(1)细胞样本名字的标准化
细胞名字要求:“样本号” + “-” + “细胞号”
例:
注:上面的是原来的名字,我们要保留subject和cell,前面的SCRNA和TEMRA不要
library(stringr)
head(colnames(d1))
Name <- colnames(d1)
Name_1 <- str_replace(Name, "SCRNA_", "")
Name_2 <- str_replace(Name_1, "TEMRA_", "")
head(Name_2)
colnames(d1) <- Name_2
注:用 str.replace将两个多余的部分去掉
(2)基因名字是ENSYMBL还是symbool
例: