19:45 451

原创 Rustup 升级国内源

注:rustup 在判断是否需要更新时依赖于 toml 的 sha256,由于 toml 内容中相关链接被替换为镜像源,第一次切换到镜像源时各个 channel 会被认为需要更新。镜像站只会保留一段时间的 nightly,如果在安装时出现错误,请用 RUSTUP_DIST_SERVER= rustup …Rustup 是 Rust 官方的跨平台 Rust 安装工具。

2025-07-10 09:51:10 205

原创 vscode 调试 Rust 中 luanch.json 设置

【代码】vscode 调试 Rust 中 luanch.json 设置。

2025-07-09 15:01:33 96

原创 使用Crypto 加密文件

本文介绍了使用Python的Crypto库实现文件加密的方法,包含AES和RSA两种加密方式。AESCrypt类提供了AES加解密功能,使用EAX模式进行文件加密/解密;RSACrypt类则实现了RSA密钥生成及文件加解密,采用PKCS1_OAEP填充和AES-256加密。代码示例展示了如何生成RSA密钥对,以及如何使用会话密钥进行混合加密。两种方法都支持文件读写操作,其中AES使用固定密钥,RSA结合了非对称加密和对称加密的优点。

2025-07-08 16:49:40 192

原创 python 放大图

【代码】python 放大图。

2025-06-19 13:27:44 74

原创 plotnine基础 python调用ggplot

【代码】plotnine基础 python调用ggplot。

2025-06-19 11:57:47 110

原创 plotline 绘图 在python中使用ggplot

【代码】plotline 绘图 在python中使用ggplot。

2025-06-19 11:49:50 187

原创 Linux记录

vmstat命令,是 Virtual Meomory Statistics(虚拟内存统计)的缩写,可用来监控 CPU 使用、进程状态、内存使用、虚拟内存使用、硬盘输入/输出状态等信息[root@localhost ~] vmstat [-a] [刷新延时 刷新次数][root@localhost ~] vmstat [选项]-a 的含义是用 inact/active(活跃与否) 来取代 buff/cache 的内存输出信息。

2025-05-15 15:27:56 912

原创 python 雷达图

【代码】python 雷达图。

2025-04-25 14:08:28 181

原创 python 环状图 (pycirclize)

【代码】python 环状图 (pycirclize)

2025-04-25 13:50:45 220

原创 perf 性能瓶颈统计

script工具将上步采集的信息转换成文本。

2025-04-23 10:40:23 264

原创 多线程的 分层 进度条

【代码】多线程的 分层 进度条。

2025-04-10 17:10:10 99

原创 python实现 基因组组装算法 De Bruijn Graph

【代码】python实现 基因组组装算法 De Bruijn Graph。

2025-02-19 09:11:29 374

原创 读取str转换为时间单位

【代码】读取str转换为时间单位。

2025-02-13 10:39:53 170

原创 F1R2 和 F2R1 的定义

在双端测序中,每个 DNA 片段的两端都会被测序,生成两个读取(Reads),分别称为 Read 1 (R1) 和 Read 2 (R2)。对于链特异性文库,这两个读取不仅包含序列信息,还携带了关于原始转录本链方向的信息。含义:表示第一个读取(Forward Read 1, R1)是从正链(+ strand)测序而来,而第二个读取(Reverse Read 2, R2)是从负链(- strand)测序而来。应用场景:当构建链特异性文库时,F1R2 是指 R1 来自正链,R2 来自负链。

2025-01-15 10:17:55 565

原创 VSCode 报错:rust-analyzer requires glibc >= 2.28 in latest build

【代码】VSCode 报错:rust-analyzer requires glibc >= 2.28 in latest build。

2024-12-13 09:48:56 726

原创 python 柱状图 标签

【代码】python 柱状图 标签。

2024-12-09 15:41:00 217

原创 seq logo

2种绘制seqlogo 的方法。

2024-12-09 14:12:24 344

原创 boxplot 绘制箱线图,添加数据点

【代码】boxplot 绘制箱线图,添加数据点。

2024-10-12 15:28:23 331

原创 VS Code 配置 Rust-Analyzer 报错

最后偷梁换柱的方式成功了,用自己下载rust-analyzer 替换了VSCode 的 rust-analyzer ,成功了。是把rust-analyzer 安装上了,但设置路径这一步一直不起效果。

