Python GPU 加速数据科学 | 计算距离矩阵在用 cuPy 时快了约 100 倍

已于 2023-01-31 19:25:35 修改
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分类专栏： 数学建模/大数据分析与可视化 文章标签： Python 数据科学 距离矩阵计算 GPU 加速 CuPy
于 2023-01-31 18:32:58 首次发布
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本文链接：https://blog.csdn.net/fyfugoyfa/article/details/128817946
本文介绍了如何使用CuPy的cupyx.scipy.spatial.distance方法，通过GPU加速计算距离矩阵，相比scipy的方法在处理100维65000个样本的情况下速度提升了约100倍，且减少了内存消耗。文章详细阐述了环境配置、计算过程以及性能对比，展示了GPU在大规模数据处理中的优势。

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CSDN 叶庭云：https://yetingyun.blog.csdn.net/

一、环境配置

利用 cuPy 的 cupyx.scipy.spatial.distance 方法计算距离矩阵时，这个 distance 模块使用 pylibraft 作为后端，因此还需要安装好 pylibraft package 才行，可以直接从 Conda 安装，链接为：https://anaconda.org/rapidsai/pylibraft

也可以用 pip install 安装 pylibraft-cu11 和 cupy-cuda11x（注意：我

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