DAT｜R科学与人工智能

这是一个聚焦 R语言在数据科学与智能分析中的深度应用的专栏，特别关注医药数据科研和智能科学的前沿探索。通过精心设计的教程、实用案例和技术分享，帮助你从基础入门到高阶进阶，掌握数据清理、建模、可视化及智能化应用等关键技能。

原创 3篇5章11节：绘制 Chord Diagram（弦图）和 Circos Plot（环形关系图）

文章首先阐述了关系型图表在数据分析中的重要性，并介绍了 Chord Diagram 和 Circos Plot 的起源与发展。随后通过多个示例，从基础绘制、弦线颜色与标签旋转、权重映射、分组分面、自定义调色板到翻转源目标节点，展示了 ChordPlot 的多样化功能及应用场景。本文旨在帮助读者快速掌握该函数的使用技巧，为复杂数据的可视化分析提供实用参考。

2025-08-18 09:24:12 803 1

原创 3篇5章10节：绘制箱线图和小提琴图

本文系统介绍了箱线图（BoxPlot）与小提琴图（ViolinPlot）在数据分析与科研绘图中的应用。箱线图以“五数概要”简洁概括数据分布，是探索性数据分析的重要工具；小提琴图则融合核密度估计，能展示更丰富的分布形态。

2025-08-18 08:53:29 1132

原创《人工智能大模型与智能体的应用》章节目录（持续更新）

在数字化席卷全球的今天，人工智能早已走出科幻，深度融入我们生活的每个角落。从唤醒智能音箱到获取个性化推荐，从提升工作效率到改变各行各业的运行方式，AI正以前所未有的速度成为现代生活的“必需品”。它不是取代人类，而是赋能个体，让每个人都能拥有前所未有的创造力与效率。更重要的是，如今学习和使用AI的门槛比想象中低得多，不再是程序员的专属，而是每个普通人都可以掌握的基本技能。

2025-05-25 10:02:50 416

原创《用R探索医药数据科学》目录（近期更新第3篇，专栏已超150万字）

市面上的 R 语言培训班和书籍（包括网络上的文章或视频），由于受限于培训时间或书籍篇幅，往往难以深入探讨 R 语言在数据科学或人工智能中的具体应用场景，内容泛泛而谈，最终无法真正解决实际工作中的问题。同时，它们也缺乏针对医药领域的深度结合与讨论。为了解决这些痛点，我们推出了《用 R 探索医药数据科学》专栏。该专栏将持续更新，不仅为您提供系统化的学习内容，更致力于成为您掌握最新、最全医药数据科学技术的得力助手。

2024-11-18 06:22:40 7992 35

原创利用ggplot2包，它是R语言中一个功能强大且灵活的数据可视化工具

tidyr提供了丰富的工具来改变数据的形状（即数据的pivoting）和层次结构（即嵌套和解嵌套）。

2025-08-27 09:50:50 118

原创运用tidyr包和认识tidyr中的其他函数

例如，pivot_longer() 函数能够将数据从宽型转换为长型，它其实是 gather() 的升级版，在功能和灵活性上有所增强。还有 pivot_wider() 函数，它负责将数据从长型转换为宽型，是 spread() 的升级版。

2025-08-27 09:49:47 463

原创运用tidyr包和认识tidyr中的其他函数

2025-08-26 08:57:31 558

原创运用tidyr包和认识spread()函数

tidyr是R语言中用于数据清理和重塑的重要工具，其主要目的是帮助用户创建“整洁数据”（tidy data）。在整洁数据中，每一个变量占用一列，每一条观察值占用一行，每个单元格包含一个单一的值。tidyr提供了丰富的工具来改变数据的形状（即数据的pivoting）和层次结构（即嵌套和解嵌套）。

2025-08-26 08:56:31 694

原创 3篇5章12节：降维可视化的DimPlot与FeatureDimPlot应用

本文系统介绍了 plotthis 包中的 DimPlot 和 FeatureDimPlot 函数在降维图可视化中的应用。通过示例数据 dim_example，展示了从基础分群、主题定制、高亮细胞、标签标注，到标记区域、椭圆标记、velocity 网格和流线图、Feature 高亮以及 Hexbin 热力图等多种绘图技巧。

2025-08-25 11:48:07 610

原创宽格式数据集中，每一行代表一个独特的实体（如一个病人），每一列代表不同的变量或属性。所有的变量都以列的形式展开

宽格式数据集中，每一行代表一个独特的实体（如一个病人），每一列代表不同的变量或属性。所有的变量都以列的形式展开，数据在水平方向上延展。例如，一个包含病人血压、血糖和胆固醇水平的数据集可能如下所示

2025-08-25 11:16:54 994

原创分组操作是数据分析中的常见任务。dplyr包的group_by()函数用于对数据集按照给定变量进行分组

分组操作是数据分析中的常见任务。dplyr包的group_by()函数用于对数据集按照给定变量进行分组。group_by()函数不会显式地返回切分后的数据集，而是隐式地对数据集进行切分。这种分组通常与summarise()函数结合使用，后者用于对数据进行汇总操作。

2025-08-25 11:14:51 1013

原创认识dplyrR语言的dplyr扩展包是数据处理的利器，其名称中的‘d‘代表数据框（dataframe）

R语言的dplyr扩展包是数据处理的利器，其名称中的'd'代表数据框（dataframe），'plyr'谐音为英文中的钳子（plier），寓意为数据操作工具包。dplyr以其高效、直观的数据操作功能，成为了R语言用户处理数据的首选工具之一。

2025-08-24 17:23:33 568

原创 str()函数用于紧凑地显示数据集的内部结构

str()函数用于紧凑地显示数据集的内部结构。它提供了数据集的类型、每个变量的类型和前几个值。这有助于我们快速了解数据的基本信息。

2025-08-24 17:22:01 951

原创 _all 变体函数，一次性操作所有列

_all 变体函数适用于需要对数据框中的每一列都执行相同操作的场景。例如，当需要将数据框中的所有数值型列标准化为0到1之间的值时，可以使用 mutate_all() 函数。

2025-08-23 10:07:38 566

原创使用 mutate_if() 进行条件变换

在dplyr中，_all、_at、_if这三组后缀变体函数用于扩展基础函数的功能，使得用户能够在不同场景下更加灵活地操作数据。

2025-08-23 10:06:39 706

原创数据预处理（Data Preprocessing）不仅是数据科学人员必备的技能

数据查阅作为数据预处理的首要步骤，其主要目标在于知晓数据的基本状况，涵盖了数据的规模、数据类型、缺失值以及异常值等方面。一般来说，借助数据查阅能够解答诸如数据集规模大小、包含的变量、变量的数据类型以及数据集中是否存在缺失值和异常值这类问题。

2025-08-22 10:08:21 958

原创遍历函数之apply函数、 tapply函数和mapply函数

tapply() 是 R 语言中的一个函数，用于对数据的子集应用函数并返回结果。它常用于分组数据的汇总统计。tapply() 可以按照因子或因子列表对向量进行分组，然后对每个分组应用指定的函数。以下是 tapply() 函数的一般用法：

2025-08-22 10:07:32 869

原创在R语言中，除了使用循环的方式来操作数据外，我们还可以使用更简洁和高效的遍历函数

在R语言中，除了使用循环的方式来操作数据外，我们还可以使用更简洁和高效的遍历函数。这些函数可以帮助我们对数据进行各种操作，避免了显式的循环语句，使代码更加简洁和易读。以下是几种常用的遍历函数及其应用示例。

2025-08-21 07:54:35 987

原创 switch函数根据表达式的值选择并执行相应的代码块

在数据分析和处理过程中，循环结构经常被用来执行重复任务。以下是一个使用for循环处理数据框的示例。

2025-08-21 07:53:47 989

原创 1篇1章7节：认识大语言模型的推理过程，从中间步骤到自我进化

大语言模型的“推理能力”并非单纯的人类式智能，而是通过生成中间步骤、优化解码策略及自我提升训练等方法逐步显现。推理的定义为从输入到输出的中间步骤生成，使其可度量和优化。通过思维链提示、自洽性解码及检索增强推理，模型在复杂任务中能够稳定输出正确答案，并在开放问题中展现类人启发式推理能力。本文梳理了大模型推理的发展路径和前沿技术，揭示了其能力涌现的机制，为理解和应用大模型提供了系统视角。

2025-08-20 14:13:37 517

原创矩阵运算是数据处理和分析的重要组成部分，矩阵是一种二维数据结构，由行和列组成·

矩阵运算是数据处理和分析的重要组成部分。矩阵是一种二维数据结构，由行和列组成。R语言提供了多种函数来操作和处理矩阵，使得数据分析更加便捷和高效。矩阵可以通过多种方式创建，最常见的方法是使用matrix()函数。我们可以通过指定数据、行数和列数来创建矩阵。例如，下面的代码创建了一个2x2的矩阵

2025-08-20 10:09:56 566

原创逻辑运算在编程语言中扮演着至关重要的角色，主要用于控制程序的执行流程

逻辑运算在编程语言中扮演着至关重要的角色，主要用于控制程序的执行流程。R语言中的逻辑运算主要是用于判断条件是否满足，从而执行相应的代码块。逻辑运算通常返回布尔值（TRUE或FALSE），并在条件筛选和数据清洗等过程中发挥重要作用。以下将详细介绍关系逻辑、与或逻辑以及判断逻辑。

2025-08-20 10:09:10 633

原创逻辑运算在编程语言中扮演着至关重要的角色

2025-08-19 08:51:30 980

原创逻辑运算符与算术运算符一样存在运算顺序，比如乘(*)的运算优先级比加(+)的高。可以使用括号来改变运算顺序，从而明确表达式的优先级

逻辑运算符与算术运算符一样存在运算顺序，比如乘(*)的运算优先级比加(+)的高。可以使用括号来改变运算顺序，从而明确表达式的优先级。

2025-08-19 08:50:04 528

原创 2篇1章5节：豆包悬浮球的功能解读，语音、共享与实时字幕，重新定义智能协作

本文聚焦豆包悬浮球的五大核心功能：语音通话（基础与共享屏幕模式）、共享屏幕与应用、智能会议记录、截图提问、实时双语字幕。文章解析了它们如何解决“操作繁琐、记录低效、跨语种沟通受限”等现实痛点，并揭示了豆包在交互形态上的突破。

2025-08-17 12:11:49 298

原创对数运算是幂运算的逆操作。对数运算的不同底数对计算结果有直接影响，R语言提供了多种对数函数

log() 函数用于计算以自然常数 e 为底的对数，示例中计算了 1、2 和 3 的自然对数。log2() 函数用于计算以 2 为底的对数，示例中计算了 1、2、4 和 8 的对数（底数为 2）。log10() 函数用于计算以 10 为底的对数，示例中计算了 1、10、100 和 1000 的对数（底数为 10）。log(x, base = a) 函数用于计算以任意底数 a 为底的对数，示例中计算了 1、2、4 和 8 的对数，底数设为 3 。

2025-08-17 08:21:10 779

原创在R语言中，基本的算术运算是数据分析和计算的基础

在R语言中，基本的算术运算是数据分析和计算的基础。掌握这些运算不仅是进行统计分析的前提，也是处理医学数据和进行医学研究的关键步骤。本文将详细讲解R语言中的基本算术运算，并通过医学实例进行说明，帮助大家更好地理解和应用这些运算。

2025-08-17 08:20:18 542

原创赋值运算在R语言中是一个基本而又非常重要的概念

赋值运算在R语言中是一个基本而又非常重要的概念。它是通过赋值符号将值或表达式的结果存储到变量中来实现的。在R语言中，最常用的赋值符号是“<-”和“=”，其中“<-”是R语言独有的赋值符号。使用赋值运算，我们可以将各种类型的数据（如数值、字符、向量、矩阵、数据框等）存储到变量中，以便后续使用。

2025-08-16 09:02:29 974

原创 R语言中，列表是一种非常灵活的数据结构，它可以存储不同类型的对象

R语言中，列表是一种非常灵活的数据结构，它可以存储不同类型的对象，如向量、矩阵、数据框、甚至其他列表。与数据框不同，列表中的元素可以是各种类型和长度的对象。这使得列表成为处理复杂数据和非结构化数据的强大工具。创建列表的基本函数是 list()。我们可以通过 list() 函数直接创建一个包含不同类型元素的列表。

2025-08-16 09:01:29 575

原创数组（Array）是一种重要的数据结构，它与矩阵有一定的相似性，都只能包含同一类型的数据

数组（Array）是一种重要的数据结构。它与矩阵有一定的相似性，都只能包含同一类型的数据。然而，数组有一个显著的特点，那就是其维度可以大于 2，这一点与矩阵不同。在 R 语言里，数组通过 array() 函数来创建。这个函数包含了几个关键的参数。首先是 data 参数，它代表着用于创建数组的元素。

2025-08-15 10:57:04 922

原创矩阵是一种二维数组，每个矩阵仅能包含一类数据（数值型、字符型或者逻辑型）

矩阵是一种二维数组，每个矩阵仅能包含一类数据（数值型、字符型或者逻辑型）。可以通过函数 matrix() 来构建矩阵。其中，nrow 和 ncol 参数分别用于指定行和列的维数；dimnames 参数包含了可供选择的、以字符型向量形式呈现的行名和列名；byrow 参数表示矩阵应当按行填充（TRUE）还是按列填充（FALSE），默认是按列填充。另外，list() 函数用于创建列表。

2025-08-15 10:55:56 792

原创向量是R语言中最基础的数据结构

向量是R语言中最基础的数据结构，几乎所有其他数据结构都是由向量构成的。向量可以包含数值、字符、逻辑值、复数等类型的数据。

2025-08-14 08:45:43 887

原创在数据科学和统计学中，变量是研究对象的基本要素

数值型变量，又称定量变量（Quantitative variables），是指通过定量方法测定的，具有数值大小（高低或多少）的指标。根据其取值的连续性，数值型变量可以分为连续型变量（Continuous variables）和离散型变量（Discrete variables）。

2025-08-14 08:43:48 778

原创变量（Variable）是储存数据的抽象概念

这些“容器”有大有小，有的适合装数字，有的适合装字符，还有的可以装更复杂的数据结构，就像我们日常生活中用来装不同物品的箱子、瓶子和袋子一样。数据元素（Data element）是数据的基本单位，类似于容器里的单个物品。

2025-08-13 09:41:10 275

原创运用rvest包进行数据爬虫

R语言作为统计分析的利器，拥有大量功能强大的第三方包。其中，rvest包为用户提供了简洁、方便的网页爬取工具，使用户可以快速提取网页中的文本、链接和表格等数据。

2025-08-13 09:38:58 393

原创运用rvest包进行数据爬虫

R语言作为统计分析的利器，拥有大量功能强大的第三方包。其中，rvest包为用户提供了简洁、方便的网页爬取工具，使用户可以快速提取网页中的文本、链接和表格等数据。rvest包是由Hadley Wickham开发的一个R语言网络爬虫工具，它封装了xml2和httr等核心包的功能，主要用于抓取和解析HTML网页数据。相比于Python的BeautifulSoup包，rvest在R语言环境下更加友好。

2025-08-12 17:47:13 1000

原创 R的网络爬虫，网络爬虫（Web Scraping）是一种用于自动提取网页内容的技术

网络爬虫（Web Scraping）是一种用于自动提取网页内容的技术。通过模拟浏览器行为，网络爬虫可以访问网站、读取网页源代码，并从中提取所需的信息。这种技术在数据分析、市场研究、学术研究等领域有广泛的应用，能够帮助用户从大量的网页中快速获取数据。

2025-08-12 17:46:20 978

原创 3篇5章9节：绘制高效和专业的条形图

条形图是展示类别型数据的重要图形工具，广泛应用于统计分析、市场研究和科学实验中。本文围绕R语言的函数，详细介绍了条形图的基本绘制方法及进阶应用，包括分组、堆叠、并排排列、分面展示以及透明度映射等功能。通过具体代码示例和中文注释，阐释了如何灵活运用参数实现复杂多维数据的直观呈现，帮助用户快速构建高质量条形图，提升数据可视化的效果和效率。

2025-08-11 12:17:29 986

原创 3篇5章8节：绘制基因差异表达数据的火山图

火山图是一种广泛应用于基因表达差异分析中的可视化工具，能够同时展示基因表达变化的对数倍数和显著性水平，直观揭示显著上调或下调的基因。本文介绍了火山图的基本概念及其在生物信息学中的应用，重点展示了R语言中的函数如何通过参数配置实现分面、分割、高亮和颜色映射等高级功能。通过具体代码示例，阐释了火山图的绘制流程和多维信息整合方法，助力科研人员高效解读复杂表达数据，提升数据可视化的深度与广度。

2025-08-11 10:58:49 1058

原创我们还可以对数据集按 Sepal.Length 列进行降序排序，并获取前 3 行数据

我们还可以对数据集按 Sepal.Length 列进行降序排序，并获取前 3 行数据

2025-08-10 11:09:40 1009

从药品销售与疗效数据分析例子学会R语言中的ggplot2绘图技巧

在当今医疗行业，数据驱动的决策已成为行业标准。无论是药品销售趋势分析，还是疗效评估，通过数据洞察推动业务增长和优化临床结果已成为关键。而作为数据科学家或业务分析师，掌握如何高效可视化数据，尤为重要。在文档中，我们将通过一个模拟的药品数据分析示例，帮助您深入学习如何使用R语言及其强大的绘图包ggplot2，将复杂的药品销售、疗效数据进行可视化展示。

2024-09-16

用R进行复杂用户行为数据分析：深入理解用户行为、转化率与交互模式

本代码展示了如何通过R语言对复杂的用户行为数据进行深度挖掘与分析，并结合数据可视化的方式提供了一个完整的分析流程。通过这种深入的用户行为分析，企业不仅可以掌握用户的使用习惯，还能更好地预测未来的趋势，从而在竞争中取得优势。

2024-09-15

使用R语言igraph和ggraph包绘制基因相互作用网络图

在生物信息学中，基因相互作用网络图是理解基因功能及其相互关系的重要工具。本文展示了如何使用R语言中的igraph和ggraph包来绘制和可视化基因相互作用网络图。igraph包提供了强大的图形处理功能，能够创建和操作复杂的网络结构，而ggraph包则提供了更加美观和灵活的图形布局和可视化选项。在我们的示例中，我们使用了igraph来构建一个基因相互作用的无向图，并通过设置顶点颜色、大小和标签等属性，创建了基础的网络图。随后，使用ggraph进行高级可视化，选择了Fruchterman-Reingold布局，绘制了边的宽度和顶点的颜色，同时添加了标签。ggraph的功能让图形更具美观性和可读性，便于进一步的分析和展示。通过这种方式，我们不仅能够直观地展示基因之间的关系，还能通过不同的可视化特性揭示隐藏的网络模式，为研究人员提供了有价值的工具来进行基因相互作用的深入分析。

2024-09-07

使用Shiny构建带有蓝色背景的双人五子棋游戏

该代码利用R语言和Shiny框架创建了一个交互式双人五子棋游戏。游戏界面包含一个15x15的棋盘，背景颜色设置为浅蓝色，增加了视觉吸引力。玩家可以轮流点击棋盘进行对战，黑子代表玩家1，白子代表玩家2。通过捕获用户点击事件，代码将玩家的落子位置在棋盘上呈现出来，并实时检测游戏胜负情况。当任意方向的五颗棋子连成一线时，游戏结束，胜利者会被宣布。游戏还包括一个“重置游戏”按钮，允许玩家重新开始。棋盘绘制使用plot函数，棋子通过不同颜色和形状标识。游戏逻辑包括切换玩家和检查连线获胜，简单直观，非常适合用于学习Shiny应用的基本结构和交互式游戏开发。

2024-09-06

R语言与Shiny的双人飞行棋小游戏代码：回合制胜负与实时状态显示

该R语言与Shiny应用代码实现了一个简单的双人飞行棋小游戏。游戏设计为回合制，两个玩家轮流点击“掷骰子”按钮，生成1到6的随机数，并根据骰子点数在棋盘上前进。棋盘共20格，玩家的初始位置从第1格开始，最终目标是达到第20格。每轮掷骰子后，系统会自动切换到另一名玩家，直至其中一位玩家到达终点。游戏设有“重置”按钮，允许玩家重新开始对局。在游戏过程中，应用界面会实时显示当前回合玩家、骰子点数、双方玩家的当前位置以及游戏状态。当一名玩家获胜时，游戏自动结束并显示获胜者。棋盘的图形输出使用了基本的plot函数，将玩家位置用不同颜色的圆点表示，玩家1为红色，玩家2为蓝色。此Shiny应用适合作为简单的游戏项目或学习R语言和Shiny的互动项目。

2024-09-06

使用R语言和recommenderlab包实现基于物品的协同过滤推荐系统及内容属性综合评分

在本项目中，我们使用R语言结合recommenderlab包构建了一个基于物品的协同过滤（Item-Based Collaborative Filtering, IBCF）推荐系统，针对1000个用户和1000个内容生成推荐。为了更好地分析内容，项目还随机生成了包括点赞、关注、完成率、点击率等在内的多个内容属性。我们创建了一个简单的加权评分模型，结合这些属性，计算每个内容的综合得分。通过ggplot2可视化工具，绘制了用户-内容交互的热力图和内容的综合评分条形图。该项目的特点是结合了用户评分数据和内容属性，提供了更丰富的推荐依据，同时展示了数据可视化的重要性。IBCF算法的应用使得推荐内容基于物品之间的相似性，更适合内容量较大、用户偏好复杂的场景。

2024-09-05

使用R语言和recommenderlab包构建基于用户协同过滤的自媒体内容推荐系统，结合多属性分析

在代码中，我们使用R语言和recommenderlab包构建了一个基于用户协同过滤的推荐系统，旨在为自媒体平台上的用户推荐内容。此系统通过分析用户对不同内容的评分数据，结合内容的多维度属性（包括点赞数、完成率、点击率等），生成更精准的推荐结果。通过引入诸如点赞、关注、完成率、点击率等10个属性，我们为每个内容创建了一个综合评分模型，进一步提升了推荐的准确性和个性化。使用了基于用户的协同过滤算法（UBCF），它通过分析用户与其他相似用户的兴趣重叠，预测用户可能喜欢的内容。整个流程包括数据的生成与准备、推荐模型的训练、内容的多维属性分析，以及数据的可视化呈现。我们使用ggplot2绘制了用户-内容的交互热力图以及内容的综合评分图，为用户推荐的效果提供了清晰的直观展示。此系统可以轻松扩展，应用于大规模数据集和复杂场景中，使其在自媒体推荐、用户个性化推荐等领域具有广泛的应用前景。

2024-09-05

使用R语言和randomForest包构建血糖预测模型

本代码演示了如何使用R语言及randomForest包构建血糖预测模型。首先，生成了一个包含1000条记录的模拟数据集，包括年龄、体重、血压和血糖水平等特征。通过rnorm函数创建数据，并将血糖水平分为“Normal”和“High”。接着，对数据进行预处理，处理缺失值并将目标变量转换为因子。将数据集划分为训练集和测试集，并使用randomForest构建模型，设置了500棵树（ntree参数）和每次分裂时考虑的变量数为3（mtry参数）。模型训练后，在测试集上评估其性能，计算混淆矩阵以了解预测准确性。同时，通过ggplot2绘制实际值与预测值的比较图，并使用varImpPlot展示特征重要性。最后，将模型保存为RData文件，便于后续使用。

2024-09-04

使用R语言和xgboost包构建血糖预测模型

本代码演示了如何使用R语言及xgboost包构建血糖预测模型。我们首先生成了一个包含1000条记录的模拟数据集，数据包括年龄、体重、血压和血糖水平等特征，并将血糖水平分为“Normal”（正常）和“High”（高）。接下来，对数据进行预处理，处理缺失值并将目标变量转换为因子。数据集被分为训练集和测试集，并使用xgboost包构建模型。我们设置了模型参数，如树的最大深度和学习率，以优化模型性能。模型训练后，我们在测试集上进行评估，计算混淆矩阵来衡量预测准确性。同时，使用xgboost的xgb.importance函数绘制特征重要性图，了解哪些特征对模型预测影响最大。最后，将训练好的模型保存为RData文件，以便于后续使用和分析。

2024-09-04

使用R语言和glmnet包构建血糖预测模型

本代码展示了如何使用R语言及glmnet包构建血糖预测模型。我们首先生成了一个包含1000条记录的模拟数据集，包括年龄、体重、血压和血糖水平等特征，并将血糖水平分为“Normal”（正常）和“High”（高）。接着，我们对数据进行预处理，包括处理缺失值和将目标变量转换为因子。数据集被划分为训练集和测试集，并使用glmnet包构建逻辑回归模型。glmnet包提供了Lasso回归（L1正则化）和Ridge回归（L2正则化）功能，我们选择了Lasso回归进行特征选择和模型训练。训练后，我们在测试集上评估模型性能，计算混淆矩阵，并使用glmnet的coef函数查看重要特征。最后，将训练好的模型保存为RData文件，以便于后续使用和分析。

2024-09-04

使用R语言实现CLARA算法对鸢尾花数据集进行大规模聚类分析

CLARA（Clustering Large Applications）是一个高效的聚类算法，专为处理大规模数据集而设计。它基于PAM（Partitioning Around Medoids）算法，通过抽样方法提高了计算效率，使得在数据量巨大的情况下也能快速进行聚类分析。本示例展示了如何使用R语言中的CLARA算法对标准化的鸢尾花数据集（Iris dataset）进行聚类分析。 CLARA算法的核心在于其对数据集的抽样策略。不同于传统的PAM算法，CLARA通过对原始数据集进行多次随机抽样来生成多个子集，并在这些子集上运行PAM算法来识别簇的中心。这样做的好处是显著减少了计算量，特别适合处理大规模数据集。在实际操作中，CLARA算法会运行多次抽样，每次抽样中，算法会选择一个样本子集进行聚类，并通过多次计算确定最终的簇中心。在这个示例中，我们使用R语言的cluster包中的clara函数对标准化的鸢尾花数据进行聚类分析。选择了3个簇作为预期的簇数，因为鸢尾花数据集的实际品种数量为3。CLARA的抽样次数设置为50次，这样可以在大多数情况下提供可靠的聚类结果。......

2024-09-03

使用R语言的SOM算法对鸢尾花数据集进行自组织映射分析

在数据科学中，Self-Organizing Maps (SOM) 是一种无监督学习算法，通过自组织神经网络对数据进行聚类和降维。这种算法特别适合处理高维数据，能够将复杂的数据结构映射到低维空间，以便更容易地进行分析和可视化。首先，我们加载kohonen包，这是R语言中实现SOM算法的主要工具。如果系统中尚未安装该包，我们需要先进行安装。随后，我们使用鸢尾花数据集，这是一种经典的多特征数据集，其中包含150个样本，每个样本有4个特征（花萼长度、花萼宽度、花瓣长度和花瓣宽度），以及一个目标变量（花的品种）。为了提高聚类效果，我们首先对这些特征进行标准化处理，将数据转换为均值为0，方差为1的标准正态分布。在设置SOM模型时，我们指定了一个5x5的六边形网格。这个网格的选择影响了SOM模型的表现，因为它决定了数据映射的细节。.......

