解析DrugBank数据库数据|Python

这个问题已经在之前回答过，以下是示例代码： ```python import xml.etree.ElementTree as ET import pandas as pd import numpy as np # 解析 XML 文件 tree = ET.parse('drugbank.xml') root = tree.getroot() # 提取小分子药物数据 drug_list = [] for drug in root.findall('{http://www.drugbank.ca}drug'): drug_id = drug.find('{http://www.drugbank.ca}drugbank-id').text drug_name = drug.find('{http://www.drugbank.ca}name').text drug_type = drug.find('{http://www.drugbank.ca}groups').find('{http://www.drugbank.ca}group').text drug_smiles = drug.find('{http://www.drugbank.ca}calculated-properties').find('{http://www.drugbank.ca}property'[@kind="SMILES"]).text # 将数据存储到列表中 drug_list.append([drug_id, drug_name, drug_type, drug_smiles]) # 将列表转换为 Pandas DataFrame drug_df = pd.DataFrame(drug_list, columns=['DrugBank ID', 'Drug Name', 'Drug Type', 'SMILES']) # 对数据进行清洗和分析 ... ``` 需要注意的是，提取 DrugBank 数据库中的数据需要先从其官网上下载 XML 文件，然后解析 XML 文件来提取数据。另外，在提取数据后，还需要根据具体需求对数据进行清洗和分析。