云计算-中药方剂桃仁红花煎的计算药理学研究.pdf

桃仁红花煎是传统中医方剂，源自《素庵医案》，主要用于治疗心血管疾病。该方由桃仁、红花、当归、香附、延胡索、赤芍、川芎、丹参、青皮和生地黄这十种草药组成。尽管临床实践表明该方具有良好的疗效，但其药理作用尚未得到充分研究。 本文通过运用云计算技术和计算机辅助药物设计（CADD）方法，对桃仁红花煎进行了深入的药理学研究。作者收集并分析了方剂中672种化合物的化学描述符，这些描述符提供了化合物的基本结构信息，如分子量、极性、氢键接受/捐赠能力等。通过主成分分析，将这些化合物与112种已知的心血管疾病药物/类药分子在化学空间中进行比较，以寻找相似性或差异性，这有助于理解桃仁红花煎的药效可能来源。 接下来，研究采用了分子对接技术进行虚拟筛选。将672个化合物与29种与心血管疾病相关的蛋白质靶标（共47个结合位点）进行对接打分。高分化合物被认为更可能具有生物活性。通过构建小分子-蛋白质网络图，根据Degree和Betweenness值筛选出15种具有较高活性的成分。其中11种分子已知具有抗氧化和抗炎等生理活性，这些特性与心血管疾病的治疗密切相关。 对筛选出的15种小分子中的9个分子进行了精细对接，使用AutoDock软件进一步研究它们与靶标蛋白的结合模式。这一步骤不仅验证了虚拟筛选的准确性，还揭示了桃仁红花煎在分子水平上作用于心血管疾病的具体机制。 这篇研究通过云计算和计算药理学方法，揭示了桃仁红花煎中化合物与心血管疾病相关靶标之间的相互作用，为中药现代化和中药方剂的药理研究提供了新的视角。这种计算方法的应用有助于筛选出潜在的活性成分，进而阐释中药治疗心血管疾病的作用机制，为未来药物开发提供了科学依据。