Kurikulum MTs Swasta Meunafa terdiri atas komponen mata pelajaran, muatan lokal, dan pengembangan diri. Terdapat 10 mata pelajaran umum, 4 mata pelajaran agama, dan muatan lokal yang disesuaikan dengan potensi daerah. Struktur kurikulum meliputi substansi pembelajaran selama 3 tahun dengan alokasi jam pelajaran tertentu untuk setiap mata pelajaran.