概要
基于R studio的相关性分析弦图绘制,满足一般的数据统计分析作图需求,相对更推荐Tbtols或者一些线上的云平台(微生信等)。
技术名词解释
- circlize
- RColorBrewer
- gridBase
技术细节
- 将获得的相关性矩阵转换为两两对应的数据框结构
- 绘制外周圆弧区,显示名称和刻度轴
- 据相关性大小展示连线的颜色范围
相关代码
library(ggcorrplot)
##相关性弦图
gene <- read.delim("clipboard",row.names = 1, check.names = F)
gene_cor <- cor(gene, method = 'spearman')
corr.p <- ggcorrplot::cor_pmat(ge