57、机器学习主成分分析（PCA）的原理【用Python进行AI数据分析进阶教程】

一. 基本思想

PCA 是一种无监督的线性降维技术。在高维数据中，特征之间可能存在相关性，导致数据存在冗余信息。PCA 的目标是找到一组新的正交特征（主成分），这些主成分能够尽可能多地保留原始数据的方差，也就是信息。通过将数据投影到这些主成分上，可以实现数据的降维。

二. 数学原理

设原始数据矩阵为 X，其维度为 n×p，其中 n 是样本数量，p 是特征数量。PCA 的主要步骤如下：

• 数据中心化：计算每个特征的均值，然后将每个样本的对应特征值减去该特征的均值，使得数据的均值为 0。即，其中 Xˉ 是每列的均值向量。
• 计算协方差矩阵：协方差矩阵 C 描述了特征之间的相关性，计算公式为 。
• 特征值分解：对协方差矩阵 C 进行特征值分解，得到特征值 λi​ 和对应的特征向量 vi​，满足 。特征值表示主成分的方差大小，特征向量表示主成分的方向。
• 选择主成分：将特征值从大到小排序，选择前 k 个最大特征值对应的特征向量作为主成分，k 是降维后的维度。
• 数据投影：将中心化后的数据 Xcentered​ 投影到选择的主成分上，得到降维后的数据 ​，其中 Vk​ 是由前 k 个特征向量组成的矩阵。

三、关键点

• 方差最大化：PCA 选择的主成分是能够使数据投影后方差最大的方向，这样可以保留数据的主要信息。
• 正交性：主成分之间是正交的，即它们之间的相关性为 0，避免了信息的冗余。
• 降维：通过选择前 k 个主成分，可以将数据从 p 维降维到 k 维，减少计算复杂度和存储需求。

四、注意点

• 数据标准化：在进行 PCA 之前，通常需要对数据进行标准化处理，以确保所有特征具有相同的尺度。否则，尺度较大的特征可能会主导协方差矩阵的计算。
• 主成分解释：主成分是原始特征的线性组合，可能难以直接解释其物理意义。在实际应用中，需要结合具体问题进行分析。
• 维度选择：选择合适的降维维度 k 是一个关键问题。可以通过查看特征值的累计贡献率来确定 k 的值，一般选择累计贡献率达到 80% - 95% 的主成分。

五、示例及代码

下面是一个使用 Python 和 scikit-learn 库实现 PCA 的示例代码：

Python脚本

# 导入 numpy 库，用于数值计算，通常使用别名 np 方便调用
import numpy as np
# 从 sklearn 库的 datasets 模块中导入 load_iris 函数，用于加载鸢尾花数据集
from sklearn.datasets import load_iris
# 从 sklearn 库的 preprocessing 模块中导入 StandardScaler 类，用于数据标准化处理
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
# 从 sklearn 库的 decomposition 模块中导入 PCA 类，用于执行主成分分析（PCA）
from sklearn.decomposition import PCA
# 导入 matplotlib 库的 pyplot 模块，用于数据可视化，通常使用别名 plt 方便调用
import matplotlib.pyplot as plt

# 设置支持中文的字体
plt.rcParams["font.family"] = ["SimHei", "WenQuanYi Micro Hei", "Heiti TC"]

def perform_pca():
    """
    此函数用于加载鸢尾花数据集，进行标准化处理，执行 PCA 降维，并可视化结果。
    """
    try:
        # 调用 load_iris 函数加载鸢尾花数据集，将其存储在变量 iris 中
        iris = load_iris()
        # 从 iris 数据集中提取特征数据，存储在变量 X 中
        X = iris.data
        # 从 iris 数据集中提取目标标签，存储在变量 y 中
        y = iris.target

        # 创建 StandardScaler 类的实例，用于数据标准化
        scaler = StandardScaler()
        # 调用 fit_transform 方法对特征数据 X 进行标准化处理，
        # 并将结果存储在变量 X_scaled 中
        X_scaled = scaler.fit_transform(X)

        # 创建 PCA 类的实例，指定降维后的维度为 2，即保留前两个主成分
        pca = PCA(n_components=2)

        # 调用 fit_transform 方法对标准化后的数据 X_scaled 执行 PCA 降维，
        # 并将结果存储在变量 X_pca 中
        X_pca = pca.fit_transform(X_scaled)

