序列比对

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序列比对

: 序列比对-Needleman-Wunsch Smith-Waterman algorthm(java) 序列比对-Needleman-Wunsch Smith-Waterman 算法（java） 序列比对是基因学的一个主要主题，它涉及到比较 DNA 序列并尝试找出两个序列的公共部分。如果两个 DNA 序列有类似的公共子序列，那么这些两个序列很可能是...
评级：4 浏览量：421 收藏量：0 资源大小：105KB 上传时间：2009-03-04

: 生物序列比对 生物信息学的研究重点主要体现在基因组学和蛋白质学两方面,具体地说就是从核酸和蛋白质序列出发, 分析序列中表达结构和功能的生物信息。...生物信息学中的序列比对算法的研究具有非常重要的理论意义和实践意义。
评级：0 浏览量：692 收藏量：0 资源大小：3.45MB 上传时间：2018-04-26

: 详解基于python的全局与局部序列比对的实现(DNA) 在生物信息学中，序列比对是分析DNA、RNA或蛋白质序列的重要方法，它用于寻找序列之间的相似性和差异性。本篇文章将详细讲解如何使用Python实现全局与局部序列比对，特别是针对DNA序列的比对。首先，我们要明确...
评级：0 浏览量：1979 收藏量：1 资源大小：475KB 上传时间：2020-12-16

: 生物信息序列比对算法生物信息学的研究重点主要体现在基因组学和蛋白质学两方面,具体地说就是从核酸和蛋白质序列出发, 分析序列中表达结构和功能的生物信息。...生物信息学中的序列比对算法的研究具有非常重要的理论意义和实践意义。
评级：0 浏览量：1046 收藏量：2 资源大小：1.97MB 上传时间：2018-04-27

: genedoc(多重序列比对编辑器).rar 《genedoc——多功能序列比对编辑器深度解析》在分子生物学的研究中，多重序列比对是一项至关重要的任务，它能帮助科学家们揭示不同生物物种间的遗传相似性，理解基因功能，推断进化关系。genedoc作为一款专业的...
评级：0 浏览量：1675 收藏量：0 资源大小：2.5MB 上传时间：2021-04-27

: js DNA动态序列比对代码动态序列比对是一种生物信息学中的重要算法，用于比较两个生物序列（如DNA、RNA或蛋白质序列）的相似性。这种比对可以帮助科学家们识别基因、寻找进化关系以及理解基因功能。JavaScript是一种广泛使用的编程语言，它...
评级：0 浏览量：235 收藏量：1 资源大小：29KB 上传时间：2020-10-29

: BioXM 2.6 序列比对 BioXM 2.6是一款专为生物信息学领域设计的高级软件，主要用于序列比对和多基因序列分析。在生命科学研究中，序列比对是一项基础且至关重要的任务，它涉及DNA、RNA或蛋白质序列的比较，以揭示生物体间的遗传相似性、...
评级：4 浏览量：690 收藏量：2 资源大小：3.52MB 上传时间：2014-10-20

: 【多序列比对】应用动态规划、A*算法、遗传算法分别解决MSA问题在IT领域，多序列比对（Multiple Sequence Alignment, MSA）是生物信息学中的一个重要问题，它涉及到将多个生物序列，如DNA、RNA或蛋白质序列，进行排列和比较，以揭示它们之间的同源性和进化关系。本项目针对这一...
评级：0 浏览量：773 收藏量：2 资源大小：24KB 上传时间：2022-02-25

: 这是一款专门用于序列比对的软件。由于其序列比对显示的结果非常清楚，很多文献中的序列比对结果正是通过... DNAman是美国LynnonBiosoft公司开发的高度集成化的分子生物学应用软件，几乎可完成所有日常核酸和蛋白质序列分析工作，包括多重序列比对、PCR引物设计、限制性酶切分析、蛋白质分析、质粒绘图等。DNAMAN的速度，多...
评级：0 浏览量：339 收藏量：1 资源大小：2.75MB 上传时间：2022-05-04

