configure: error: The Fortran compiler gfortran will not compile files that call the same routine with arguments of different types.

<think>我们正在处理用户关于在配置编译WRF-Chem（或类似科学计算软件）时遇到的Fortran编译器(gfortran)兼容性错误。错误信息为： "configure: error: The Fortran compiler gfortran will not compile files that call the same routine with arguments of different types." 根据引用[1]，这个问题在安装mpich-3.0.4库时出现，并且用户已经尝试重装虚拟机多次未果。 ### 问题分析 这个错误通常是由于较新版本的gfortran编译器（特别是gcc 10及以上版本）引入了更严格的类型检查（称为“类型安全”要求）导致的。在旧版本的MPICH（如3.0.4）中，存在一些Fortran代码调用了同一个子程序（routine）但使用了不同类型的参数，这在新的编译器标准下是不允许的。 ### 解决方案 解决此问题有两种主要方法： #### 方法1：降级gfortran编译器版本 安装较低版本的gfortran（例如gcc-9或gcc-8），然后重新配置MPICH。 **步骤：** 1. 添加旧的GCC版本仓库（如果系统没有自带）： ```bash sudo apt-get install software-properties-common sudo add-apt-repository ppa:ubuntu-toolchain-r/test sudo apt update ``` 2. 安装gcc-9和gfortran-9： ```bash sudo apt install gcc-9 gfortran-9 ``` 3. 设置gcc-9和gfortran-9为默认编译器（使用`update-alternatives`）： ```bash sudo update-alternatives --install /usr/bin/gcc gcc /usr/bin/gcc-9 90 sudo update-alternatives --install /usr/bin/gfortran gfortran /usr/bin/gfortran-9 90 ``` 4. 重新运行MPICH的配置脚本。 #### 方法2：升级MPICH版本 升级到更高版本的MPICH（如3.3以上），这些版本已经修复了类型不匹配的问题。 **步骤：** 1. 卸载当前安装的MPICH（如果已安装）。 2. 从MPICH官网下载最新稳定版（例如3.4.3）： ```bash wget http://www.mpich.org/static/downloads/3.4.3/mpich-3.4.3.tar.gz tar -xvf mpich-3.4.3.tar.gz cd mpich-3.4.3 ``` 3. 配置、编译和安装： ```bash ./configure --prefix=$DIR/mpich # $DIR为自定义安装路径 make -j 8 make install ``` 4. 将MPICH的bin目录加入PATH环境变量（在~/.bashrc中添加）： ```bash export PATH=$DIR/mpich/bin:$PATH source ~/.bashrc ``` #### 方法3：在配置时禁用Fortran（不推荐） 如果不需要Fortran接口，可以在配置MPICH时禁用Fortran： ```bash ./configure --disable-fortran ``` 但WRF-Chem依赖Fortran，因此不推荐此方法。 ### 验证解决方案 安装完成后，执行以下命令验证MPI安装： ```bash mpiexec --version ``` ### 注意事项 - 如果选择降级gfortran，请注意系统其他软件可能依赖新版本的编译器。 - 确保在编译WRF-Chem时，环境变量（如`PATH`、`LD_LIBRARY_PATH`）正确指向新安装的MPICH。 ### 引用说明 根据引用[2]，WRF-Chem依赖于WRF模型，因此确保MPICH等基础库正确安装至关重要。另外，引用[4]提到WRF-Chem已不再继续开发，但用户仍可使用现有版本。 ### 相关问题 1. 如何检查当前系统中安装的gfortran版本？ 2. 升级MPICH后如何确保WRF-Chem使用新的MPI库？ 3. 在降级gfortran后，如何恢复使用系统默认的编译器版本？</think>### WRF-Chem 编译错误：Fortran 编译器类型不匹配问题解决方案 您在配置编译 WRFChem 时遇到的错误： ```bash configure: error: The Fortran compiler gfortran will not compile files that call the same routine with arguments of different types ``` 这是由较新版本的 gfortran（gcc 10+）引入的严格类型检查导致的，与 MPICH 库的兼容性问题有关[^1]。以下是系统性的解决方案： --- ### 方法一：降级 gfortran 编译器（推荐） #### 步骤： 1. **安装旧版 gfortran**： ```bash sudo apt-get install gcc-9 gfortran-9 # Ubuntu/Debian # 或 sudo yum install gcc9 gcc-gfortran9 # CentOS/RHEL ``` 2. **设置编译器别名**： ```bash sudo update-alternatives --install /usr/bin/gfortran gfortran /usr/bin/gfortran-9 90 sudo update-alternatives --config gfortran # 选择版本9 ``` 3. **验证版本**： ```bash gfortran --version # 应显示 9.x.x ``` 4. **重新配置 MPICH**： ```bash cd mpich-3.0.4 make distclean ./configure --prefix=$DIR/mpich make make install ``` --- ### 方法二：升级 MPICH 版本 ```bash wget https://www.mpich.org/static/downloads/4.1.2/mpich-4.1.2.tar.gz tar -xvf mpich-4.1.2.tar.gz cd mpich-4.1.2 ./configure --prefix=$DIR/mpich make -j 8 make install ``` --- ### 方法三：修改编译器标志（临时方案） 在配置时添加宽松类型检查标志： ```bash export FFLAGS="-fallow-argument-mismatch" export FCFLAGS="-fallow-argument-mismatch" ./configure --prefix=$DIR/mpich ``` > **注意**：此方法可能掩盖潜在的类型错误，仅作临时解决方案[^1]。 --- ### 验证 MPI 安装 ```bash # 检查编译器链接 which mpif90 # 应显示 $DIR/mpich/bin/mpif90 # 测试简单 MPI 程序 mpiexec --version ``` --- ### 关键注意事项 1. **环境一致性**： - 确保 `PATH` 和 `LD_LIBRARY_PATH` 优先指向自定义安装的 MPICH： ```bash export PATH=$DIR/mpich/bin:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=$DIR/mpich/lib:$LD_LIBRARY_PATH ``` 2. **WRF-Chem 依赖关系**： - MPICH 必须与 NetCDF 使用相同的 Fortran 编译器 - 重新编译所有依赖库（zlib, libpng, Jasper）： ```bash cd netcdf make distclean ./configure --prefix=$DIR/netcdf make install ``` 3. **编译器兼容性矩阵**： | WRF-Chem 版本 | 推荐 gfortran | 推荐 MPICH | |---------------|---------------|------------| | 4.x | 9.x | >4.0 | | 3.x | 8.x | 3.3.x | > 根据引用[2]，WRF-Chem 对底层依赖非常敏感，建议使用经过验证的编译器组合[^2]。 ---