Filogenia Molecular
Es el estudio de la evolución y
desarrollo de las especies. La
comparación de secuencias de algunas
macromoléculas, es la forma mas
precisa y confiable para inferir en las
relaciones filogenéticas.
Clasificación de Organismos
Estos estudios podemos hacerlos
estudiando la secuencia total de
nucleótidos del genoma del
microorganismo, pero actualmente se
utilizan los estudios del rRNA 16S o
18S, porque son secuencias que se han
mantenido bastante uniformes a lo
largo de la evolución, y por eso se ven
claramente las diferencias entre los
distintos
microorganismos-.
Bacterias Rojas Fototroficas
Bacterias capaces de producir energía
atreves de la fotosíntesis.
Son organismos anaerobios o microaerófilos
y se encuentran principalmente en
manantiales sulfurosos o en agua estancada.
Se dividen en dos familias,
Chromatiaceae y Ectothiorhodospiracea
e
Bacterias Nitrificantes
Bacterias que consumen amoniaco,
como su única y exclusiva fuente de
energía, y producen nitritos mediante la
oxidación del oxigeno. Son bacterias
bastante grandes, entre 0.4 y 0.6 micras,
"Gram-negativas", autótrofas.
La temperatura óptima para su
crecimiento ronda entre 25º y 30º C y el
rango óptimo de pH está entre 7.8 y
8.0. Se dividen en dos Nitrosomonas y
Nitrobacter.
Bacterias Oxidantes del Azufre y
del Hierro
Son bacterias Gram negativas en forma de
Bacilo y donadoras de Electrones H2O, So y
S2O3
-
Se encuentra en la naturaleza en habita ricos
en H2S, tales como manantiales
sulfurosos, depósitos de algas en
descomposición, capas de lodos y en aguas
residuales.
Existen tres géneros:
 Thiobacillus: Es termófila y prefiere
temperaturas de 45-50 grados
centígrados, es acidófilo, prefiriendo un
pH de 1,5 a 2,5.
 Archomatium:
 Beggiaton: Son organismos
filamentosos, deslizantes, forman largas
cadenas de células bacilares unidas
extremo con extremo.
Bacterias Oxidantes del
Hidrogeno
Se conocen bacteria oxidantes de hidrogeno tanto
Gram – como Gra +
Todas la bacterias del hidrogeno contiene dos o mas
hidrogenasas que funciona uniendo hidrogeno y lo
usan para producir ATP
Son quimiotroficos facultativos
Existen dos generos:
 Rastolnia:
 Alcaligenes:
METOFILOS
 Obtienen carbono y energía del metabolismo
de compuestos de C1.
 Procarióticos:
o metanótrofos
o metilótrofos.
METANOTROFOS
Crecen a expensas del CH4.
algunos usan metanol, formaldehído o dimetil eter.
 Gram negativos
 Aerobios
 Bacilos unicelulares, vibrios, cocos
 Móviles por flagelos polares
 Poseen un sistema de enzimas específico; la
metanooxigenasa
 Forman un complejo sistema de membranas internas cuando
crecen en metano
PRINCIPALES GENEROS
 Methylomonas(bacilos
rectos, curvados o
ramificados con un
único flagelo polar)
 Methylococcus (células
esféricas e inmóviles).
metilomona metánica
HABITAT
 Ambientes acuáticos
terrestres
 Fuentes estables de
metano
 Termoclina de lagos y
embalses
 Prefieren habitat
microaerofílicos
METILOTROFOS
 Crecen a expensas de uno o varios componentes
utilizados típicamente por los metófilos, pero, NO
USAN METANO.
 Pueden ser Gram + o Gram -
 Ninguno produce cistes ni esporas, como los
metanotrofos
 No poseen sistemas complejos de membranas como
los Metanótrofos.
Pseudomonas
Bacilos rectos o ligeramente curvados,
Gramnegativos, oxidasa positivos, aeróbi
cos estrictos aunque en algunos casos
pueden utilizar el nitrato como aceptor
de electrones.
Las cepas del
género Pseudomonas son capaces de
procesar, integrar y reaccionar a una
amplia variedad de condiciones
cambiantes en el medio ambiente, y
muestran una alta capacidad de
reacción a señales físico-químicas y
biológicas.
Acetobacteria
Bacilos Gram negativos, móviles
y aeróbicos, que realizan una oxidación
incompleta de alcoholes, produciendo
una acumulación de ácidos orgánicos
como productos finales.
Una propiedad de este tipo de
microorganismos es su alta tolerancia a
la acidez, la mayoría de las cepas
pueden crecer a pH inferiores a 5.
Bacterias Aeróbicas de Vida
Libre Fijadoras de Nitrógeno
Azotobacter
• Fija nitrógeno aeróbicamente
• Tamaño de 2-4 micras, forma oval o bacilar.
