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Anisworth
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cryosparc运行报错 [CUresult.CUDA_ERROR_INVALID_VALUE] Call to cuMemHostAlloc results in CUDA_ERROR_INVAL
缓存区(buff/cache)的占用 无法释放或程序无法使用,一般缓存区是动态的,根据程序需要再分配的。解决方案:加内存条;减少参数设置(如CTF相关参数,单独使用任务计算),降低计算所需内存量。报错解释:程序在运行中,调用服务器的内存时报错,无法分配内存(不是显存,也不是硬盘)在 CryoSPARC Worker 的配置文件(可以正常运行,但只是暂时的,如此确定了是这个原因。禁用 Page-Locked 内存分配。:官方推荐 cuda 11.8。重启cryosparc服务。原创 2025-03-07 16:34:08 · 525 阅读 · 0 评论 -
linux 删除文件后存储空间未释放
Linux系统下删除文件时,如果未永久删除,则会移动到回收站。快捷键:ctrl + h 显示隐藏文件。原创 2024-10-11 16:17:56 · 290 阅读 · 0 评论 -
Linux系统下,去除文件名中的回车符
v 显示修改成功的文件-n 不执行任何操作,用来测试rename过程,可查看测试效果-f 强制修改已经存在的文件perlexpr。原创 2024-03-11 16:40:53 · 697 阅读 · 0 评论 -
DELL服务器 ubuntu系统 全新硬盘识别不到问题解决及对硬盘做GPT分区
将全新的SAS硬盘(品牌:DELL)加装好在机架服务器上后,硬盘指示灯为 稳定的绿色。进入系统后输入命令```fdisk -l```查看,却始终没有发现新硬盘设备,识别不到硬盘。原创 2022-11-25 10:39:55 · 6351 阅读 · 0 评论 -
ubuntu16.04 安装Relion4.0时 编译报错:error ‘isnan‘ was not declared in this scope
在已安装成功Relion3.1.1版本的Ubuntu系统环境下,尝试升级版本为Relion4.0 beta版。按照官方教程安装时,出现编译问题,即make阶段时 报错 “/src/jaz/tomography/local_particle_refinement.cpp,error ‘isnan’ was not declared in this scope”等类似信息。一直卡在make阶段。原创 2022-08-19 17:36:58 · 757 阅读 · 0 评论 -
Linux系统下某个进程杀不掉,会自动重启
ubuntu服务器下,使用``nvidia-smi``查看GPU使用情况,发现一直存在一个未知的python程序在长期使用GPU,使用``kill``命令杀进程和关机重启都无法解决,该程序会自动重启。原创 2022-08-11 10:13:32 · 4774 阅读 · 2 评论 -
报错:mpirun has detected an attempt to run as root.
问题描述:ubuntu 16.04服务器下安装好openmpi-1.6.5后,测试 mpirun -np 4 hello_c成功;又安装了eman2(依赖conda环境),再进行测试时,未成功报错信息如下:mpirun has detected an attempt to run as root.Running as root is strongly discouraged as any mistake (e.g., in defining >TMPDIR) or bug can resul原创 2022-02-10 18:23:48 · 4351 阅读 · 0 评论