Acelere a descoberta de medicamentos com o NVIDIA BioNeMo™ para biofarmacêutica, uma coleção de frameworks, aplicações, soluções de IA Generativa e modelos pré-treinados.
O BioNeMo é um framework de machine learning de código aberto para a criação e treinamento de modelos de deep learning para a indústria biofarmacêutica.
Ao acelerar os aspectos mais caros e prolongados do desenvolvimento de modelos de IA, os criadores de modelos de IA que fazem pesquisas biomoleculares com dados de DNA, RNA e proteínas podem acessar ferramentas para levar suas pesquisas a novos patamares.
A plataforma inclui receitas de treinamento selecionadas, carregadores de dados e arquiteturas de modelos de IA de exemplo pré-treinadas e otimizadas, específicas de domínio e aceleradas para o melhor desempenho, tornando a construção de modelos de IA mais rápida e simples.Os NVIDIA BioNeMo Blueprints são workflows de referência pré-treinados projetados para aplicações de IA generativa na descoberta de medicamentos, oferecendo às equipes de biofarmacêutica uma base para acelerar a pesquisa e a inovação.
Para empresas do setor biofarmacêutico que buscam integrar a IA, esses blueprints incluem código de referência, ferramentas e documentação abrangente para personalizar e implantar workflows adaptados a dados proprietários e pipelines terapêuticos exclusivos.
Esses volantes de dados resultantes melhoram o desempenho do modelo ao longo do tempo, impulsionando insights mais profundos e acelerando a descoberta. Os BioNeMo Blueprints permitem que a biofarmacêutica simplifique a inovação e utilize todo o potencial da IA no desenvolvimento de medicamentos.
O NVIDIA BioNeMo NIM™ inclui um conjunto de microsserviços de IA otimizados e fáceis de usar, criados para permitir a inferência em gigaescala e viabilizar novos recursos no design de medicamentos.
Criados para desenvolvedores de plataformas de descoberta computacional de medicamentos e cientistas de dados, os microsserviços NIM são construídos como contêineres com tudo o necessário para a implantação mais eficiente e portátil disponível para fácil integração de APIs em aplicações de IA de nível empresarial.
Os microsserviços NIM aumentam a eficiência e a inovação dos workflows de descoberta de medicamentos, diminuindo o custo total de propriedade e o tempo de chegada ao mercado para suas descobertas orientadas por IA.
As bibliotecas NVIDIA CUDA-X™ oferecem módulos de código prontos para uso que aceleram as camadas computacionais mais intensivas dentro dos modelos de IA biomolecular atuais, permitindo que os pesquisadores inovem mais rapidamente.
cuEquivariance é uma biblioteca NVIDIA Python projetada para facilitar a construção de redes neurais equivariantes de alto desempenho usando produtos tensores segmentados. O cuEquivariance agora também possui kernels otimizados para atenção triangular e multiplicação triangular para modelar interações em pares na predição de estruturas de proteínas (por exemplo, arquiteturas no estilo AlphaFold).
Com alterações de código de uma linha e integrações prontas para uso por meio de vinculações PyTorch e Jax, substituir as etapas mais caras do seu workflow por kernels otimizados para CUDA® está mais fácil do que nunca.
Veja como o cuEquivariance pode desbloquear novos níveis de desempenho em seus modelos de estrutura de proteínas, química generativa e dinâmica molecular.
Encontre uma coleção de documentos, guias, manuais, instruções e muito mais no Hub de Documentação do NVIDIA BioNeMo.
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O NVIDIA BioNeMo é uma plataforma de IA projetada para escalar o desenvolvimento e a implantação de IA nos campos da química e da biologia. Ele fornece aos pesquisadores e desenvolvedores de novos medicamentos uma maneira rápida e fácil de criar e integrar aplicações de IA generativa de última geração em todo o pipeline da descoberta de medicamentos, desde a identificação de alvos até a otimização dos compostos principais. A plataforma oferece workflows para previsão de estrutura 3D das proteínas, design de novo, triagem virtual, acoplamento e previsão de propriedades.
A BioNeMo é uma plataforma em evolução contínua para biologia digital, fornecendo acesso às bibliotecas aceleradas e modelos base mais recentes para IA generativa. Pesquisadores e desenvolvedores podem adotar e adaptar facilmente bibliotecas e modelos no BioNeMo Framework de código aberto e implantar rapidamente workflows acelerados com os microsserviços e blueprints BioNeMo NIM.
NVIDIA BioNeMo Framework: os usuários podem acessar o BioNeMo framework de duas maneiras. A oferta da NVIDIA para uso empresarial do BioNeMo com uma licença NVIDIA AI Enterprise fornece o contêiner do BioNeMo por meio do NVIDIA GPU Cloud, que proporciona aos desenvolvedores e pesquisadores empresariais uma cadeia de ferramentas segura e escalonável para criar workflows biomoleculares. A versão de código aberto do BioNeMo usada por pesquisadores e cientistas de dados está disponível para instalação no GitHub, incluindo todos os seus componentes.
Modelos pré-treinados: o BioNeMo framework oferece receitas BioNeMo que mostram exemplos de implementação de arquitetura compatível com o Transformer Engine e também permitem testes e ajuste fino. Os usuários são encorajados a estender suas próprias implementações usando as receitas do BioNeMo como tutoriais.
Os microsserviços BioNeMo NIM oferecem vários pontos de verificação otimizados, como Evo2 (IA generativa genômica), GenMol (geração de moléculas), DiffDock (docking) e outros, cada um apoiando suas respectivas tarefas biomoleculares.
Veja a lista mais recente de requisitos de sistema para o Framework BioNeMo na página de Contêineres do Catálogo NGC.
Veja os requisitos de sistema mais recentes para microsserviços NIM na Documentação de APIs da NVIDIA.
O código do BioNeMo framework é licenciado pelo Apache 2.0, enquanto os contêineres oficiais NGC são regidos pelo Contrato de Produtos de IA da NVIDIA (e podem ser cobertos por uma licença da NVIDIA AI Enterprise para uso comercial).
O NVIDIA BioNeMo expõe seus modelos por meio de bibliotecas, APIs e microsserviços NIM em contêineres, permitindo que as equipes chamem predição de estrutura, química generativa e outras funções diretamente de seus frameworks estabelecidos de descoberta de medicamentos.
Lance o contêiner BioNeMo Framework ou clone o repositório GitHub, aponte uma configuração do YAML para seus dados, adicione um restore_from_path (ou equivalente) para carregar pesos existentes e execute o script de treinamento fornecido para pré-treinar ou ajustar um modelo.
Como o BioNeMo Framework está hospedado abertamente no GitHub, os desenvolvedores podem criar um fork do repositório e enviar solicitações de acesso de acordo com as diretrizes "CONTRIBUTING" da documentação do repositório para adicionar novo código.
Entre em contato conosco com sua pergunta.
Além disso, os usuários podem acessar documentação, tutoriais e um fórum ativo de Desenvolvedor por meio do Hub de Recursos BioNeMo, enquanto os clientes empresariais podem abrir tickets de suporte por meio da IA da NVIDIA Enterprise.