• Colonias de aspecto mucoso(cápsula
polisacárida).
• Alta tasa de respiración.
• Forma quistes, aunque su tasa metabólica
no se reduce a cero.
• A. chrococcum, tiene una nitrogenasa con
cofactor vanadio-hierro, en vez de
molibdeno-hierro.
Neisseria
Grupo de bacterias Gram-negativas.
Forma
de diplococos, inmóviles, catalasa y
oxidasa positivos. El tamaño es de 1µ
de diámetro y son aerobios estrictos.
Chromobacterium
Bacterias Gram-negativas , anaerobias
facultativas, no
sporing cocobacilo . Forma parte de la
flora normal del agua y el suelo de las
regiones tropicales y subtropicales del
mundo.
Aquifex
Este género de bacterias acuáticas es
capaz de soportar temperaturas
cercanas al punto de ebullición del
agua.
Existen dos especies
A. pyrophilus y A. aeolicus.
El rango de temperaturas óptimas para su
crecimiento está entre los 85 y 95 grados
centígrados.
Se pueden encontrar en las cercanías de
volcanes submarinos o en fuentes
hidrotermales.
Tiene forma de bacilo con una longitud
de 2 a 6 µm y un diámetro de alrededor
0,5 µm. Son autótrofos Gram-
negativos y no forman esporas.
Thermodesulfobacteria
Bacterias reductoras de
sulfato termófilas. Según la clasificación
actual podemos encontrar dos géneros
dentro de este filo de bacterias,
Thermodesulfobacterium y Thermodesulf
atator.
Su hábitat de Thermodesulfobacterium
generalmente es acuático.
Se pueden aislar en chimeneas
volcánicas calientes, en fuentes
hidrotermales de alta mar, y otros
ambientes marítimos
Thermotoga
Son termófilos o hipertermófilos.
Metabolizan carbohidratos.
Las distintas especies tienen distintas
tolerancias a la sal y al oxígeno.
Es anaerobio y reduce cistina
y tiosulfato a sulfuro de hidrógeno
Thermotoga maritima (verde / amarillo barras) Que Crece en
co-Cultivo con Methanococcus jannaschii (Esferas rojas). T.
maritima fermenta los azúcares en Hidrógeno y M. jannaschii
convierte el metano en Hidrógeno. (Crédito: North Carolina
State University)
Bacterias Verdes Chloroflexi
obtienen energía mediante fotosíntesis
son aerobias facultativas, pero no
producen oxígeno durante la
fotosíntesis.
Algunas especies son termófilas.
Deinococci
Bacterias Gram positivas altamente
resistentes a los cambios en el medio
ambiente.
Hay dos grupos principales.
Deinococcales y Thermales.
Deinococcales
Son resistentes a la radiación: tienen la
capacidad para comer la basura
nuclear y otros materiales tóxicos, por
sobrevivir en el vacío del espacio y
soportar el calor y frío extremos.
Thermales
Son resistentes al calor.
Tienen membranas celulares
gruesas Gram-positivas, pero incluyen
una segunda membrana y así están
más próximas en estructura a las
bacterias Gram-negativas.
Espiroquetas
Bacterias Gram-negativas que tienen
células alargadas y enrolladas.
Casi todas son unicelulares.
Poseen una membrana externa
formada por múltiples capas llamada
"envoltura celular" o "vaina externa" que
rodea completamente el cilindro
protoplasmático.
Se distingue de los demás filos
bacterianos por la presencia de unos
flagelos especializados denominados
filamentos axiales situados entre la
envoltura celular externa y el cilindro
protoplasmático
Bacterias Verdes Chlorobi
Bacterias que realizan
la fotosíntesis anoxigénica.
Son fotolitoautótrofas
Se encuentran en las zonas ricas
en azufre y anaerobias de los lagos.
Son de diversas morfológicamente y se
pueden presentar
como bacilos, cocos y vibrios.
Algunas crecen solas, otras en cadenas y
pueden ser de color verde grama o
marrón chocolate.
Flavobacterias
Bacterias medioambientales que
incluye un
único orden, Flavobacteriales.
Comprende tres familias:
Flavobacteriaceae (15 géneros),
Myroidaceae (2 géneros) y
Blattabacteriaceae (un género).
Defferibacter
El género comprende 4 especies
 D. abyssi
 D. autotrophicus
 D. desulfuricans
 D. thermophilus
Cytophaga
Bacterias Gram-negativas, en forma de
bastoncillos, capaz de moverse por sus
propios medios.
Algunas de las especies:
 Cytophaga columnaris
 Cytophaga johnsonae
 Cytophaga psychrophila

Dominio Bacteria

  • 2.
