怎么批量从NCBI上下载基因序列

本文介绍了一种通过NCBI的BatchEntrez工具批量下载指定AC号或GI号序列的方法。仅需三个步骤即可轻松实现大量序列数据的获取,极大地提高了工作效率。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

下载序列简单不过,无非就是联网NCBI主页,选择数据库后输入AC号或GI号后直接下载。但是如何大批量下载,而且下载的序列是指定的AC或GI的呢?实现这一目的通常办法是借助一些生物软件的检索功能,诸如:Bioedit、Geneious、MacVector等。其实,NCBI自带的Batch Entrez 只需简单三步即可轻松完成这一任务。

【准备工作】
创建一个需要下载序列AC号的列表文件,每行一个独立的AC号,保存为文本文件:

这里写图片描述

【简要流程】

1、打开网页,粘贴这个网
址:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/batchentrez?

这里写图片描述

点击“浏览”按钮,选择事先准备带AC号的文本文件后,点击“Retrieve”开始检索,数秒后即可返回检索的序列记录;

这里写图片描述

3、点击检索到的序列记录“Retrieve records for 48 UID(s)”即可,后面就是“Send to” 保存要下载的序列,后面的操作就不在赘述,详见前面一些相关教程。

这里写图片描述

评论 4
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值