2024-09-03

使用R语言中的Fuzzy C-Means算法对iris数据集进行模糊聚类分析

在这项分析中，我们使用R语言对经典的iris数据集进行了模糊聚类分析，采用了Fuzzy C-Means（FCM）算法。Fuzzy C-Means是一种改进的聚类算法，允许每个数据点以不同的隶属度（概率）属于多个簇，而不仅仅是硬性分配到单个簇。这种方法特别适用于数据点之间界限不清晰的情况，通过计算每个数据点到各个簇中心的距离来确定其隶属度，从而生成更灵活的聚类结果。在该分析中，我们首先从iris数据集中提取了四个数值变量——花萼长度、花萼宽度、花瓣长度和花瓣宽度。接着，我们加载了R中的cluster包，并使用其中的fanny函数执行Fuzzy C-Means聚类。我们设定了聚类数为3，这是因为iris数据集中的物种数为3个，虽然我们事先知道这些类别，但我们通过算法进行盲分类，以便验证其效果。 fanny函数的一个重要特点是其模糊指数参数（memb.exp），该参数决定了隶属度的模糊性。设置为较高的数值会使聚类结果更加模糊，即数据点可能较均匀地分布在多个簇中；而较低的数值则使得聚类结果更接近传统的硬聚类。

2024-09-03

在R中用谱聚类算法，基于图论的高效数据分组与分析

谱聚类（Spectral Clustering）是一种基于图论的先进聚类方法，它通过构造数据的相似度矩阵并进行谱分解，来实现数据的分组。与传统的聚类算法（如K-means）不同，谱聚类不依赖于数据的几何形状或线性可分性，因此在处理具有复杂结构的数据时尤其有效。谱聚类主要用于发现数据中的复杂模式，特别适合于那些簇的形状不规则或边界模糊的数据集。算法原理：谱聚类的核心思想是利用图论中的谱分解技术来进行数据的聚类。其基本步骤包括：构建相似度矩阵：首先计算数据点之间的相似度，常用的方法包括RBF核（径向基函数）等。相似度矩阵反映了数据点间的距离或相似度。计算拉普拉斯矩阵：通过相似度矩阵构造图的拉普拉斯矩阵。拉普拉斯矩阵是一个重要的图论概念，用于捕捉图的结构信息。谱分解：对拉普拉斯矩阵进行谱分解，得到其特征值和特征向量。选择前k个特征向量，形成新的特征空间。应用K-means：在新的特征空间中使用K-means或其他聚类方法进行最终的分组。优势：谱聚类的主要优势在于其能够处理具有复杂结构的数据。

2024-09-03

在R中使用PCA降维与K-means聚类结合的算法，高效的数据分类与可视化

主成分分析（Principal Component Analysis, PCA）结合K-means聚类是一种强大的数据分析技术组合，广泛应用于数据降维和聚类任务。PCA用于降维，K-means则用于对降维后的数据进行聚类，从而实现高效的数据分类和可视化。 PCA的作用： PCA是一种统计技术，用于将高维数据转换为较低维的数据，同时保留数据的主要信息。通过计算数据的主成分，PCA能够将数据的维度减少到几个主成分，这些主成分解释了数据的最大方差。降维不仅能简化数据处理的复杂性，还能提高计算效率，尤其是在数据维度非常高时。PCA特别适合于特征选择和数据预处理阶段，能够帮助去除冗余的特征和噪声。 K-means的应用：在进行PCA降维后，我们可以将降维后的数据应用于K-means聚类算法。K-means是一种常用的聚类算法，通过将数据点分配到K个聚类中心来实现数据分组。该算法通过迭代优化聚类中心的位置，使得每个数据点到其所属聚类中心的距离最小。K-means算法的优势在于其简单性和高效性，但它对初始聚类中心的选择敏感，并且需要预先指定聚类数量K。

2024-09-03

在R中使用高斯混合模型，多分布下的概率聚类与模型评估

高斯混合模型（Gaussian Mixture Model, GMM）是一种基于概率论的高级聚类算法，广泛应用于数据科学和机器学习领域。与传统的K-means聚类不同，GMM假设数据点是由多个高斯分布（正态分布）组成的混合模型生成的。这意味着每个数据点属于某个特定的高斯分布，但并不限定于某一个聚类，这使得GMM能够处理更复杂的数据分布情况。 GMM通过期望最大化（EM）算法进行参数估计。EM算法是一种迭代方法，它通过最大化似然函数来估计每个高斯分布的参数，包括均值、协方差矩阵和权重。与K-means的硬聚类不同，GMM提供的是软聚类，这意味着每个数据点属于不同聚类的概率可以计算出来，这种方法更加灵活和精确。 GMM的一个显著优势是它能自动确定最佳的聚类数量。通过使用贝叶斯信息准则（BIC）或赤池信息准则（AIC），GMM可以评估不同模型的优劣，选择最适合数据的模型。这种自动化的模型选择能力使GMM在处理真实世界数据时表现出色，特别是在数据分布复杂且难以预定义聚类数量的情况下。此外，GMM还可以处理数据的异方差性（即不同聚类的方差不同）和共线性（即多个变量之间存在强烈的相关性），

2024-09-03

在R中使用层次聚类算法，探索数据层次关系的高级聚类方法

层次聚类算法（Hierarchical Clustering）是一种先进的聚类方法，通过构建层次结构将数据样本按照相似度进行分组。与常见的K-means聚类不同，层次聚类不需要预先指定聚类数量，而是通过计算样本之间的距离，逐步将最相似的样本或样本组合并，形成一个树状图（dendrogram）。这个树状图展示了数据样本从个体到群体的层次关系，使得数据分析更加直观。层次聚类的过程包括两种主要方法：自底向上（agglomerative）和自顶向下（divisive）。自底向上方法从每个样本开始，逐步合并最近邻的样本或聚类，直到所有样本形成一个大聚类；而自顶向下方法则相反，从整体开始逐步拆分，直至每个样本成为独立的聚类。常用的距离计算方法包括欧氏距离、曼哈顿距离等，而合并策略则包括单链法、完全链法和平均链法。层次聚类的最大优势在于它的可解释性和灵活性。通过树状图，分析人员可以直观地看到聚类过程中的合并顺序和相似度水平，进而理解数据中的层次结构。此外，层次聚类适用于各种类型的数据，尤其是无法预先确定聚类数量的情况。

2024-09-03

在R中使用DBSCAN，一种密度驱动的高级聚类算法，识别噪声与复杂形状

DBSCAN（Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise）是一种基于密度的聚类算法，特别适合于处理含有噪声和具有不规则形状的数据集。传统的聚类方法，如K-means和层次聚类，通常要求用户预先指定聚类的数量，并且对簇的形状有一定的假设。然而，DBSCAN通过直接定义数据点的密度分布，实现了对复杂数据结构的自动化分类，不需要预设聚类数量，并且能够有效处理噪声点。 DBSCAN的核心思想是基于密度的区域来定义聚类。算法通过两个主要参数来确定密度：eps（邻域半径）和minPts（最小邻居数量）。当一个数据点的邻域内存在至少minPts个点时，该点被认为是一个核心点，进而形成一个聚类。所有邻域内的点会被包含在聚类中，直到所有点都被遍历完毕。DBSCAN的优势在于它能够识别并处理异常点（噪声点），这些点不属于任何聚类，被标记为-1，有效减少了聚类结果的偏差。相比于其他聚类算法，DBSCAN具有几个显著的优点。首先，它不需要用户预先指定聚类的数量，避免了可能的主观性和误判。其次，它能够有效处理具有不同密度的聚类，并