    Filogenia Molecular Es elestudio de la evolución y desarrollo de las especies. La comparación de secuencias de algunas macromoléculas, es la forma mas precisa y confiable para inferir en las relaciones filogenéticas.
  • 3.
    Clasificación de Organismos Estosestudios podemos hacerlos estudiando la secuencia total de nucleótidos del genoma del microorganismo, pero actualmente se utilizan los estudios del rRNA 16S o 18S, porque son secuencias que se han mantenido bastante uniformes a lo largo de la evolución, y por eso se ven claramente las diferencias entre los distintos microorganismos-.
  • 5.
    Bacterias Rojas Fototroficas Bacteriascapaces de producir energía atreves de la fotosíntesis. Son organismos anaerobios o microaerófilos y se encuentran principalmente en manantiales sulfurosos o en agua estancada.
  • 6.
    Se dividen endos familias, Chromatiaceae y Ectothiorhodospiracea e
  • 7.
    Bacterias Nitrificantes Bacterias queconsumen amoniaco, como su única y exclusiva fuente de energía, y producen nitritos mediante la oxidación del oxigeno. Son bacterias bastante grandes, entre 0.4 y 0.6 micras, "Gram-negativas", autótrofas.
  • 8.
    La temperatura óptimapara su crecimiento ronda entre 25º y 30º C y el rango óptimo de pH está entre 7.8 y 8.0. Se dividen en dos Nitrosomonas y Nitrobacter.
  • 9.
    Bacterias Oxidantes delAzufre y del Hierro Son bacterias Gram negativas en forma de Bacilo y donadoras de Electrones H2O, So y S2O3 - Se encuentra en la naturaleza en habita ricos en H2S, tales como manantiales sulfurosos, depósitos de algas en descomposición, capas de lodos y en aguas residuales.
  • 10.
    Existen tres géneros: Thiobacillus: Es termófila y prefiere temperaturas de 45-50 grados centígrados, es acidófilo, prefiriendo un pH de 1,5 a 2,5.  Archomatium:  Beggiaton: Son organismos filamentosos, deslizantes, forman largas cadenas de células bacilares unidas extremo con extremo.
  • 11.
    Bacterias Oxidantes del Hidrogeno Seconocen bacteria oxidantes de hidrogeno tanto Gram – como Gra + Todas la bacterias del hidrogeno contiene dos o mas hidrogenasas que funciona uniendo hidrogeno y lo usan para producir ATP Son quimiotroficos facultativos Existen dos generos:  Rastolnia:  Alcaligenes:
  • 12.
    METOFILOS  Obtienen carbonoy energía del metabolismo de compuestos de C1.  Procarióticos: o metanótrofos o metilótrofos.
  • 13.
    METANOTROFOS Crecen a expensasdel CH4. algunos usan metanol, formaldehído o dimetil eter.  Gram negativos  Aerobios  Bacilos unicelulares, vibrios, cocos  Móviles por flagelos polares  Poseen un sistema de enzimas específico; la metanooxigenasa  Forman un complejo sistema de membranas internas cuando crecen en metano
  • 14.
    PRINCIPALES GENEROS  Methylomonas(bacilos rectos,curvados o ramificados con un único flagelo polar)  Methylococcus (células esféricas e inmóviles). metilomona metánica
  • 15.
    HABITAT  Ambientes acuáticos terrestres Fuentes estables de metano  Termoclina de lagos y embalses  Prefieren habitat microaerofílicos
  • 16.
    METILOTROFOS  Crecen aexpensas de uno o varios componentes utilizados típicamente por los metófilos, pero, NO USAN METANO.  Pueden ser Gram + o Gram -  Ninguno produce cistes ni esporas, como los metanotrofos  No poseen sistemas complejos de membranas como los Metanótrofos.
  • 17.
    Pseudomonas Bacilos rectos oligeramente curvados, Gramnegativos, oxidasa positivos, aeróbi cos estrictos aunque en algunos casos pueden utilizar el nitrato como aceptor de electrones.
  • 18.
    Las cepas del géneroPseudomonas son capaces de procesar, integrar y reaccionar a una amplia variedad de condiciones cambiantes en el medio ambiente, y muestran una alta capacidad de reacción a señales físico-químicas y biológicas.
  • 19.
    Acetobacteria Bacilos Gram negativos,móviles y aeróbicos, que realizan una oxidación incompleta de alcoholes, produciendo una acumulación de ácidos orgánicos como productos finales.
  • 20.
    Una propiedad deeste tipo de microorganismos es su alta tolerancia a la acidez, la mayoría de las cepas pueden crecer a pH inferiores a 5.
  • 21.
