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专题三 R语言SEM分析入门:lavaan VS piecewiseSEM
专题七 局域估计SEM -piecewiseSEM及生态学领域高阶应用
结构方程模型(Sructural Equation Model)是一种建立、估计和检验研究系统中多变量间因果关系的模型方法,它可以替代多元回归、因子分析、协方差分析等方法,利用图形化模型方式清晰展示研究系统中变量间的因果网络关系,是近年来地学、生态、进化、环境、医学、社会、经济领域中应用十分广泛的统计方法。
利用开源软件R平台,以生态学领域研究问题为主线,如生物多样性、物种分布、生物入侵、生物地理格局、生物多样性与生态系统功能(BEF)、生态恢复、气候变化对物种分布影响等,通过理论讲解和实际操作相结合的方式,由浅入深地系统介绍结构方程模型的建立、拟合、评估、筛选和结果展示的全过程,使学员能够利用结构方程模型方法解决实际研究和工作中遇到的相关科学问题。
筛选大量应用结构方程模型的经典案例,这些案例来自Nature、Ecology、Ecological Applications、Ecology Letters、Journal of Ecology、Methods in Ecology and Evolution、Oikos、Ecography等主流期刊,多数案例为近期发表成果,具有很大的参考和借鉴价值。内容包括R语言入门、结构方程模型原理介绍、结构方程模型分析入门及高阶应用、潜变量分析、复合变量分析及贝叶斯结构方程模型参数估计。利用lavaan,piecewiseSEM,blavaan及brms程序包分别从全局估计、局域估计及相应贝叶斯估计方法实现结构方程模型分析。既适合R语言和结构方程模型的初学者,也适合对结构方程模型有高阶应用需求的研究生和科研人员。
专题一 R/Rstudio简介及入门 夯实基础
①R及Rstudio介绍:背景、软件及程序包安装、基本设置等
②R语言基本操作,包括向量、矩阵、数据框及数据列表等生成和数据提取等
③R语言数据文件读取、整理(清洗)、结果存储等(含tidverse)
④R语言基础绘图(含ggplot):基本绘图、排版、发表质量绘图输出存储
专题二 结构方程模型(SEM)介绍
①SEM的定义、生态学领域应用及历史回顾
②SEM的基本结构
③SEM的估计方法
④SEM的路径规则
⑤SEM路径参数的含义
⑥SEM分析样本量及模型可识别规则
⑦SEM构建基本流程