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总 RNA 的提取(Trizol 法提取)
在收集到生物材料之后,最好能即刻进行 RNA 制备工作。若需暂时储存,
则应以液氮将生物材料急速冷冻后,储存于-80℃冷冻柜。在制备 RNA 时,将储
存于冷冻柜的材料取出,立即以加入液氮研磨的方式打破细胞,不可以先行解冻,
以避免 RNase 的作用。
1. 提取组织 RNA 时,每 50~100mg 组织用 1ml Trizol 试剂对组织进行裂解;
提取细胞 RNA 时,先离心沉淀细胞,每 5-10 ╳10
6
个细胞加 1ml Trizol 后,反
复用枪吹打或剧烈振荡以裂解细胞;版权文档,请勿用做商业用途
2. 将上述组织或细胞的 Trizol 裂解液转入 EP 管中,在室温 15~30C 下放置 5 分
钟;
3. 在上述 EP 管中,按照每 1ml TRIZOL 加 0.2ml 氯仿的量加入氯仿,盖上 EP
管盖子,在手中用力震荡 15 秒,在室温下(15℃~30℃)放置 2~3 分钟后,
12000g(2℃~8℃)离心 15 分钟;版权文档,请勿用做商业用途
4. 取上层水相置于新 EP 管中,按照每 1ml TRIZOL 加 0.5ml 异丙醇的量加入异
丙醇,在室温下(15℃~30℃)放置 10 分钟,12000g(2℃~8℃)离心 10 分
钟;版权文档,请勿用做商业用途
5. 弃上清,按照每 1ml TRIZOL 加 1ml 75%乙醇进行洗涤,涡旋混合,7500g
(2℃~8℃)离心 5 分钟,弃上清;版权文档,请勿用做商业用途
6. 让沉淀的 RNA 在室温下自然干燥;
7. 用 Rnase-free water 溶解 RNA 沉淀。
PCR
实验室常用 DNA 聚合酶有三种:TaKaRa Taq
TM
,TaKaRa E
X
Taq
TM
和
Pyrobest
TM
DNA Polymerase。TaKaRa Taq
TM
是一般的 DNA 聚合酶,保真性较差,
但价钱便宜,一般用于基因表达的检测等。TaKaRa E
X
Taq
TM
是具有 Proof reading
活性的耐热性 DNA 聚合酶,具有一定的保真性,而且其扩增得到的 PCR 产物
3’端附有一个“A”碱基,如果希望直接将产物克隆到 T-vector 可以用此酶。
Pyrobest
TM
DNA Polymerase 也是具有 Proof reading 活性的耐热性 DNA 聚合酶,
其特点是保真性极高,扩增得到的 PCR 产物为平滑末端。如果进行基因的扩增
请使用此酶。版权文档,请勿用做商业用途
1. 按下列组成在 PCR 反应管中调制反应液:
TaKaRa Taq
TM
或 TaKaRa E
X
Taq
TM
的配方

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Reagent
Quantity, for 50µl of reaction mixture
10X PCR buffer (Mg
2+
free)
5 µl
如 TaKaRa Taq
TM
加 3 µl
MgCl
2
(25mM)
如 TaKaRa E
X
Taq
TM
加 4 µl
2.5mM dNTP mix
4 µl
10µM Primer 上游
1 µl
10µM Primer 下游
1 µl
Template DNA
1 µl
Taq 或 E
X
TaqDNA Polymerase
0.25 µl
Sterile deionized water
Up to 50µl
Total
50 µl /Sample
Pyrobest
TM
DNA Polymerase 的配方
Reagent
Quantity, for 50µl of reaction mixture
10X Pyrobest buffer
5µl
2.5mM dNTP mix
4µl
10µM Primer 上游
1µl
10µM Primer 下游
1µl
Template DNA
1µl
Pyrobest
TM
DNA Polymerase
0.25µl
Sterile deionized water
Up to 50µl
Total
50µl /Sample

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① 反应总体积根据实际情况进行调控,可以做 20~50µl 以节约试剂;
② 将上表各成分加入到 0.2ml 或 0.5ml 灭菌的 PCR 薄壁管中;
③ 如果不用 PCR 仪的加热盖,在反应混合液的上层加 30 ~50µl 的矿物油
防止样品在 PCR 的过程中蒸发;版权文档,请勿用做商业用途
2. 按以下程序进行 PCR 扩增。
PCR 反应条件视模板、引物等的结构条件不同而各异,在实际操作中需根
据具体的情况以及 PCR 结果而进行优化。版权文档,请勿用做商业用途
Step
Temperature,
°C
Time, min
Number of
cycles
Note
起始变
性
94~95
1-3
1
变性
94~95
0.5-2
退火
37-70
0.5-2
退火温度比理论退火
温度大概低 5°C,再
根据反应结果优化
延伸
70-75
根 据 扩 增 产 物
的大小
25-35
每分钟延伸 1000bp
最终延
伸
70-75
10
1
反应结束后,抽取扩增样品 5µl,用琼脂糖凝胶电泳分析扩增结果,用
DNA marker 判断扩增片段的大小或冷冻保存,以备以后分析使用。版权文档,

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RT-PCR
Protocol: TaKaRa One Step RNA PCR Kit (AMV)
1. 按下列组成在 PCR 反应管中调制反应液
Reagent
Quantity, for 50µl
of reaction mixture
10×One Step RNA PCR Buffer
5µl
25 mM MgCl
2
10µl
10 mM dNTP mix
5µl
RNase Inhibitor (40 U/µl)
1µl
AMV-Optimized Taq
1µl
AMV RTase XL (5 U/µl)
1µl
上游特异 Primer (20 µM)
1µl
下游特异 Primer (20 µM)
1µl
实验样品 RNA(≤1 µg Total RNA)
1µl
RNase Free dH
2
O
24µl
Total
50µl /Sample
1. 反应总体积根据实际情况进行调控,可以做 20~50µl 以节约试剂;
2. 将上表各成分加入到 0.2ml 或 0.5ml 灭菌的 PCR 薄壁管中;
3. 如果不用 PCR 仪的加热盖,在反应混合液的上层加 30 ~50µl 的矿物油防
止样品在 PCR 的过程中蒸发;版权文档,请勿用做商业用途
2.按以下条件进行反应

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Step
Temperature,
°C
Time, min
Number
of cycles
Note
逆转录
50
30
1
逆转录
酶失活
94
2
1
变性
94
0.5
退火
37-65
0.5
退火温度比理论退火温
度大概低 5°C,再根据
反应结果优化
延伸
72
根据扩增产
物的大小
25-35
Taq 酶 每 分 钟 延 伸
1000bp
最终延
伸
72
10
1
反应结束后,抽取扩增样品 5µl,用琼脂糖凝胶电泳分析扩增结果,用 DNA
marker 判断扩增片段的大小或冷冻保存,以备以后分析使用。版权文档,请勿用做商业
用途
琼脂糖核酸电泳
1. 用蒸馏水将制胶模具和梳子冲洗干净,放在制胶平板上,封闭模具边缘,架
好梳子;
2. 根据欲分离 DNA 片段大小用凝胶缓冲液配制适宜浓度的琼脂糖凝胶:准确
称量琼脂糖干粉,加入到配胶用的三角烧瓶内,定量加入电泳缓冲液(一般
20~30 ml);版权文档,请勿用做商业用途
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