        # 获取 PCA 降维后主成分的方差解释比例，存储在变量 explained_variance_ratio 中
        explained_variance_ratio = pca.explained_variance_ratio_
        # 打印主成分的方差解释比例，该比例反映了每个主成分所包含的原始数据信息的比例
        print("主成分的方差解释比例:", explained_variance_ratio)
        # 输出示例：主成分的方差解释比例: [0.92461872 0.05306648]
        # 这表示第一个主成分解释了约 92.46% 的数据方差，
        # 第二个主成分解释了约 5.31% 的数据方差

        # 计算主成分的累计方差解释比例，即前 k 个主成分解释的总方差比例
        cumulative_explained_variance = np.cumsum(explained_variance_ratio)
        # 打印累计方差解释比例，帮助判断保留的主成分是否足够解释原始数据
        print("累计方差解释比例:", cumulative_explained_variance)
        # 输出示例：累计方差解释比例: [0.92461872 0.9776852 ]
        # 这表示前两个主成分总共解释了约 97.77% 的数据方差

        # 创建一个新的图形窗口，设置窗口大小为 8x6 英寸
        plt.figure(figsize=(8, 6))
        # 绘制散点图，将降维后的数据 X_pca 的第一列作为 x 轴，第二列作为 y 轴，
        # 根据目标标签 y 对散点进行颜色编码，使用 'viridis' 颜色映射
        plt.scatter(X_pca[:, 0], X_pca[:, 1], c=y, cmap='viridis')
        # 设置 x 轴的标签为 '第一主成分'
        plt.xlabel('第一主成分')
        # 设置 y 轴的标签为 '第二主成分'
        plt.ylabel('第二主成分')
        # 设置图形的标题为 'PCA 降维后的鸢尾花数据集'
        plt.title('PCA 降维后的鸢尾花数据集')
        # 在图形中添加网格线，方便观察数据点的位置
        plt.grid(True)
        # 调整图形的布局，确保所有元素都能完整显示
        plt.tight_layout()
        # 显示绘制好的图形
        plt.show()

    except Exception as e:
        # 如果在执行过程中发生异常，捕获该异常并打印错误信息
        print(f"发生错误: {e}")


# 主程序入口，当脚本作为主程序运行时，调用 perform_pca 函数
if __name__ == "__main__":
    perform_pca()

输出 / 打印结果说明

• 主成分的方差解释比例：打印出每个主成分所解释的方差占总方差的比例。例如 [0.92461872 0.05306648]，这意味着第一个主成分解释了约 92.46% 的数据方差，第二个主成分解释了约 5.31% 的数据方差。
• 累计方差解释比例：打印出前 k 个主成分解释的总方差比例。例如 [0.92461872 0.9776852 ]，表示前两个主成分总共解释了约 97.77% 的数据方差，这说明通过这两个主成分可以保留原始数据的大部分信息。
• 可视化结果：会弹出一个图形窗口，显示 PCA 降维后的鸢尾花数据集的散点图，不同颜色的点代表不同类别的鸢尾花，方便观察数据在降维后的分布情况。

重点语句解读

1、数据标准化：

Python脚本

scaler = StandardScaler()
X_scaled = scaler.fit_transform(X)

• StandardScaler 是 scikit-learn 中的一个类，用于对数据进行标准化处理。fit_transform 方法首先计算每个特征的均值和标准差，然后将数据进行标准化，使得每个特征的均值为 0，标准差为 1。

2、创建 PCA 对象：

Python脚本

pca = PCA(n_components=2)

• PCA 是 scikit-learn 中的一个类，用于实现主成分分析。n_components 参数指定降维后的维度，这里设置为 2，表示将数据降维到 2 维。

3、执行 PCA 降维：

Python脚本

X_pca = pca.fit_transform(X_scaled)

• fit_transform 方法首先对标准化后的数据进行协方差矩阵的计算和特征值分解，然后将数据投影到前 2 个主成分上，得到降维后的数据。

4、打印主成分的方差解释比例：

Python脚本

print("主成分的方差解释比例:", pca.explained_variance_ratio_)

• explained_variance_ratio_ 属性返回每个主成分的方差解释比例，即每个主成分所包含的信息占总信息的比例。通过查看这个比例，可以了解每个主成分的重要性。

5、可视化降维后的数据：

Python脚本

plt.figure(figsize=(8, 6))
plt.scatter(X_pca[:, 0], X_pca[:, 1], c=y, cmap='viridis')
plt.xlabel('第一主成分')
plt.ylabel('第二主成分')
plt.title('PCA 降维后的鸢尾花数据集')
plt.show()

这段代码使用 matplotlib 库将降维后的数据可视化。scatter 函数绘制散点图，c=y 表示根据样本的类别标签进行颜色编码，cmap='viridis' 是颜色映射。通过可视化可以直观地观察到数据在降维后的分布情况。