ガールフレンド・毛利蘭の父・小五郎の探偵事務所に居候しながら、謎の組織の行方を追うコナン。 世間の目を欺くために、小学校に通いつつ、迷探偵・毛利小五郎を陰で助ける小さな名探偵・コナンの推理が冴える！！

父親のようなプロ野球選手になることを夢見て、日夜トレーニングに励む５歳の野球少年・吾郎！！ 友達の寿也君とリトルリーグに挑戦！？

ホームズばりの推理力で、大活躍の高校生名探偵・工藤新一。 ところがある日、事件を追っていた彼は、妙な薬の力で、なんと子供に戻ってしまった…!? 仮の名を“江戸川コナン”。小さな名探偵が登場だ!!