cmd 中使用SRA Toolkit工具下载SRA格式序列文件，显示有文件太大无法下载，如何解决？

请教Linux中使用SRA Toolkit下载sra数据失败的原因 安装SRA Toolkit完成后，使用nohup &命令进行数据的下载。 [root@localhost opt]# nohup prefetch SRR2060789 & [1] 4484 [root@localhost opt]# nohup: 忽略输入并把输出追加到"nohup.out" 开始执行任务，查看...

下载安装包后解压，开始配置环境变量（设置-系统-高级系统设置-高级-环境变量-PATH），把解压后的Sra Toolkit的bin文件夹路径添加到环境变量中。Sra Toolkit安装包，本文以Sra Toolkit3.2.1windows为例。环境变量配置完成后，用cmd测试。首先进入bin，可设置本地文件缓存（注意要空文件夹）（1）说明：参考ncbi官网给出的安装说明，总共有七步，但实际上还需手动配置环境变量。按c切换页面，按o输入路径，按s和x保存退出。但我的返回证书有问题，错误代码0x4008。

提示：文章写完后，目录可以自动生成，如何生成可参考右边的帮助文档 文章目录前言一、pandas是什么？二、使用步骤1.引入库2.读入数据总结 前言 `提示：这里可以添加本文要记录的大概内容 例如：随着人工智能的不断发展，机器学习这门技术也越来越重要，很多人都开启了学习机器学习，本文就介绍了机器学习的基础内容。 提示：以下是本篇文章正文内容，下面案例可供参考 一、pandas是什么？ 示例：pandas 是基于NumPy 的一种工具，该工具是为了解决数据分析任务而创建的。 二、使用步骤 1.引入库 代码.

对于一个做生信分析的学生，从NCBI上下载原始的测序文件是一项基本技能。 sra文件可以理解为是fastq的压缩文件。sra文件可以通过SRA Toolkit软件包下载。但是实际上，我尝试了无数次，aspera也装了，但都不能下载。 但是sra toolkit的软件包还是要装的，因为之后需要用其中的fastq-dump把sra转换成fastq文件。 获取想要的data的SRR号 发表的文章后面都是......

vim ~/.bashrc，添加 export PATH="/mnt/h/softwore/sratoolkit.3.0.7-ubuntu64/bin/:$PATH" ，保存退出后，source ~/.bashrc，激活。在SRA数据库中可以找到很多的测序数据，可以在网页中搜素，找到自己感兴趣的数据，同时在SRA中搜索数据的方式方法也有很多，大家可以自学一下，最终找到自己感兴趣的数据。在NCBI的SRA数据库中，可以找到来自各种生物种类的测序数据，包括但不限于动物、植物、微生物等。自动解压：下载完成后，

sra toolkit是ncbi上将 .sra文件转换为 .fstaq.gz文件的工具。 1.下载/调用 SRA Toolkit 可以直接在linux里在线下载，要根据自己的系统选择合适的安装版本。我查看了一下主机的linux为redhat类型，没找到这个类型的版本，又去服务器看了一下其他人的sratoolkit版本，都是centos_linux，因而选择这个版本应该是合适的。 wget htt...

目前学习了半个月左右，关于Linux系统和Python语言的一些经验和心得后期再整理，先把前两天解决的Aspera软件经验记录一下，免得时间久了忘记。 ————————————————————————————————————————————— 自己本身是做分子生物学的，所以对生物信息的知识很是匮乏，按照自己性格，从头开始学习生物信息学是啥，参考了网上“生物信息学数据库资源”的文章，里面介绍了几个重要的数据库：NCBI、EBI、UCSC等，了解以后需要分析的数据到底是啥玩意；参考“使用aspera下载.fas

SRATOOLKIT安装使用教程for_win

由于市面上的文章介绍SRA toolkit基本上都是基于Linux，而在windows下运行SRA toolkit基本上可以达到相同的效果且更为方便，故本文将分别阐明在Windows和Linux环境下SRA toolkit的安装及使用。

sratoolkit的安装与使用

应用SRA Toolkit工具下载SRA格式序列文件和转化文件格式

SRA Toolkit 工具的目的是下载NCBI未处理的SRA数据，还能将SRA文件处理成fastq文件。建议使用后台下载：（如果是服务器，后台下载不会因为连接中断而中断，除非服务器网断了）2、下载后，使用fastq-dump拆分sra数据，转变为fastq格式数据。里面(好像在SRA Toolkit里，忘记了，上次找了好久)。工具有个命令可以稳定下载数据，就是有点慢，但是稳定。对于多个数据下载：（方法多种多样，可以自己写循环）比如，如果你需要将文件输出到其他地方，加个。1、使用命令下载感兴趣的数据，

sra toolkit的安装、配置与基本功能的使用。

上次写了在linux环境下从ncbi下载sra文件，这次因为ncbi的这个网站找不到ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR 造成我在linux环境下不能使用aspera下载，只好在Windows下，下载了再上传到linux服务器。 一、工具下载 1.从ncbi下载sratoolkit工具，打开ncbi，到这个界面根据系统下载你需要的sratoolkit，我是Windows 64位，于是就是下载倒数第二个。 2.下载

一、SRA数据库 SRA（Sequence ReadArchive）数据库是用于存储二代测序的原始数据，包括 454，Illumina，SOLiD，IonTorrent，Helicos 和 CompleteGenomics。除了原始序列数据外，SRA现在也存在raw reads在参考基因的比对信息。 根据SRA数据产生的特点，将SRA数据分为四类： Studies-- 研究课题 Experiments-- 实验设计 Runs-- 测序结果集 Samples-- 样品信