2024-09-03

模拟家庭收入、区域、年龄、血压及多属性的大规模数据集生成的R代码和一份10000人数据集，可以用于学习机器学习

本R代码示例展示了如何生成一个包含一万条记录的模拟数据集，该数据集包括多种社会经济和健康相关的属性。此数据集的生成旨在为研究人员、数据科学家和学生提供一个多属性的数据样本，以用于统计分析、机器学习建模或其他数据科学任务。在此代码中，我们通过设置随机种子(set.seed)来确保生成的数据是可重复的。样本数量(n)被设定为10000，生成的数据集包含以下属性： Income（家庭收入）：家庭收入随机分布在3万到15万美元之间，模拟不同收入水平的家庭。 Region（区域）：包含四个区域（东部、西部、南部、北部），用于表示家庭所处的地理位置。 Age（年龄）：年龄范围设置在18到80岁之间，模拟成年人口的年龄分布。 Systolic_BP（收缩压）和Diastolic_BP（舒张压）：这两个属性模拟个人的血压水平，范围分别为90到180 mmHg和60到120 mmHg，常用于心血管健康分析。 Gender（性别）：模拟人口中的性别分布，仅包含“Male”（男性）和“Female”（女性）两个类别。 ....... 自行查看代码

2024-09-01

理解K-means聚类算法：基于R语言对iris数据集的详细实现与分析，R代码

K-means聚类算法是一种常用的无监督学习算法，用于将数据分为不同的簇或组，使得每个簇内的数据点之间的相似性最大化，而簇与簇之间的差异性则最小化。本文将通过R语言中的kmeans()函数，结合经典的iris数据集，详细讲解K-means聚类算法的应用过程，并对其输出结果进行可视化与分析。在本文的代码示例中，我们首先对iris数据集进行预处理，只保留数值型数据。通过设定随机种子，我们确保了每次运行K-means算法时结果的一致性。接着，我们利用kmeans()函数对数据进行聚类操作，设定了聚类中心数、最大迭代次数以及多次运行以获得最优结果等参数。这些参数的选择和设置对于聚类结果的准确性至关重要。之后，我们将聚类结果与原始物种分类进行对比，评估K-means算法的效果。为更直观地展示聚类结果，本文还利用了R中的ggplot2包，通过散点图形式对聚类结果进行了可视化。通过本文，读者不仅可以掌握K-means聚类算法的基本概念和实现步骤，还能理解如何通过调整算法参数来优化聚类效果。

2024-09-01

trekcolors R 包为科幻迷和数据分析爱好者提供了独特的 Star Trek 和 LCARS 调色板

在数据可视化中，调色板的选择是提升图表美感和易读性的重要因素。trekcolors R 包为科幻迷和数据分析爱好者提供了独特的 Star Trek 和 LCARS（Star Trek 系列中计算机界面的设计语言）主题调色板。这些调色板结合了科幻设计的审美与现代数据可视化需求，为数据图表赋予独特的风格。本文展示了如何使用 trekcolors 提供的调色板与 ggplot2 图形系统集成，创建生动且富有主题性的图表。代码通过多种调色板的实例应用，包括 Starfleet、LCARS 2357、Klingon 等，生成了散点图和密度图等不同类型的图表。

2024-11-17

R语言数据去重与匹配：20种常用函数详解及实战示例

数据清洗是数据分析的核心环节，而数据去重与匹配是清洗过程中最常见的需求。本文结合实际案例，深入介绍了R语言中20种常用的去重与匹配操作，涵盖从简单的行去重、特定列去重，到复杂的数据框合并与多列匹配。同时，针对数据缺失值处理、多数据框批量匹配等问题，提供了高效的解决方案。

2024-11-16

10个例子，学会使用管道操作符 %>% 进行数据处理与可视化

在 R 语言中，管道操作符 %>% 是数据科学中非常常用的工具，特别是在使用 dplyr 和 tidyr 包进行数据处理时。管道操作符的出现，使得数据操作的流程更加简洁且易读。它的核心作用是将一个对象传递给后续函数，而无需使用嵌套或多次赋值。管道操作符的工作原理是将左侧的对象作为输入，传递给右侧的函数，并返回结果。这样可以将多个操作串联在一起，避免了传统代码中多重嵌套函数的复杂性，从而提升了代码的可读性与效率。

2024-11-11

在R语言中实现带有边缘直方图、箱线图和密度图的散点图，以及连续变量直方图的多图展示

R语言中的ggplot2包以其强大的可视化功能广受欢迎，而ggExtra包则增强了ggplot2的边缘图绘制能力。本文将详细介绍如何在R中使用这两个包，通过在散点图上加入边缘直方图和箱线图来展示变量分布，并同时绘制不同的直方图。我们首先会创建一个基础的散点图，其中每个点表示不同车型的城市燃油效率与高速燃油效率。通过ggMarginal函数，我们能够轻松地在该散点图的边缘添加直方图、箱线图或密度图，从而展示这两个变量的分布情况。除了展示边缘图外，本文还会展示连续变量的不同直方图绘制方法，以帮助用户更好地理解R中绘制直方图的两种方式：通过设置分箱宽度和固定分箱数量。以下代码示例展示了如何实现上述可视化，并附有详细的中文注释，帮助初学者理解代码的每一步含义。在运行代码之前，请确保已安装并加载ggplot2、ggExtra和gridExtra包。最终的代码通过grid.arrange()将所有图表布局在同一页面上，形成2x2的网格排列，使用户能够一目了然地查看多种图表形式。这种布局对于展示数据的不同特征非常实用，尤其适用于数据报告和探索性数据分析。

2024-11-09

R语言数据重塑，20种高效函数操作数据格式与管理

本代码示例提供了 20 种常用的 R 语言数据重塑和处理函数，涵盖了从长宽格式转换、列操作到数据汇总的广泛数据管理需求。这些函数来自 R 的核心包及 dplyr、tidyr、reshape2 和 data.table 等常用数据操作包，是数据科学和统计分析工作中必不可少的工具。

2024-11-02

R语言字符串操作全攻略，30个技巧一览无余！

大家好，相信各位都知道，在数据分析和处理过程中，字符串操作是一个重要的环节。在R语言中，字符串处理技巧为我们提供了丰富的工具，这是其它语言难以媲美的，善用R语言可以使得数据清洗和特征工程变得更加高效。本文将介绍30种常用的字符串处理方法，帮助大家更加灵活地操作字符串数据。

2024-10-28

一次性掌握7种强大的临床预测模型

随着数据科学和机器学习的迅速发展，越来越多的研究者和从业人员开始使用机器学习算法来解决各类问题。R语言以其丰富的包和强大的统计分析能力，成为了机器学习应用中的热门选择。本示例展示了七种常用的机器学习算法，包括逻辑回归、Lasso回归、支持向量机、随机森林、XGBoost、神经网络和k近邻。每种算法都使用独立生成的数据集进行模型训练，方便用户理解每种算法的基本用法及其适用场景。

