genomeGTFtools:将各种功能转换为类似GFF的文件，以便在基因组浏览器中使用

基因组GTF工具 概述 这些是一些脚本，用于将各种功能和注释转换为类似GFF的文件，以供基因组浏览器使用。 还有用于基因组注释的通用工具。 GFF（通用特征格式）是一种格式，用于注释基因组，由8个明确定义的列和第9个自由文本列（包含一些“准则”）组成。 固定GFF的大多数工作都涉及固定最后一列。 尽管这不是一个很好的格式，但是由于某种原因或其他原因而不够用。 最终，最好是某些字段是显式的，例如ID（机器可理解的唯一标识符，可以是登录号，等等），Parent（任何其他ID）和Name（例如基因名称）。 这还将允许按ID，Parent或Name进行快速索引或排序，这也将使其更易于图形的。 柱子 名称 描述 1个 顺序 序列ID，通常是重叠群，支架或染色体（例如ctg0123 ， scaffold_99 ， chrX ），而不是基因或特征的名称（在第9列中列出） 2个 来源 通常是生成数据