专栏六：复习差异分析（1）-limma-芯片

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分类专栏： R语言和python单细胞空间转录组绘图代码文章标签：生物信息学 r语言学习

于 2023-04-06 11:17:50 首次发布

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本文档详细介绍了如何使用R包limma进行芯片数据分析，包括GEO2R的直接分析、数据读取、数据结构检查、是否需要进行log转换、数据齐性评估、探针ID注释转换、去重、差异分析等步骤，并强调了分组信息的一致性和PCA分析的重要性。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

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if(!requireNamespace("data.table",quietly = TRUE)) install.packages("data.table",update = F,ask = F)
if(!requireNamespace("ggrepel",quietly = TRUE)) i