c代码转换成matlab文件格式-alphafold_pytorch:基于PyTorch进行研究的DeepMind的AlphaF...

c代码转换成matlab文件格式AlphaFold-PyTorch 该项目提供了基于PyTorch进行研究的DeepMind的AlphaFold的实现，还包括转换后的模型权重和输入。 请注意，此代码也可以在原始.ckpt格式模型权重和.tfrec格式输入上.tfrec 。 DeepMind的原始实现基于TensorFlow，相关的出版物为Senior，AW，Evans，R.，Jumper，J。等人。 利用深度学习的潜力改进了蛋白质结构的预测。 自然577，706–710（2020） 。 比较 我计算了PyTorch版本和原始TensorFlow版本之间最终输出distogram probs的差异。 分布图distogram probs是通过组合覆盖整个距离图（大小为LxLx64这种预测而构建的距离分布预测的完整集合。 以目标T1019s2为例，这两个结果之间的分布图概率（ 88x88x64 ）的误差为每通道0.467 。 上图是T1019s2的结果。 尽管速度比TensorFlow版本慢7倍左右，但我仍然为您推荐该项目，因为我重构了整个代码，并为您提供了一种最简单的方式来了解Alpha