gamma-dde:Stan脚本，用于将ODE模型拟合到流行病和病毒动力学数据

伽马 Stan脚本，用于将ODE模型拟合到流行病和病毒动力学数据。 该方法在预印本中有描述 T. Cassidy，P。Gillich，AR Humphries和CH van Dorp， γ分布延迟微分方程的数值方法和次指数逼近。 待办事项：添加链接 要求 要使用Stan模型，需要Stan 2.4或更高版本。 有关安装详细信息，请参见。 要获取最新版本斯坦，安装cmdstan的instad rstan或pystan 。 可以使用pip安装python的cmdstan界面 $ pip install cmdstanpy 并且可以从python自动安装cmdstan import cmdstanpy cmdstanpy . install_cmdstan () 要使用笔记本，需要 。 斯坦模型 文件夹stan-models包含示例SIR模型。 固定的和平滑的次指数逼近都可以实现。 笔记本电