.nii格式的图像转化numpy格式

最新推荐文章于 2025-03-20 21:41:11 发布

Lwang2018

最新推荐文章于 2025-03-20 21:41:11 发布

阅读量8.3k

点赞数 6

CC 4.0 BY-SA版权

分类专栏： Medical Image

本文链接：https://blog.csdn.net/thunder_k/article/details/86666418

Medical Image 专栏收录该内容

6 篇文章

订阅专栏

本文介绍如何使用Python的nibabel库加载和处理医学影像数据，并将其转换为Numpy数组，最后保存为.npy文件。具体步骤包括：加载img和seg文件，将数据转换为数组，然后分别保存到指定路径。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

主要使用nibabel

import nibabel as nib
import os
import numpy as np

img_path = '/home/lei/train/img/'
seg_path = '/home/lei/train/seg/'
saveimg_path = '/home/lei/train/npy_img/'
saveseg_path = '/home/lei/train/npy_seg/'

img_names = os.listdir(img_path)
seg_names = os.listdir(seg_path)


for img_name in img_names:
    print(img_name)
    img = nib.load(img_path + img_name).get_data() #载入
    img = np.array(img)
    np.save(saveimg_path + str(img_name).split('.')[0] + '.npy', img) #保存


for seg_name in seg_names:
    print(seg_name)
    seg = nib.load(seg_path + seg_name).get_data()
    seg = np.array(seg)
    np.save(saveseg_path + str(seg_name).split('.')[0] + '.npy’, seg)