生信-软件
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收集并整理一些组学数据分析、更广义生信分析中所用到的软件，从安装到使用流程结合
颠倒的海德格尔-“在世界之中存在”
生信研在读，聚焦表观+3D，多组学+结构，自学编程技能+深度学习新手中，交流多多！
Note：Nothing is impossible！非一日之功也，戒骄戒躁！
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安装开源版pymol
安装开源pymol原创 2025-07-31 09:05:38 · 686 阅读 · 0 评论 -
gene id转换
gene id转换原创 2024-09-12 11:31:40 · 1990 阅读 · 0 评论 -
搭配PDB使用pymol
pymol的基本操作，其余要做的就是上手分子动力学的东西原创 2024-10-29 12:12:00 · 1730 阅读 · 0 评论 -
蛋白质晶体结构解析：软件下载-分析内容
蛋白质晶体结构解析工具，案例实操分析见下一篇博客原创 2024-12-24 16:55:38 · 3220 阅读 · 9 评论 -
pymol基础教程-2：
转载自： <http://pymol.chenzhaoqiang.com/intro/advanceManual.html#google_vignette>转载 2024-12-27 10:37:43 · 1312 阅读 · 0 评论 -
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chimerax安装+chimerax、pymol选择器语法
奇美拉以及pymol的一些尝试原创 2024-12-27 17:17:59 · 2193 阅读 · 0 评论 -
PTM翻译后修饰预测工具
蛋白质组的PTM翻译后修饰参考原创 2025-02-23 19:24:46 · 4044 阅读 · 0 评论 -
pymol高级教程-4
pymol高级教程转载 2024-12-27 10:53:36 · 955 阅读 · 2 评论 -
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用vscode写latex-2
vscode上写latex，解决引用来源问题原创 2025-01-15 17:11:06 · 334 阅读 · 0 评论 -
用vscode写latex-1
在vscode上写latex原创 2025-01-12 20:19:23 · 1111 阅读 · 0 评论 -
生信软件管家——conda vs pip
使用 conda 安装包之前，需要用search命令搜索 conda 包，找到安装对应包的命令后再进行安装，如果不能在下面的链接中找到安装方法，即表明该包不能通过 conda 安装。可以看到，在创建环境时指定 python 版本，和创建完环境后安装 python 的指定版本两者导致的结果并无不同，那为什么官方推荐在创建环境时使用 python=3.9 的方式指定 python。上面几个国内镜像源没有一个是绝对稳定的，都有可能抽风，连接不上，这时可以切换为其他国内镜像源。这时可以切换为其他国内镜像源。原创 2025-01-23 21:00:25 · 1429 阅读 · 0 评论 -
SPSS系列2—简单线性回归
SPSS系类回归分析原创 2025-04-07 16:08:49 · 1944 阅读 · 0 评论 -
SPSS系统发育分析中的聚类相关part
spss，做聚类，简单系统发生分析举例原创 2025-05-07 09:24:52 · 267 阅读 · 0 评论 -
SPSS ANOVA分析test
ANOVA，主效应与交互效应原创 2025-04-23 22:52:26 · 515 阅读 · 0 评论 -
SPSS系列1—无聊的列联表卡方检验
不带脑子的SPSS原创 2025-04-06 23:29:30 · 518 阅读 · 0 评论 -
SPSS PCA+判别分析
SPSS水一水原创 2025-04-30 20:56:33 · 584 阅读 · 0 评论 -
uniprot中PTM数据的下载
PTM的之前的一篇草稿，清理清理掉原创 2025-05-18 16:43:31 · 1077 阅读 · 0 评论 -
使用AlphaFold3预测蛋白质三维结构及PyMol可视化1
alphafold3网页端使用，10次每日原创 2024-12-17 17:47:43 · 10030 阅读 · 1 评论 -
interproscan
EMBOSS，interpro，以及uniprot中都有很多类似的REST API工具原创 2025-07-15 15:39:00 · 272 阅读 · 1 评论 -
HiC数据上游处理软件—HiC-Pro安装
HiC数据上游处理软件HiC-Pro安装原创 2024-09-09 12:00:38 · 1736 阅读 · 3 评论