: clustalx 核酸序列比对程序这是多重序列比对程序的Windows版本。Clustal X为进行多重序列和轮廓比对和分析结果提供一个整体的环境。序列将显示屏幕的窗口中。采用多色彩的模式可以在比对中加亮保守区的特征。窗口上面的下拉菜单可让你选择...
评级：0 浏览量：1376 收藏量：0 资源大小：4.34MB 上传时间：2020-08-18

: 具有任意步骤的序列比对：确定两个序列之间允许的“步骤”的最佳比对-matlab开发 1 1]（以及适当的相似性函数），该算法与经典的 Needleman-Wunsch 序列比对过程相同。这可以等效地用于计算两个序列之间的广义编辑距离。该实现基于： Steffen Eger，具有任意步骤和进一步概括的序列比对，...
评级：0 浏览量：263 收藏量：0 资源大小：2KB 上传时间：2021-05-30

: sequencher DNA序列比对分析软件 Sequencher是一款专业的DNA序列比对分析软件，它在生物信息学领域中扮演着重要角色，主要用于处理和解析DNA序列数据。这款软件的核心功能是将不同来源的DNA序列进行比对，帮助科研人员理解基因组结构、检测变异、...
评级：4 浏览量：1341 收藏量：5 资源大小：14.86MB 上传时间：2014-06-28

: lastz:DNA序列比对程序，成对比对器 LASTZ-成对DNA序列比对器该存储库包含LASTZ的最新官方工作分支。正式发行带有标签，可以在找到。鼓励用户使用带标签的发行版，因为此工作分支可能不稳定。在撰写本文时，最新的正式版本是1.04.03版。可以在 ...
评级：0 浏览量：1870 收藏量：0 资源大小：5.21MB 上传时间：2021-05-06

: exonerate:序列比对的通用工具 Slater等人（序列序列比对的通用工具）exonerate的延续。（）。无罪显然没有得到维持。此fork的目标主要是对最终版本（2.4.0）的错误修复。要签出/构建最终（稳定）版本： $ git clone ...
评级：0 浏览量：628 收藏量：0 资源大小：557KB 上传时间：2021-05-26

: parasail:成对序列比对库 parasail：成对序列比对库特拉维斯（Travis）： AppVeyor：作者：Jeff Daily（）目录替代矩阵SSW库仿真功能查询带状全球结盟文件输入回溯语言绑定C / C ++ Python 锈JavaWindows版本应用范例引用滑翔伞许可：...
评级：0 浏览量：184 收藏量：0 资源大小：3.74MB 上传时间：2021-04-30

: 序列比对现状 NULL 博文链接：https://bachelor007.iteye.com/blog/549638
评级：0 浏览量：94 收藏量：0 资源大小：508KB 上传时间：2019-05-27

: 序列比对软件 序列比对是生物信息学中的一个关键步骤，用于比较和分析DNA、RNA或蛋白质序列，以揭示遗传相似性、进化关系或功能区域。在这种背景下，"序列比对软件"是专门设计来执行这一任务的工具，它们可以帮助研究人员高效地...
评级：5 浏览量：555 收藏量：0 资源大小：1.69MB 上传时间：2014-08-19

: DNASequenceAlignment:DNA 序列比对、学习错配、匹配和缺口。它只适用于相同长度的两个 dna 序列 DNA序列比对是生物信息学中的一个重要概念，它涉及到基因组研究、进化分析以及疾病诊断等多个领域。在比对过程中，我们通常会遇到匹配、错配、缺口等关键概念。匹配是指两个DNA序列中对应位置上的碱基相同，例如，...
评级：0 浏览量：285 收藏量：0 资源大小：38KB 上传时间：2021-06-18

: BioAlignments.jl:序列比对工具 BioAlignments.jl提供了序列比对算法和数据结构。安装您可以在从Julia REPL安装BioAlignments.jl ： pkg> add BioAlignments 如果您对开发的前沿感兴趣，请在发布前检查以尝试新功能。测验已在Linux，OS X和...
评级：0 浏览量：144 收藏量：0 资源大小：77KB 上传时间：2021-05-06

