pypi程序打包和解析blast文件的新工具推荐

更新时间：20240606

推荐一个可以将blast本地比对的xml文件直接解析为csv和fasta格式的工具；一个将sqlite文件直接解析为excel文件的工具

以往的pypi更新，当程序编译好之后可以直接upload，现在多了几步。此处记录下完整的过程

1）编辑自己要打包的文件

文件目录格式如下：
只创建setup.py,README.md,LICENSE和自己要打包的文件即可

2）设置setup.py

设置自己的包的名字，作者，邮箱，github这些信息，然后程序的依赖写到reqs里面

3）检查setup.py

python setup.py check

不报错即为成功。

4）pypi账户校验

最近pypi多了一个二重验证，从recover信息中，随机取一行即可！（这里挺坑）

5）创建pypirc

在pypi的账户里面，添加api token，然后将这个信息复制下来，vim ~/.pypirc，将信息粘贴进去。

6）打包上传并安装

打包：python setup.py sdist bdist_wheel
上传：twine upload dist/*
安装：pip install parserBioinfo

这个包是为了解析blast的xml文件和sqlite文件而写的，可以将blast本地解析的xml文件，直接转换为csv文件和fasta文件，也可以将sqlite的文件直接解析为excel文件。