workflows-nextflow:使用Nextflow和nf-core进行工作流管理

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workflows-nextflow-gh-pages.zip （76个子文件）

workflows-nextflow-gh-pages

.travis.yml 2KB

bin

repo_check.py 5KB

run-make-docker-serve.sh 135B

workshop_check.py 14KB

lesson_check.py 19KB

markdown_ast.rb 237B

util.py 5KB

boilerplate

.travis.yml 2KB

CITATION 40B

_extras

figures.md 3KB

discuss.md 56B

about.md 75B

guide.md 64B

_config.yml 3KB

CONTRIBUTING.md 7KB

_episodes

01-introduction.md 239B

AUTHORS 47B

setup.md 52B

README.md 2KB

index.md 383B

reference.md 70B

test_lesson_check.py 503B

knit_lessons.sh 225B

dependencies.R 1KB

install_r_deps.sh 132B

chunk-options.R 2KB

generate_md_episodes.R 1KB

lesson_initialize.py 1KB

CITATION 273B

data

.gitkeep 0B

.github

FUNDING.yml 109B

PULL_REQUEST_TEMPLATE.md 878B

ISSUE_TEMPLATE.md 975B

workflows

template.yml 4KB

_extras

figures.md 3KB

discuss.md 56B

about.md 75B

guide.md 2KB

.gitkeep 0B

_config.yml 3KB

CONTRIBUTING.md 7KB

Gemfile 244B

_episodes

07-configuration.md 9KB

06-DSL2.md 14KB

05-groovy.md 10KB

08-nfcore.md 28KB

04-operators.md 7KB

01-getting-started-with-nextflow.md 20KB

02-channels.md 12KB

.gitkeep 0B

03-processes.md 20KB

aio.md 292B

code

.gitkeep 0B

AUTHORS 151B

LICENSE.md 3KB

.gitignore 177B

Makefile 5KB

setup.md 4KB

CODE_OF_CONDUCT.md 330B

README.md 2KB

files

.gitkeep 0B

fig

channel-process.png 44KB

dataflow.png 41KB

sarek_workflow.png 149KB

channel-map.png 11KB

executor.png 150KB

channel-process_fqc.png 173KB

channel-files.png 9KB

flowchart.png 38KB

.gitkeep 0B

channel-process_fastqc.jpg 57KB

.editorconfig 364B

index.md 2KB

_episodes_rmd

data

.gitkeep 0B

reference.md 293B

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内容反馈

被要求改名字

2023-07-28

文件中给出了一些实用的技巧和建议，能够帮助读者避免一些常见的问题。
简甜XIU09161027

2023-07-28

这篇文件对于学习使用Nextflow和nf-core进行工作流管理确实有很大帮助。
shashashalalala

2023-07-28

文中提到的实际案例很有助于读者理解如何应用Nextflow和nf-core来提高工作效率。
韩金虎

2023-07-28

作者对于工作流管理的解释很清晰，容易理解，即使是初学者也能够轻松上手。
透明流动虚无

2023-07-28

文件内容比较详尽，能够让读者对工作流管理有一个全面的了解。

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