GEOparse:用于访问基因表达综合数据库（GEO）的Python库

GEOparse 用于访问基因表达综合数据库（GEO）的Python库。 GEOparse是python软件包，可用于从Gene Expression Omnibus数据库（GEO）查询和检索数据。 它的灵感和基础是伟大的R库GEOquery。 免费软件：BSD许可证 文档： : 。 特征 将GEO系列，数据集等下载为SOFT文件 下载GEO系列的补充文件以在本地使用 将GEO SOFT加载为易于使用和操作的对象 准备要上传的数据 安装 在命令行中： $ pip install GEOparse 去做 仍有工作要做，因此欢迎任何贡献。 您报告的任何错误/错误都会改善库。 主要问题是： 添加检查与SOFT文件的兼容性 扩展具有有用功能的GEOTypes对象，以进行差异表达分析 分享你的想法 添加更多测试-这始终是个好主意:)