: 生物序列比对的理论与应用本书《多重生物序列比对：评分函数、算法及其应用》深入探讨了生物信息学中的核心问题——多重生物序列比对。书中不仅介绍了序列比对的基本概念和原理，还详细讲解了评分函数、算法的设计与实现，并讨论了其在基因组...
评级：0 浏览量：9 收藏量：0 资源大小：5.7MB 上传时间：2025-08-04

: 分子生物学 序列比对 引物设计软件 DNAMAN 9 英文注册版分子生物学引物设计软件 DNAMAN 9 英文...************************************************** ... 2. 复制DNAMAN.exe 复制到安装目录下（默认目录为C:\Program Files (x86)\DNAMAN\），替换同名文件即可； 3. Enjoy！
评级：0 浏览量：951 收藏量：0 资源大小：15.57MB 上传时间：2022-06-13

: 基于Hadoop基因序列比对BWT索引方法用于识别不同物种的同源性和变异性的基因序列比对是生物信息学的重要组成部分。创建索引是基因序列比对算法的关键步骤。通常的创建索引的算法分为两种。第一种是基于哈希表的算法，另一种是基于后缀树或后缀数组...
评级：0 浏览量：296 收藏量：2 资源大小：1.75MB 上传时间：2021-04-30

: 安德鲁：成对序列比对 安德鲁该程序旨在对CDR3字符串执行多个成对序列分析。该程序是使用python编程语言设计的。输出包括树状图和代表CDR3序列的序列比对的值。该程序的输入是清理后的数据文件“ all.tsv”。
评级：0 浏览量：122 收藏量：0 资源大小：1.6MB 上传时间：2021-02-12

: 生物序列比对：原理、算法与应用本书《多重生物序列比对：评分函数、算法及应用》深入探讨了生物信息学中多序列比对的核心技术和最新进展。全书分为多个章节，涵盖了从基础知识到高级应用的广泛内容。首先介绍了生物序列的基本概念，包括蛋白质、...
评级：0 浏览量：10 收藏量：0 资源大小：5.7MB 上传时间：2025-07-21

: 多序列比对 应用lastz等工具进行多序列比对，可以看看哦
评级：0 浏览量：469 收藏量：1 资源大小：1.31MB 上传时间：2013-10-14

: 序列比对基础与BLAST入门打分矩阵.pdf 序列比对基础与BLAST入门打分矩阵.pdf序列比对基础与BLAST入门打分矩阵.pdf序列比对基础与BLAST入门打分矩阵.pdf序列比对基础与BLAST入门打分矩阵.pdf序列比对基础与BLAST入门打分矩阵.pdf
评级：0 浏览量：291 收藏量：2 资源大小：9.07MB 上传时间：2022-05-19

: 基于GPU的BWA序列比对算法分析与加速.pdf "基于GPU的BWA序列比对算法分析与加速" 本文讨论了基于GPU的BWA序列比对算法的分析和加速。BWA-MEM算法是当前最流行的序列比对算法之一，但是在GPU平台上的加速仍然存在一些限制。为了解决这个问题，本文提出了基于...
评级：5 浏览量：265 收藏量：0 资源大小：7.51MB 上传时间：2021-09-25

: flex:使用多个序列比对工具的共识序列管道 [m5 mapping output from blasr] [start index] [end index] [output file name]示例： python3 find_mapped_reads.py reads.fa mapping.m5 100 5100 reads_100_5100.fa flex.py 从多序列比对输出创建一致序列。...
评级：0 浏览量：165 收藏量：0 资源大小：4KB 上传时间：2021-07-07

: 基于动态规划的序列比对的并行算法研究 (2011年) 针对序列比对算法进行了深入地研究,分析比较了两序列和多序列、局部和全局、渐进和迭代的序列比对算法.利用动态规划序列比对算法内在的并行性,提出了自适应的动态规划序列比对的并行策略.该策略在计算初期和计算末期...
评级：0 浏览量：207 收藏量：1 资源大小：378KB 上传时间：2021-04-22