    Bacterias Aeróbicas deVida Libre Fijadoras de Nitrógeno Azotobacter • Fija nitrógeno aeróbicamente • Tamaño de 2-4 micras, forma oval o bacilar. • Colonias de aspecto mucoso(cápsula polisacárida). • Alta tasa de respiración. • Forma quistes, aunque su tasa metabólica no se reduce a cero. • A. chrococcum, tiene una nitrogenasa con cofactor vanadio-hierro, en vez de molibdeno-hierro.
  • 23.
    Neisseria Grupo de bacteriasGram-negativas. Forma de diplococos, inmóviles, catalasa y oxidasa positivos. El tamaño es de 1µ de diámetro y son aerobios estrictos.
  • 24.
    Chromobacterium Bacterias Gram-negativas ,anaerobias facultativas, no sporing cocobacilo . Forma parte de la flora normal del agua y el suelo de las regiones tropicales y subtropicales del mundo.
  • 25.
    Aquifex Este género debacterias acuáticas es capaz de soportar temperaturas cercanas al punto de ebullición del agua. Existen dos especies A. pyrophilus y A. aeolicus.
  • 26.
    El rango detemperaturas óptimas para su crecimiento está entre los 85 y 95 grados centígrados. Se pueden encontrar en las cercanías de volcanes submarinos o en fuentes hidrotermales.
  • 27.
    Tiene forma debacilo con una longitud de 2 a 6 µm y un diámetro de alrededor 0,5 µm. Son autótrofos Gram- negativos y no forman esporas.
  • 28.
    Thermodesulfobacteria Bacterias reductoras de sulfatotermófilas. Según la clasificación actual podemos encontrar dos géneros dentro de este filo de bacterias, Thermodesulfobacterium y Thermodesulf atator.
  • 29.
    Su hábitat deThermodesulfobacterium generalmente es acuático. Se pueden aislar en chimeneas volcánicas calientes, en fuentes hidrotermales de alta mar, y otros ambientes marítimos
  • 30.
    Thermotoga Son termófilos ohipertermófilos. Metabolizan carbohidratos. Las distintas especies tienen distintas tolerancias a la sal y al oxígeno.
  • 31.
    Es anaerobio yreduce cistina y tiosulfato a sulfuro de hidrógeno Thermotoga maritima (verde / amarillo barras) Que Crece en co-Cultivo con Methanococcus jannaschii (Esferas rojas). T. maritima fermenta los azúcares en Hidrógeno y M. jannaschii convierte el metano en Hidrógeno. (Crédito: North Carolina State University)
  • 32.
    Bacterias Verdes Chloroflexi obtienenenergía mediante fotosíntesis son aerobias facultativas, pero no producen oxígeno durante la fotosíntesis. Algunas especies son termófilas.
  • 33.
    Deinococci Bacterias Gram positivasaltamente resistentes a los cambios en el medio ambiente. Hay dos grupos principales. Deinococcales y Thermales.
  • 34.
    Deinococcales Son resistentes ala radiación: tienen la capacidad para comer la basura nuclear y otros materiales tóxicos, por sobrevivir en el vacío del espacio y soportar el calor y frío extremos.
  • 35.
    Thermales Son resistentes alcalor. Tienen membranas celulares gruesas Gram-positivas, pero incluyen una segunda membrana y así están más próximas en estructura a las bacterias Gram-negativas.
  • 36.
    Espiroquetas Bacterias Gram-negativas quetienen células alargadas y enrolladas. Casi todas son unicelulares. Poseen una membrana externa formada por múltiples capas llamada "envoltura celular" o "vaina externa" que rodea completamente el cilindro protoplasmático.
  • 37.
    Se distingue delos demás filos bacterianos por la presencia de unos flagelos especializados denominados filamentos axiales situados entre la envoltura celular externa y el cilindro protoplasmático
  • 38.
    Bacterias Verdes Chlorobi Bacteriasque realizan la fotosíntesis anoxigénica. Son fotolitoautótrofas
  • 39.
    Se encuentran enlas zonas ricas en azufre y anaerobias de los lagos. Son de diversas morfológicamente y se pueden presentar como bacilos, cocos y vibrios. Algunas crecen solas, otras en cadenas y pueden ser de color verde grama o marrón chocolate.
  • 40.
    Flavobacterias Bacterias medioambientales que incluyeun único orden, Flavobacteriales. Comprende tres familias: Flavobacteriaceae (15 géneros), Myroidaceae (2 géneros) y Blattabacteriaceae (un género).
  • 41.
    Defferibacter El género comprende4 especies  D. abyssi  D. autotrophicus  D. desulfuricans  D. thermophilus
  • 42.
    Cytophaga Bacterias Gram-negativas, enforma de bastoncillos, capaz de moverse por sus propios medios. Algunas de las especies:  Cytophaga columnaris  Cytophaga johnsonae  Cytophaga psychrophila