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ubuntu安装qimme2

时间: 2023-10-20 19:22:07 浏览: 197

以下是在 Ubuntu 上安装 QIIME 2 的步骤： 1. 打开终端，更新 apt-get： ``` sudo apt-get update ``` 2. 安装 miniconda（如果已经安装了，请跳过此步骤）： ``` wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh ``` 3. 创建一个 Python 环境并激活： ``` conda create -n qiime2-2020.8 python=3.6 conda activate qiime2-2020.8 ``` 4. 添加 QIIME 2 的 conda 渠道： ``` conda config --add channels conda-forge conda config --add channels bioconda conda config --add channels qiime2/label/r2020.8 conda config --add channels qiime2/label/r2020.8 ``` 5. 安装 QIIME 2： ``` conda install qiime2 ``` 安装完成后，您可以使用 `qiime --help` 命令来验证是否已成功安装 QIIME 2。注意：QIIME 2 的版本可能会随时更新，请根据您需要的版本更改上述命令中的版本号。

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