半监督的医学分割数据集(LA, Pancreas, ACDC和PROMISE12)分享

最新推荐文章于 2024-12-18 22:12:48 发布
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这篇博客分享了四个医学分割数据集：Left Atrium、ACDC、Pancreas和PROMISE12，包括数据集的详细信息和适用场景。数据集已处理为.h5格式，方便用于医学图像分割任务。还提供了百度网盘链接和提取码。

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数据集介绍

Left Atrium数据集

该数据集一共有154例包含心房颤动的 3D MRI 图像。MRI灰度分布在[0, 255]，空间分辨率为 0.625 x 0.625 x 0.625 mm³，切片尺寸因人而异，Z轴包含88个切片。分为训练集（Training Set）和测试集（Testing Set，已开源），因为测试集没有标注数据，所以一般医学分割任务只用训练集去训练已经验证，这里我提供的数据集是已经将原LA数据集处理成了.h5文件，这也是目前医学分割常用的数据加载方式。
链接: https://pan.baidu.com/s/16DGZT6l3OyahicxsK0z-QA?pwd=1234 提取码: 1234
在这里插入图片描述

ACDC数据集

ACDC (Automatic Cardiac Diagnosis Challenge) 是 MICCAI 2017 的一个挑战赛，旨在对心脏动态磁共振成像 (cine-MRI) 中的舒张期 (ED) 和收缩期 (ES) 帧进行左心室 (LV) 、右心室 (RV) 和心肌 (Myo) 分割。精确分割心脏图像对于评估心脏功能，如射血分数（EF）、每次搏动的血量（SV）、左心室质量和心肌厚度，这些进而为诊断和治疗心脏疾病提供关键信息。该数据集涵盖 150 个病例，分为 5 个子类：NOR (正常)、MINF (心肌梗死伴随收缩性心力衰竭)、DCM (扩张型心肌病)、HCM (肥厚型心肌病) 和 ARV (右室异常)，每类各 30 例。每一病例都包括一个心脏周期的 4D nifti格式图像，并且标注了舒张期 (ED) 与收缩期 (

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Pancreas-CT数据集-Attention Unet实验数据集之一
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Overviewer 包含fog、nighttime、rain和snow四种常见adverse condition，每种恶劣条件有1000张图片（训练集400/验证集100/测试集500）。BDD100k最大的问题是存在天气标签错误。许多雨天、雪天实际上可以归为overcast或者partly cloudy。 每张图片有（1）像素级别的标注；（2）相同场景下的正常图片；（3）区分确定和不确定语义内容的图像内区域的二值掩码。 训练集和验证集的GT标注已开源，可在官网下载：https://acd.
医学图像分割数据集：CT图像pancreas 2D分割数据【包含横端面、冠状面、矢状面切分的2d数据、数据增强】
09-12
医学图像分割数据集：CT图像pancreas 2D分割数据【包含横端面、冠状面、矢状面切分的2d数据、数据增强】 【其中mask中、0为背景，1为pancreas】 数据集：分别从轴位面（横端面）、冠状面、矢状面切分出2D图像。为了方便分割，这里切片的时候去除了ROI区域不足3%的数据。利用数字图像处理的方式进行了图像增强，并且全部缩放为512*512大小，图片和标签均为png格式。为了方便观察mask，提供了可视化代码（show.py） 数据集介绍：分为x、y、z轴的切面图像 x轴：images图片目录+masks模板目录，480张图片和480个对应的mask图片 y轴：images图片目录+masks模板目录，970张图片和970个对应的mask图片 z轴：images图片目录+masks模板目录，468张图片和468个对应的mask图片 分割代码：https://blog.csdn.net/qq_44886601/article/details/137345710
胰腺（pancreas）分割、CT分割、3D分割（数据格式为nii.gz的3d分割数据集）
09-12
胰腺（pancreas）分割、CT分割、3D分割（数据格式为nii.gz的3d分割数据集），共有31个训练集和标签，10个验证集和标签；胰腺（pancreas）分割、CT分割、3D分割（数据格式为nii.gz的3d分割数据集），共有31个训练集和标签，10个验证集和标签；胰腺（pancreas）分割、CT分割、3D分割（数据格式为nii.gz的3d分割数据集），共有31个训练集和标签，10个验证集和标签；胰腺（pancreas）分割、CT分割、3D分割（数据格式为nii.gz的3d分割数据集），共有31个训练集和标签，10个验证集和标签；胰腺（pancreas）分割、CT分割、3D分割（数据格式为nii.gz的3d分割数据集），共有31个训练集和标签，10个验证集和标签；胰腺（pancreas）分割、CT分割、3D分割（数据格式为nii.gz的3d分割数据集），共有31个训练集和标签，10个验证集和标签
ACDC模块简介.pdf
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comsol中关于电磁场模拟的用户操作手册和指南，可帮助用户结合自身实例进行物理场的设置，对初学者很有帮助
Promise2012_前列腺MR图像.txt
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Promise2012_前列腺MR图像数据集，里面是百度网盘永久下载链接，深度学习使用，数据太大无法上传。如果链接失效，请私信我或者加我百度云[email protected],第一时间补发。
Brats-2019数据集获取(.h5文件）
m0_73619768的博客
04-09 839
若在官网直接下载，图像和标签需要分别下载，再自行合成.h5文件，自己合成.h5文件会遇到所占内存过大问题，因此可以直接用论文模型中已经处理好的.h5文件。百度网盘为您提供文件的网络备份、同步和分享服务。空间大、速度快、安全稳固，支持教育网加速，支持手机端。注册使用百度网盘即可享受免费存储空间。百度网盘 请输入提取码。
METR-LA数据集介绍
qq_44858786的博客
12-04 9542
METR-LA（Metro Traffic Los Angeles）数据集是一个用于交通流量预测的常用数据集，主要用于研究和评估交通预测算法的性能。该数据集包含了洛杉矶地区的交通传感器数据，可以用于建立和验证交通流量预测模型。实际METR-LA数据集可能包含更多的信息和特征。METR-LA数据集的格式通常是时间序列数据，其中包含了交通传感器在不同时间点上的流量信息。在这个例子中，每一行代表一个时间点的交通流量观测，其中。这可能是输入（'x'）和输出（'y'）的时间序列数据。
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本文主要汇总了一些用于分类、定位、分割任务的医学影像数据集，并且对数据集的大小，图片格式等信息进行较为详细的介绍，并且给出了相应的下载地址。
ACTION++:改进半监督医学图像分割与自适应解剖对比度
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医学数据往往表现为长尾分布，类不平衡严重，这自然导致对少数类(即边界区域或稀有对象)的分类困难。最近的工作通过配备无监督对比标准，显着改善了长尾场景下的半监督医学图像分割。然而，在类别分布高度不平衡的标记部分数据中，它们的表现如何仍不清楚。在这项工作中，我们提出了action++，一个改进的对比学习框架，具有自适应解剖对比，用于半监督医学分割。
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09-02 1428
由于难以获取大量标记数据，半监督学习在医学图像分割中正成为一种有吸引力的解决方案。为了利用未标记数据，目前流行的半变量方法（如时态集成、均值教师）主要对未标记数据施加数据级和模型级的一致性。在本文中，我们认为除了这些策略之外，我们还可以进一步利用辅助任务和考虑任务级一致性来更好地从未标记数据中挖掘有效的表示来进行分割。
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