专栏二十一：在单细胞分析中将R语言和Python串联

已于 2024-10-14 20:30:22 修改
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分类专栏： R语言和python单细胞空间转录组绘图代码 文章标签： r语言 python
于 2024-10-11 01:49:43 首次发布
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主要包括两大部分在R中用Python和将R中的内容导入Python进行后续分析。

应该不会有人希望在Python中用R吧

一、在R中用Python

1.reticulate包的使用

①R安装

注意，推荐在需要运行python的时候再加载本包，不然有时候会出bug，如果显示已有python环境加载，而需要更换环境，此时“Restart R"会很有帮助

# 安装reticulate包
install.packages("reticulate")
# 加载reticulate包
library(reticulate)

②Python安装

比起来R中的简易安装，Python中才是需要重视的。因为这个包是在R中用Python。

理论上有三种调用/安装方式，有三个函数分别对应

use_python() Specify the path a specific Python binary.
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