2024-10-27

掌握20个R语言数据清洗技巧，让数据处理更加高效和简单！

数据清洗是数据分析和机器学习的第一步，也是影响最终模型质量的重要环节之一。无论是从事数据科学、数据分析，还是机器学习项目，在R语言中掌握一套高效的数据清洗技巧，能够快速处理、整理并优化数据，为后续建模打下坚实基础。这篇代码示例展示了20种常见且实用的数据清洗操作，每种操作对应一个独立的数据清洗技巧，并附有详细的中文注释，帮助读者理解每个操作的细节及应用场景。这些技巧包括去除缺失值、填充空值、删除重复行、转换数据类型、合并数据框、更改列名、因子水平修改、字符串处理、日期格式转换等，涵盖了大多数数据分析中的基本需求。例如，使用na.omit函数快速删除缺失值行，使用merge函数将多个数据框合并，使用scale函数实现数据标准化。对于字符串的处理，还包括去除空白、字符串拆分、子字符串提取等操作，灵活运用于不同的数据预处理需求。每一个技巧均具备单独的代码实现和具体的数据说明，尤其适合新手和希望在R语言中提升数据处理能力的专业人士。此代码库不仅可以直接使用，也便于在实际项目中参考和灵活调整。掌握这些数据清洗技巧后，能够显著提高数据准备的效率和质量，从而更专注于数据分析和模型开发，创造更

2024-10-26

基于机器学习的高血压预测模型构建与评估

在模型构建过程中，我们首先模拟了1000个患者的医学数据，包括年龄、性别、体重指数（BMI）、胆固醇水平和高血压标签。这些数据通过电子病历、实验室检查和患者自我监测等途径收集，以确保数据的质量和丰富性。接着，数据经过清理和标准化处理，去除了缺失值并对BMI和胆固醇进行了标准化，使其适合机器学习模型的输入要求。特征选择是模型构建的关键步骤。通过选择与高血压相关的变量（如年龄、性别、BMI和胆固醇），并将高血压标签作为目标变量，我们构建了用于训练和测试的完整数据集。随后，利用随机森林算法进行模型训练。随机森林是一种集成学习方法，能够有效处理高维数据并防止过拟合。通过设置树的数量（ntree=100），模型的稳定性和准确性得到了有效保障。在模型训练完成后，我们使用测试集对模型进行了验证。通过计算ROC曲线和AUC值，我们评估了模型的预测能力。ROC曲线提供了模型在不同阈值下的敏感性和特异性，AUC值则是衡量模型整体表现的关键指标。通过绘制ROC曲线，我们直观地展示了模型的效果，并通过AUC值评估了其准确性。

2024-10-25

如何通过R代码设置RStudio全局环境

在使用RStudio进行数据分析和编程时，配置好合适的工作环境能够极大地提升工作效率和代码的可读性。本文将介绍如何通过R代码来设置RStudio的全局选项，以帮助用户自定义和优化工作流。我们将重点讲解如何使用options()函数来调整R的默认行为，包括防止字符串自动转化为因子、设置输出数字的有效位数、控制警告信息的显示频率、以及调整输出宽度等。此外，还会介绍如何通过setwd()函数设置工作目录，以便在文件读取和写入操作时更加高效。文章还将展示如何禁用科学计数法输出，并通过Sys.setenv()函数更改消息提示语言，使输出信息更符合用户的需求。通过这些设置，用户可以根据自身需求构建一个符合个人偏好的编程环境，避免许多初学者常见的问题，如数据类型转换的困惑和不必要的警告信息干扰。最后，通过savehistory()命令，用户可以记录并保存自己的历史命令，方便后续工作复用。这些代码不仅适用于初学者，还能为经验丰富的用户提供优化RStudio环境的方案。

2024-10-23

R语言版本检查与扩展包自动更新示例

首先，使用R.version.string可以轻松获取当前R的版本信息。通过简单的代码，我们可以输出当前版本，确保我们正在使用的是最新的稳定版本。检查R的版本不仅有助于避免与包不兼容的问题，还能确保我们利用到最新的特性和修复的bug。接下来，更新扩展包的过程也很简单。R语言提供了内置的update.packages()函数，可以快速更新所有已安装的扩展包。通过该函数，我们可以确保我们使用的包都是最新的，从而最大限度地提高代码的效率和稳定性。在更新的过程中，我们可以选择是否需要用户确认，使用ask=FALSE选项则可以在后台静默更新，这对于批量处理任务特别有用。在我们的示例代码中，我们首先定义了一个update_packages函数，该函数获取所有已安装包的列表，并调用update.packages()函数进行更新。在更新完成后，我们通过cat()函数输出一条消息，告知用户所有包已成功更新。这种方法非常适合那些需要定期维护和更新R环境的用户。

2024-10-21

用R利用逻辑回归模型预测慢性肺炎的患者风险

利用逻辑回归模型预测慢性肺炎的患者风险.R

2024-10-19

用R语言贪心算法解决旅行商问题的模拟演示

旅行商问题（Traveling Salesman Problem, TSP）是一个经典的组合优化问题，广泛应用于物流、运输、集成电路设计等领域。问题的核心是：给定一组城市，旅行商需要从一个城市出发，经过每一个城市一次，最终回到起点，要求总行程最短。由于该问题的复杂性，尤其是当城市数量增加时，问题规模和可能解的数量会呈指数级增长，因此找到最优解非常困难。解决TSP问题的算法有很多，包括动态规划、分支定界法、遗传算法、模拟退火算法等，其中贪心算法作为一种启发式方法，因其易于实现且计算速度快，在许多情况下成为有效的初步解决方案。在本文中，我们将使用R语言，通过模拟随机生成的城市坐标，并利用贪心算法（Greedy Algorithm）求解TSP问题。具体来说，我们首先生成10个城市的随机坐标，并构建这些城市间的欧几里得距离矩阵。接下来，我们使用TSP包将距离矩阵转换为旅行商问题的标准格式。最后，应用贪心算法求解，得到一条近似的最短路径。贪心算法的思想是从某一城市出发，每次选择距离最近且未访问过的城市，直到所有城市都被访问一遍并回到起点。

2024-10-17

用R演示药物对糖尿病患者血糖影响的方差分析及可视化

首先，我们生成30名患者的数据，每种药物（药物A、B、C）各10名患者。假设药物A具有最佳效果，能显著降低血糖（平均下降20单位），药物B的效果较好（平均下降10单位），而药物C的效果最差（平均下降5单位）。通过使用rnorm()函数生成符合正态分布的随机数据，模拟每种药物对血糖变化的影响。接着，将患者编号、药物名称和血糖变化量整合到一个数据框中，以便于后续分析。使用单因素方差分析（ANOVA），我们可以检验不同药物组之间是否存在显著差异。通过调用aov()函数，我们构建一个线性模型，并使用summary()函数查看分析结果。结果中，F值和对应的p值（Pr(>F)）能够揭示药物对血糖变化的影响是否显著。如果p值小于0.05，说明药物组之间存在统计学上的显著差异。当ANOVA结果显示显著差异时，我们进一步进行Tukey事后检验，以比较各药物组之间的具体差异。通过调用TukeyHSD()函数，我们可以获得各组之间的均值差异、置信区间及p值。如果某两种药物之间的p值小于0.05，则表示这两组的差异显著。结果表明，药物A与药物B、C的效果差异显著，而药物B与药物C的效果也存在显著差异。