: 自适应蚁群算法在序列比对中的应用.zip 该文将蚁群算法应用于序列比对，并提出基于自适应调整信息素的改进算法。仿真结果表明这种新的比对算法是有效的，而它的改进算法的效果更为理想。关键词：蚁群算法；序列比对 ；信息素在序列比对中的应用
评级：0 浏览量：266 收藏量：1 资源大小：182KB 上传时间：2020-04-01

: alignTools.C:序列比对（C）的实现 alignTools是用于逐对DNA序列比对的C实现工具的集合。它包括以下对齐功能：整体一致性局部语言适合对齐（跳跃状态）重叠对齐编辑距离不久的将来将添加更多功能。版本 0.7.23-r15 开始使用安装 $ git ...
评级：0 浏览量：159 收藏量：0 资源大小：145KB 上传时间：2021-05-19

: 生物信息学-第四章-序列比对与算法.ppt 生物信息学是应用信息技术处理和分析生物数据的学科，其中序列比对是其基础操作之一，用于发现序列之间的相似性和差异性。序列比对的过程包括将两个或多个生物序列排列起来以获得最大一致性，其主要目的是为了揭示...
评级：0 浏览量：21 收藏量：0 资源大小：7.2MB 上传时间：2025-07-22

: alignfigR:在R中创建序列比对图形对齐图利用， alignfigR可以创建彩色的序列比对图形表示。 alignfigR将为您提供一个ggplot对象，您可以根据需要进一步自定义该对象。可从CRAN下载！要获取最新和最佳版本，请使用devtools安装： library( devtools...
评级：0 浏览量：111 收藏量：0 资源大小：46KB 上传时间：2021-04-29

: (源码)基于C++的短序列比对工具.zip # 基于C++的短序列比对工具 ## 项目简介本项目是一个基于C++的短序列比对工具，名为ShortReadMapping（SRM）。该工具旨在将短序列与参考基因组进行比对，返回比对的序列、位置和比对得分。主要应用于生物信息学中...
评级：0 浏览量：27 收藏量：0 资源大小：631KB 上传时间：2025-03-23

: (源码)基于Python的序列比对系统.zip # 基于Python的序列比对系统 ## 项目简介本项目是基于Python的序列比对系统，核心采用Minimap2这一多功能序列比对程序。Minimap2可将DNA或mRNA序列与大型参考数据库进行比对，在生物信息学领域具有广泛应用，例如...
评级：0 浏览量：24 收藏量：0 资源大小：221KB 上传时间：2025-06-09

: blast序列比对软件v2.2.25.rar Blast v2.2.25是一款本地序列对比软件，能够在不接入互联网的环境下，将待比对的序列与本地数据库中的序列进行比对，主要用于核酸和蛋白等序列对比。使用方法，解压后再使用。它包含以下应用程序：bl2seq....
评级：0 浏览量：1050 收藏量：1 资源大小：18.09MB 上传时间：2019-09-02

: Pontos:Pontos根据DNA序列比对计算距离矩阵。-开源 Pontos是一种易于使用的图形Java程序，用于根据PHYLIP格式的DNA序列比对计算未校正的距离（或相似性）矩阵。它还会与常规对齐方式产生“差异”对齐（反之亦然）。它可以以不同的方式处理差距和歧义。缺口可以是：...
评级：0 浏览量：192 收藏量：0 资源大小：37KB 上传时间：2021-04-29

: MEGA6.06序列比对进化树分析软件.rar 软件介绍: MEGA6.06是分子生物学中应用研究中很基础的一个免费转件，安装后可支持fasta、txt的序列文件格式；主要功能是对核酸、蛋白质的序列比对、序列分析和进化树作图等分析计算；
评级：4 浏览量：2548 收藏量：1 资源大小：37.38MB 上传时间：2019-09-03

: 双序列比对的基础（2）之替换（计分）矩阵系列双序列比对的基础（2）之替换（计分）矩阵系列主要以BLOSUM矩阵与PAM矩阵的介绍为主。声明：该部分书中内容介绍有点少，所以我上网搜索到几篇文献和和国外大学的相关课件（从一个研究生博主处获得）。那本篇...
评级：0 浏览量：589 收藏量：0 资源大小：106KB 上传时间：2021-01-07

