单细胞测序分析【1】---样本的基础处理

(1)细胞样本名字的标准化

          细胞名字要求:“样本号”   +   “-”  +  “细胞号”

例:

注:上面的是原来的名字,我们要保留subject和cell,前面的SCRNA和TEMRA不要

library(stringr)
head(colnames(d1))
Name <- colnames(d1)
Name_1 <- str_replace(Name, "SCRNA_", "")
Name_2 <- str_replace(Name_1, "TEMRA_", "")
head(Name_2)
colnames(d1) <- Name_2

注:用 str.replace将两个多余的部分去掉

(2)基因名字是ENSYMBL还是symbool

例:

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