宏基因组测序流程（不完全版）

所做工作

Step1.去除宿主污染

Step2.去除接头序列

Step3.对序列进⾏进⼀步质控

Step4.对read进⾏进⼀步拼接(contig)

Step5.对contig进⾏orf预测

Step6.查找orf区翻译出来的氨基酸序列对应的蛋⽩质家族

收获

• 基因组学基本知识
• 使用超算系统和在Linux下操作
• 下载和使用软件
• 理解各类常见数据格式的具体含义
• 学会使用在线网站

宏基因组分析流程

概述：宏基因组也称微生物环境基因组，定义为生境中全部微小生物遗传物质的总和。目前主要指环境样品中的细菌和真菌的基因组总和。宏基因组学就是一种以环境样品中的微生群物体基因组为研究对象, 以功能基因筛选和/或测序分析为研究手段, 以微生物多样性、 种群结构、 进化关系、 功能活性、 相互协作关系及与环境之间的关系为研究目的的新的微生物研究方法。

其具体流程大致如下图所示：

Step1.去除宿主污染