linuxmint 20.3 利用conda安装RDkit、Jupyter notebook、Spyder

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已于 2022-03-25 10:31:18 修改 · 1.9k 阅读

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#linux #python

于 2022-03-24 15:58:11 首次发布

本文记录利用conda安装RDkit、Jupyter notebook、Spyder

软件简介

简单介绍一下，RDKt 是为了建立ADMET、生物活性等性质的预测模型而开发的化学信息python包，可以用来研究小分子化合物药物，对其结构进行操作、展示，开展分子量、化学描述符等计算

Jupyter notebook和Spyder是两种python语言开发环境，RDKit中文教程网站推荐使用Jupyter notebook，因为Jupyter notebook可以集合代码，结果和说明文档于一体，比较直观

注：安装语言开发环境一定要在你另外创建的用于工作的python环境下安装，安装到其他环境再切换回工作环境是无法使用的

安装RDkit

由于之前已经安装anaconda，所以这里直接从conda安装RDkit

打开终端，创建环境（名字可以自行更改）

conda create -c conda-forge -n rdkit2203 rdkit
#新建一个名为rdkit2203的rdkit环境

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