2024-09-10 17:44:47 821

原创 python class类中的装饰器 各种@

classmethod: 不用实例化,可以直接调用。直接使用示例进行说明演示,更为直观。

2024-08-30 13:27:47 304

原创 txt 转成 xlsx

【代码】txt 转成 xlsx。

2024-08-27 09:16:20 181

原创 probit的LOD计算

【代码】probit的LOD计算。

2024-07-03 09:26:48 411

原创 数据分析-相关性

Pearson相关系统适合正态分布、连续随机变量、线性相关程度高的情况。对于非线性相关的数据,Spearman相关系数要比Pearson相关系数更显著肯德尔秩相关系数对样本量小,有极端值的情况也更适用下图直观的体现了三种相关系数的有效性。可以看出,在相关性极为明显(极相关或极不相关)的情况下,三者效果是无差异的。而对于相关性不太明确的情况(图3),Kendall相关系数更为保守一些。相关链接:相关性分析的五种方法参考。

2024-06-19 17:06:33 1915

原创 Python 数据可视化 多色散点图

【代码】Python 数据可视化 多色散点图。

2024-06-18 16:31:45 691

原创 Python 数据可视化 散点图 计算R^2

【代码】Python 数据可视化 散点图。

2024-06-18 16:26:51 804

原创 鸟哥私房菜 摘录

在Windows里面,程序有问题时,如果可能的话先将所有其它程序保存并结束,然后尝试按救命三键 (Ctrl+Alt+Delete),将有问题的程序(不要选错了程序哦)“结束工作”,看看能不能恢复系统。别以为您还年轻,等你再弄多几年计算机了, 您将会非常庆幸您有此一习惯。学写 script 的确没设置 server 那么好玩,不过以我自己的感觉是:关键是会得“偷”, 偷了会得改,改了会得变,变则通矣。如果看在网络上看到任何好文章,可以为自己留一份copy,同时定好题目,归类存盘。(鸟哥需要注意知识产权!

2024-06-04 10:08:46 482

原创 docker 启动关闭,设置仓库地址

inux系统下 /VAR/LOG/ 各个日志文件分析: https://blog.csdn.net/Love_Naive/article/details/107472689。/etc/docker/daemon.json配置文件详解:https://www.cnblogs.com/chuyiwang/p/17577020.html。docker仓库登录及配置: https://blog.csdn.net/Ruby_One/article/details/136883834。确认是否关闭可以使用。

2024-05-31 09:22:05 979

原创 测量小代码片段的执行时间

参考官方链接:

2024-05-27 10:38:14 381

原创 ggplot2画图

【代码】ggplot2画图。

2024-05-11 10:23:00 301

原创 python 的pysam 获取 hg19.chrom.sizes 各个染色体长度

【代码】hg19.chrom.sizes 各个染色体长度。

2024-04-25 16:32:26 264

原创 Python 数据可视化 boxplot 并列箱线图

【代码】Python 数据可视化 boxplot。

2024-04-25 14:42:58 705

原创 python flask 调试 Swagger

【代码】python flask 调试。

2024-01-19 15:03:06 676

原创 生成器如何读取大文件

场景:500G 文件 特殊只有一行,特殊分割符号 {|}

2023-11-02 09:47:00 298

原创 python 2组list绘制拟合曲线、计算拟合方程 R^2

【代码】python 2组list绘制拟合曲线、计算拟合方程 R^2。

2023-10-23 17:28:17 1130

8种免疫细胞的参考基因集

8种免疫细胞的参考基因集、免疫浸润 ssGSEA

2022-12-14

XShell-ftp-7.0.0094p.zip

XShell-ftp-7.0.0094p.zip

2022-01-17

GO-KEGG练手数据

GO-KEGG练手数据

2021-04-19

hg19基因位置信息.txt

UCSC下载的基因位置信息

2021-05-12

HGVS规则-思维导图.png

对HGVS命名规则进行总结整理,绘制成思维导图

2021-05-12

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