: CPU和GPU协同并行加速多生物序列比对 CPU和GPU协同并行加速多生物序列比对
评级：0 浏览量：116 收藏量：0 资源大小：743KB 上传时间：2021-02-07

: 基于Kotlin/Java语言的核酸/蛋白质序列比对工具设计源码在生物信息学领域，核酸和蛋白质序列比对是基础而核心的研究方法，它能够帮助科研工作者分析不同生物样本之间的序列差异和进化关系。该项目的源码基于Kotlin和Java语言开发，融合了当前编程语言的高效与现代生物信息...
评级：0 浏览量：322 收藏量：0 资源大小：577KB 上传时间：2024-10-11

: edlib：轻量级，超快速CC ++（＆Python）库，用于使用编辑（Levenshtein）距离进行序列比对 Edlib· 一个轻量级且超快速的C / C ++库，用于使用进行序列比对。计算两个字符串的编辑距离很简单： edlibAlign ( " hello " , 5 , " world! " , 6 , edlibDefaultAlignConfig()).editDistance; Edlib也可用于...
评级：0 浏览量：430 收藏量：0 资源大小：4.16MB 上传时间：2021-02-02

: biostructmap:用于将序列比对数据映射到蛋白质结构的Python软件包 Biostructmap是一个Python工具，用于将序列比对的数据（例如多态性的位置）映射到蛋白质结构上。此外，生物结构图允许将残基的空间邻近性纳入滑动窗口计算中，并可用于将蛋白质结构信息纳入选择压力的遗传测试中。...
评级：0 浏览量：155 收藏量：0 资源大小：1.08MB 上传时间：2021-05-25

: 两序列比对算法与软件研究进展 ### 两序列比对算法与软件研究进展 #### 引言随着基因测序技术的飞速发展，大量的基因序列数据被不断积累，这为科学家们提供了前所未有的机会去探索生命的奥秘。在这个过程中，序列比对技术成为了连接基因序列与...
评级：0 浏览量：184 收藏量：0 资源大小：304KB 上传时间：2021-03-06

: 基于Spark云计算及混沌遗传的基因序列比对研究与实现.docx 在当前生物信息学领域的快速发展背景下，基因序列比对作为研究进化关系、蛋白质结构预测和药物设计等生物信息学研究的基础性工作，对于解读生物遗传密码的重要性不言而喻。然而，面对海量的生物序列数据，传统的序列...
评级：0 浏览量：14 收藏量：0 资源大小：18KB 上传时间：2025-08-17

: alignment:用于执行（多个）序列比对的简单Python库（多个）序列比对 例子 from alignment import multi_sequence_alignment sequences = [ 'the quick fox jumps over the dog' . split (), 'the brown fox jumps over the lazy dog' . split (), 'the clever fox...
评级：0 浏览量：556 收藏量：0 资源大小：7KB 上传时间：2021-05-11

: linnaeo：用于查看，分析和生成蛋白质序列比对的图保守性或与参考序列相同的颜色导出这些路线以供其他喜欢的路线查看器使用当前可用的一些功能：将序列或比对作为FASTA文件导入直接从UNIPROT中搜索序列并将其下载到您的工作区中。在水平滚动的序列视图或动态调整...
评级：0 浏览量：478 收藏量：0 资源大小：1.29MB 上传时间：2021-02-16

: 2025年基因组序列比对分析及相关软件的使用精.doc 随着基因组学研究的不断深入，基因组序列比对分析成为生物学研究和医学诊断中的重要工具。基因组序列比对是指将两个或多个DNA、RNA序列进行系统比较，以识别其相似性和差异性。这种分析对于揭示物种间的亲缘关系、...
评级：0 浏览量：23 收藏量：0 资源大小：2.37MB 上传时间：2025-05-13

: 基因序列比对 在IT领域，基因序列比对是一项重要的生物信息学任务，它涉及到计算机科学和生物学的交叉。这个任务的主要目的是比较两个或多个DNA、RNA或蛋白质序列，寻找它们之间的相似性和差异性，这对于理解生物进化、疾病研究...
评级：5 浏览量：787 收藏量：1 资源大小：140KB 上传时间：2014-01-19

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