gb_taxonomy_tools:GenBank分类法处理工具

使用CMake安装 建造，使用 cmake ./ make install （默认情况下进入/ usr / local） 将GID转换为TaxID 这是四个简单的实用程序，它们对GenBank分类信息执行以下操作和可视化任务。 gid-taxid ：将GenBank ID和相关计数的列表转换为三元组的列表：genbank ID，分类法ID，计数。 它需要访问由GenBank ftp://ftp.ncbi.nih.gov/pub/taxonomy/gi_taxid_nucl.dmp.gz维护的（很大）映射文件，这些映射表是制表gid taxid count制表符分隔列表，例如输入行160338813 160输出为160338813 436308 160 尝试将其作为$gid-taxid tests/data/test.gid path/to/gi_taxid_nucl.dmp 结果