2024-10-17

基于卵巢癌数据的治疗和年龄组生存曲线分析

首先，代码通过 library(survival) 加载了生存分析相关的核心包，并使用 library(survminer) 进行可视化，确保绘制出的生存曲线具有良好的图形表现力。接着，代码利用 survfit() 函数分别按治疗方案（rx）和年龄组（age_group）拟合了两个生存模型。通过拟合后的模型，分别绘制了两组生存曲线。生存曲线展示了不同治疗方案和年龄组的患者生存概率的变化趋势，并在图中通过 pval = TRUE 参数显示了 Log-rank 检验的 p 值，以测试组间生存差异是否具有统计学意义。此外，生存曲线图还展示了置信区间（conf.int = TRUE）和风险表（risk.table = TRUE），为图表增加了更多的参考信息。为进一步优化图形效果，代码应用了 ggtheme = theme_light() 设置轻量的 ggplot2 样式主题。最终，使用 arrange_ggsurvplots() 函数将两幅生存曲线图并排排列，提供对比效果。治疗方案的生存曲线标题为 "Survival by Treatment"，而年龄组的生存曲线标题为 "Survival b

2024-10-14

使用R语言和ggplot2基于iris数据集绘制常见科研图表

本代码示例展示了如何使用R语言中的ggplot2包，基于经典的iris数据集绘制常见的科研图表。iris数据集包含三种鸢尾花的测量数据，包括花萼和花瓣的长度和宽度，用于多类数据的可视化分析。通过绘制散点图、箱线图和密度图等图表，研究者可以更直观地观察数据之间的关系及其分布特点。首先，利用散点图展示了花瓣长度和宽度的关系，通过不同种类的花朵进行颜色区分，能够明显看出三类鸢尾花的分布趋势。接着，箱线图用于比较不同花种的花萼长度，展示数据的集中趋势和离群点，有助于分析各类花种在生长特征上的差异。最后，密度图则展示了花瓣长度的分布形态，通过叠加不同花种的密度曲线，便于识别每类鸢尾花的分布范围及其重叠部分。除了单独展示这些图表，代码还展示了如何使用gridExtra包将多个图表进行组合展示，使得研究者可以更好地比较不同维度的数据特征。同时，通过ggsave()函数，研究者可以方便地将生成的图表保存为文件，用于报告或论文的展示。

2024-10-12

基于主成分分析的临床高血压患者数据分析与可视化

本研究旨在利用主成分分析（PCA）对临床高血压患者的数据进行降维与可视化。通过采集1000名受试者的20项临床数据，包括种族、年龄、身高、体重、血压（收缩压和舒张压）、心率、血糖、血脂等指标，旨在探究这些变量之间的关系以及其在高血压人群中的差异。高血压是一种常见的慢性病，与心血管疾病密切相关。了解患者的各种临床特征对于疾病的诊断与治疗至关重要。 PCA是一种常用的降维技术，能够将高维数据投射到低维空间，从而简化数据的复杂性。通过将不同变量进行标准化处理并进行PCA，可以发现某些临床特征对患者健康状态的影响更加显著。本研究首先将数据进行标准化处理，确保各临床指标具有相似的尺度，然后进行PCA以提取主要成分，分析变量之间的相关性。在结果可视化中，利用散点图展示前两个主成分，分析哪些临床指标对高血压患者的影响最为显著。同时通过方差解释率图来判断主成分的贡献度，从而决定最重要的主成分数量。这种可视化的分析可以为高血压患者的临床分型、病情评估以及个性化治疗提供支持。

2024-10-05

用R语言创建基于逻辑回归的高血压预测模型（准确率达到82%）

本代码实现了一个基于逻辑回归的高血压预测模型，利用R语言生成5000名样本的模拟数据，通过多个健康指标来预测个体是否患有高血压。数据集包括20个特征，如年龄、身高、体重、血压、心率、胆固醇等，这些变量能够提供与高血压相关的全面健康信息。首先，使用R语言中的rnorm函数生成随机数据，并设置合理的均值和标准差，以接近真实的分布。接着，通过收缩压和舒张压的阈值来生成目标变量Hypertension，即当收缩压超过140或舒张压超过90时，标记为高血压。接下来，对数据进行了预处理，将类别变量Race（种族）进行one-hot编码处理，以便逻辑回归模型能够处理这些特征。同时，我们将数据集划分为训练集和测试集，80%用于训练，20%用于测试，确保模型具有良好的泛化能力。使用逻辑回归模型对数据进行拟合，并使用测试集对模型进行评估，最终计算得出模型的准确率为82%。混淆矩阵显示了预测的高血压病例和实际值之间的对比，反映了模型在分类任务中的表现。

2024-10-05

用Python的基于逻辑回归的高血压预测模型.py

首先，使用Python的numpy库生成数据，特征的分布通过正态分布模拟，以模拟现实生活中的健康指标。目标变量Hypertension基于收缩压和舒张压的值生成，当收缩压超过140或舒张压超过90时，标记为高血压。这样生成的标签用于监督学习任务中的分类目标。数据预处理包括将类别变量Race（种族）进行one-hot编码，转换为模型可以使用的数值特征。然后，将数据集分割为训练集和测试集，80%的数据用于训练，20%的数据用于测试。通过scikit-learn库的train_test_split函数完成数据集的划分。使用逻辑回归模型进行训练，逻辑回归是一种常用的线性模型，适用于二元分类问题。模型拟合后，我们在测试集上进行预测，得到预测结果。最后，使用准确率和分类报告对模型进行评估。在5000个样本上，该模型的测试准确率达到了84%，表明模型对高血压的预测有较好的表现。虽然该模型使用的是模拟数据，但它展示了如何使用逻辑回归来预测高血压，并验证了年龄、体重、血压等变量对高血压的预测能力。未来，如果能够使用真实的临床数据，这样的模型可以帮助识别高血压高风险人群，为临床干预提供参考依据。

2024-10-05

基于R语言的主成分分析：模拟数据生成与可视化

主成分分析（Principal Component Analysis, PCA）是一种常用的数据降维方法，能够将高维数据转换为低维表示，帮助研究者发现数据的主要结构和模式。本文基于R语言，演示如何创建包含20个属性和1000个样本的模拟数据集，并通过PCA对数据进行分析和可视化。我们首先使用正态分布生成属性数据，随后通过PCA找出解释数据方差的主要成分，分析其特征和贡献度。主成分分析中，我们展示了前两个主成分的散点图，以帮助直观地了解数据在低维空间中的分布。同时，我们绘制了累计方差解释率图，明确每个主成分对整体数据方差的贡献。此外，还使用双图（biplot）展示了样本和变量的关系，进一步帮助理解各变量在主成分空间中的作用。这种可视化有助于判断哪些主成分对数据结构贡献最大，以及如何根据这些主成分简化数据分析。使用PCA的关键在于找到适当数量的主成分，使得在降低维度的同时最大程度保留原始数据的信息。本文为PCA的实践应用提供了详细的示例，适合初学者学习和理解PCA在数据科学中的应用。

2024-10-05

空空如也

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